基于穩(wěn)定同位素標記和平行反應監(jiān)測的蛋白質(zhì)組學定量技術用于肝癌生物標志物的篩選和驗證
本文選題:蛋白質(zhì)組學 + 穩(wěn)定同位素標記 ; 參考:《色譜》2017年09期
【摘要】:肝癌是全球第五大惡性腫瘤,其五年生存率極低,及早地發(fā)現(xiàn)與診斷對肝癌的臨床治療具有重要意義。通過結(jié)合體外穩(wěn)定同位素標記的蛋白質(zhì)組學相對定量技術和基于平行反應監(jiān)測的靶向蛋白質(zhì)組學定量技術,建立了一種癌癥生物標志物的篩選和驗證方法。該方法被用于肝癌組織的差異蛋白質(zhì)篩選和后期驗證,共篩選到70個在癌組織中顯著變化的蛋白質(zhì),并對其中7個蛋白質(zhì)進行了驗證。所驗證的蛋白質(zhì)包括已在臨床使用的肝癌標志物甲胎蛋白(AFP)和文獻報道的潛在肝癌生物標志物熱休克蛋白(HSP90)、脂肪酸結(jié)合蛋白5(FABP5)和乙醇脫氫酶4(ADH4),說明了該方法的可靠性。該文所篩選的差異蛋白質(zhì)可以為肝癌生物標志物研究和臨床驗證提供參考;該方法還可用于其他癌癥樣品的差異蛋白質(zhì)篩選和驗證。
[Abstract]:Hepatocellular carcinoma (HCC) is the fifth largest malignant tumor in the world, and its 5-year survival rate is very low. Early detection and diagnosis are of great significance for clinical treatment of HCC. A screening and verification method for cancer biomarkers was established by combining the relative quantitative technique of proteomics with stable isotope labeling in vitro and the targeted proteomics quantitative technique based on parallel reaction monitoring. The method was used to screen differentially expressed proteins in liver cancer tissues and later validation. A total of 70 proteins with significant changes in cancer tissues were screened and 7 of them were verified. The verified proteins include AFP (a fetoprotein), HSP90, FABP5 and 4ADH4, which are the potential biomarkers of HCC reported in the literature, which demonstrate the reliability of this method. The differential proteins screened in this paper can provide reference for the study and clinical verification of liver cancer biomarkers, and this method can also be used to screen and verify differential proteins in other cancer samples.
【作者單位】: 浙江大學附屬邵逸夫醫(yī)院下沙院區(qū);
【分類號】:R735.7
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,本文編號:1955252
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