基于整合組學(xué)篩選肝細胞癌發(fā)生中增殖相關(guān)基因
發(fā)布時間:2020-09-08 13:47
肝細胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上最為常見的惡性腫瘤之一,肝癌的發(fā)病率和死亡率均居我國惡性腫瘤的前3位,其發(fā)病率和死亡率還在逐年上升。由于肝癌細胞具有較強的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力,因此大部分肝癌患者的預(yù)后不良。為能更好的了解肝癌發(fā)生發(fā)展的分子機制以及尋找治療的關(guān)鍵靶點,本研究基于GEO和TCGA兩個大型腫瘤基因組組學(xué)數(shù)據(jù)庫,利用生物信息學(xué)的方法構(gòu)建了包括650個樣本的基因組數(shù)據(jù)庫,在12416個共有基因的基礎(chǔ)上,逐步篩查出110個穩(wěn)定的差異表達基因;通過功能詮釋,發(fā)現(xiàn)了27個與增殖相關(guān)的重要差異表達基因;進一步的臨床數(shù)據(jù)整合分析得到了14個與預(yù)后相關(guān)的基因。本研究提示增殖相關(guān)的差異表達基因在肝細胞癌發(fā)生中起著重要的作用,而14個增殖相關(guān)的差異表達基因可能是潛在的治療靶點基因,對未來發(fā)展新的肝癌治療策略具有指導(dǎo)意義。
【學(xué)位單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:R735.7
本文編號:2814248
【學(xué)位單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:R735.7
【參考文獻】
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1 李向真;劉子朋;李娟;方慧生;;KEGG數(shù)據(jù)庫的進展及其在生物信息學(xué)中的應(yīng)用[J];藥物生物技術(shù);2012年06期
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本文編號:2814248
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