基于基因數(shù)據(jù)庫分析CD44在膠質(zhì)瘤中的表達及意義
本文選題:膠質(zhì)瘤 切入點:CD 出處:《華中科技大學學報(醫(yī)學版)》2017年03期
【摘要】:目的研究CD44在膠質(zhì)瘤中的表達和臨床意義,以及CD44下調(diào)對膠質(zhì)瘤細胞增殖、侵襲和凋亡的影響。方法檢索Oncomine數(shù)據(jù)庫中關(guān)于CD44的信息,對其在各類型腫瘤及膠質(zhì)瘤中的表達情況進行檢索。利用R2基因分析可視化平臺及TCGA數(shù)據(jù)庫中下載的膠質(zhì)瘤基因芯片數(shù)據(jù)集,分析CD44的表達水平與膠質(zhì)瘤患者預后的關(guān)系。通過siRNA抑制CD44的表達,通過CCK-8試驗、Transwell小室、流式細胞術(shù)檢測CD44下調(diào)對膠質(zhì)瘤U251細胞增殖、侵襲和凋亡的影響。結(jié)果 Oncomine數(shù)據(jù)庫中共收集了467項不同腫瘤類型的關(guān)于CD44的研究結(jié)果,對比正常組織,有統(tǒng)計學差異的結(jié)果有68項,其中CD44表達增高的有51項,表達降低的有17項。膠質(zhì)瘤中高表達的有10項,未搜索到低表達的項目,10項研究共包括955例樣本。分析R2基因分析可視化平臺(包含504例膠質(zhì)母細胞瘤)及TCGA數(shù)據(jù)庫(包含529例低級別膠質(zhì)瘤)的基因芯片數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),CD44高表達患者預后更差。在膠質(zhì)母細胞瘤中CD44高、低表達組患者2年生存率分別為13%和25%(P=0.000 1),在低級別膠質(zhì)瘤中CD44高、低表達組患者5年生存率分別為47%和61%(P=0.001 0)。采用特異性針對CD44基因的siRNA轉(zhuǎn)染U251膠質(zhì)瘤細胞可顯著抑制CD44的表達,與陰性對照組和空白對照組相比,轉(zhuǎn)染組的細胞增殖和侵襲明顯受到抑制,且流式細胞學顯示轉(zhuǎn)染組對比陰性對照組細胞凋亡率增加,分別為7.10%和4.11%(P0.05)。結(jié)論 CD44在膠質(zhì)瘤中高表達,可作為膠質(zhì)瘤預后判斷指標及潛在的治療靶點。
[Abstract]:Objective to study the expression and clinical significance of CD44 in glioma and the effect of down-regulation of CD44 on proliferation, invasion and apoptosis of glioma cells. The expression of glioma gene in various types of tumors and gliomas was searched. The glioma gene chip data set downloaded from the R2 gene analysis visualization platform and the TCGA database was used. To analyze the relationship between the expression of CD44 and the prognosis of glioma patients, the expression of CD44 was inhibited by siRNA, and the proliferation of U251 cells was detected by down-regulation of CD44 by CCK-8 assay. Results A total of 467 studies on CD44 of different tumor types were collected in the Oncomine database. Compared with normal tissues, there were 68 different results, 51 of which had increased CD44 expression. There were 17 cases of decreased expression and 10 cases of high expression in gliomas. A total of 955 samples were included in 10 studies that did not search for low expression items. Gene chip data from the R2 gene analysis visualization platform (504 glioblastoma cases) and the TCGA database (529 low grade gliomas) were analyzed. It was found that the prognosis of patients with high expression of CD44 was worse. CD44 was higher in glioblastoma. The 2-year survival rates of low expression group were 13% and 25%(P=0.000 1 respectively. The 5-year survival rate of low expression group was 47% and that of low expression group was 47% and 61%(P=0.001 0 respectively. U251 glioma cells transfected with siRNA targeting CD44 gene could significantly inhibit the expression of CD44. Compared with the negative control group and the blank control group, the cell proliferation and invasion of the transfected group were significantly inhibited, and flow cytology showed that the apoptosis rate of the transfected group was higher than that of the negative control group. Conclusion CD44 is highly expressed in gliomas and can be used as a prognostic index and a potential therapeutic target for glioma.
