基于二代測序的急性髓系白血病突變譜及預后分層研究
[Abstract]:Acute myeloid leukemia (Acute Myeloid Leukemia,AML) is a class of heterogeneous diseases caused by complex interactions between different carcinogenic factors. Genomics studies have not only led to the discovery of the molecular pathogenesis of AML. Great diversity among subtypes was found. In recent years, several common gene mutations have been added to the NCCN guidelines to guide prognosis (NPM1,CEBPA,FLT3-ITD,TP53,KIT), but still not enough to delaminate the moderately endangered karyotype AML (Intermediate-risk AML,IR-AML), which accounts for more than 60% of the total. A combination of new genes and mutations needs to be incorporated to further delaminate. In addition, more than one mutation site is often associated with multiple gene mutations, and a single mutation or locus is no longer sufficient to guide the clinical prognosis. Therefore, the traditional generation sequencing can no longer meet the demand. It is urgent for new technical means to deepen the study of molecular mechanism of AML and to assist in multi-mutation joint analysis for clinical application. In this study, we used the second generation sequencing (Next Generation Sequencing,NGS) platform to study the mutations of 111 genes associated with malignant hematological diseases in 220 cases of AML, and discussed the guiding significance for phenotypic and prognostic stratification in combination with clinical analysis. Firstly, the Chinese-specific mutation frequency and spectrum of AML were obtained by filtering and validating the sequencing data. Then, the molecular mechanism of AML occurrence and the relationship between mutation and clinic were studied from two aspects. On the one hand, the relationship between mutations and clinical phenotype, efficacy and prognosis was analyzed by single mutation analysis, which confirmed the collaboration and mutual exclusion pattern, genotype and clinical phenotype (age, karyotype, age, karyotype) among different biological function mutations. The relationship between leukocyte count, immunophenotype, etc., as well as the effect of mutation on clinical efficacy (remission rate and survival time). On the other hand, it was confirmed that the mutation of NPM1,FLT3-ITD and DNMT3A were usually co-occurring by integrated mutagenesis analysis, and were associated with advanced age, high white blood cell count, morphology of myelomonocyte, unrelieved chemotherapy and poor prognosis. AML with NPM1,IDH1/2 mutation combined with FLT3-ITD negative was associated with lower number of newly diagnosed leukocytes and specific immunophenotypes and was sensitive to chemotherapy. In addition, according to three different mutation combinations: NPM1 or bi-CEBPA mutation with no other mutation, FLT3-ITD,DNMT3A,ASXL1,TET2,TP53 or PFH6 mutation with no CEBPA mutation, and other genotypes, the medium-risk AML was further classified as low, medium. The high-risk three different pre-treatment groups reduced the number of true moderate-risk AML patients by 1/3. In terms of molecular pathogenesis and biological characteristics of AML, this study has carried out in-depth analysis, and confirmed that the prognosis of intermediate-risk AML can be further stratified by different combinations of NGS-based mutations. It lays a foundation for the development of a new risk stratification system and the realization of individualized and accurate treatment for AML in the future.
【學位授予單位】:清華大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R733.71
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,本文編號:2469986
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