【作者單位】: 華中科技大學同濟醫(yī)學院附屬同濟醫(yī)院腫瘤中心;
【基金】:國家自然科學基金資助項目(No.81272780)
【分類號】:R739.41
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 馬丹;張珍祥;徐永健;;干擾CD44v3的表達對肺腺癌A549細胞侵襲行為的影響[J];華中科技大學學報(醫(yī)學版);2006年05期
2 ;Expression and significance of CD44s, CD44v6, and nm23 mRNA in human cancer[J];World Journal of Gastroenterology;2005年42期
【共引文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 郭秋云;胡廣原;韓娜;石磊;于洋;陳承奇;張孟賢;;基于基因數(shù)據(jù)庫分析CD44在膠質(zhì)瘤中的表達及意義[J];華中科技大學學報(醫(yī)學版);2017年03期
2 劉瓊瑤;廖鵬程;譚紅;張緒;王敏;聶敏海;;大鼠舌黏膜癌變過程中E-cad、CD44s的表達[J];口腔醫(yī)學研究;2017年02期
3 李文捷;張煦;酒旭東;;CD44V6和Bcl-2在眼瞼部基底細胞癌中的表達及意義[J];中國臨床研究;2016年03期
4 黃微;宋云駿;姜林鶴;劉運江;;CD44V6在結(jié)腸癌組織和外周血中的表達及其臨床意義[J];中國醫(yī)藥導報;2015年35期
5 張淼;李默;丁寧;;蝙蝠葛活性成分抑制胃癌SGC-7901細胞轉(zhuǎn)移侵襲作用[J];中國中醫(yī)急癥;2015年11期
6 孫建松;周明琦;;腫瘤轉(zhuǎn)移抑制基因KAI1/CD82及細胞分子CD44v6在人喉鱗癌中的表達及意義[J];臨床與實驗病理學雜志;2015年10期
7 張利飛;裴海平;;結(jié)直腸癌預后預測研究進展[J];中國普通外科雜志;2015年04期
8 羅朝鳳;楊衛(wèi)兵;李寧;柏玉舉;張廷友;;探討VEGF和nm23-H1在非小細胞肺癌組織中的表達與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J];貴州醫(yī)藥;2014年11期
9 陳俊;蔡軍;;CD44v6與腫瘤關(guān)系的研究進展[J];實用臨床醫(yī)學;2014年01期
10 謝建偉;黃昌明;鄭朝輝;李平;王家鑌;林建賢;陸俊;;腫瘤干細胞表面標記物CD44在胃癌中的表達及其意義[J];中華胃腸外科雜志;2013年11期
【二級參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 吳秋平,向明章,鐘前進,肖穎彬;CD44v3、CD44v6在非小細胞肺癌中的表達及其與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J];第三軍醫(yī)大學學報;2001年05期
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 徐俊杰;于洪泉;國巍;趙偉;金宏;溫娜;齊玲;;西蘭花多肽對大鼠C6膠質(zhì)瘤細胞生長的影響[J];中風與神經(jīng)疾病雜志;2012年11期
2 徐俊杰;于洪泉;趙偉;金宏;溫娜;齊玲;劉興吉;;西蘭花多肽對C6膠質(zhì)瘤細胞的誘導凋亡作用[J];吉林大學學報(醫(yī)學版);2013年01期
3 仝海波,江澄川,唐鎮(zhèn)生,金一尊;膠質(zhì)瘤細胞化學增敏作用實驗研究[J];山西臨床醫(yī)藥;2000年07期
4 李嗍,王楓,繆珊,駱文靜;過量鋅對鼠膠質(zhì)瘤細胞體外生長的影響[J];解放軍預防醫(yī)學雜志;2001年04期
5 梁一鳴,郭國慶,鄭少俊,沈偉哉;膠質(zhì)瘤血管內(nèi)皮生長因子表達的調(diào)節(jié)[J];臨床與實驗病理學雜志;2001年02期
6 曲元明,韓韜,李桂林,王成偉;血管內(nèi)皮細胞生長因子抗體對膠質(zhì)瘤生長的影響[J];山東醫(yī)科大學學報;2001年02期
7 黃強,董軍;膠質(zhì)瘤的分子外科治療[J];中國微侵襲神經(jīng)外科雜志;2001年04期
8 葉明,周岱,周幽心,王瑋,傅建新,黃煜倫;血管內(nèi)皮生長因子在膠質(zhì)瘤中的表達[J];腫瘤;2002年06期
9 顧宇翔,陳銜城,王宇倩;膠質(zhì)瘤對親細胞非均質(zhì)分子脂質(zhì)和幾種藥物敏感性的比較[J];復旦學報(醫(yī)學版);2003年02期
10 王成偉 ,劉福生 ,曲元明 ,李桂林;血管內(nèi)皮生長因子抗體抑制膠質(zhì)瘤生長的實驗研究[J];中華神經(jīng)外科雜志;2003年01期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 李飛;李梅;盧佳友;朱剛;林江凱;孟輝;吳南;陳志;馮華;;脂質(zhì)微區(qū)干擾劑甲基-β-環(huán)糊精影響C6膠質(zhì)瘤細胞侵襲和遷移的體外實驗研究[A];中國醫(yī)師協(xié)會神經(jīng)外科醫(yī)師分會第四屆全國代表大會論文匯編[C];2009年
2 吳安華;王運杰;Ohlfest JR;Wei Chen;Low WC;;膠質(zhì)瘤的生物治療-從實驗室到臨床[A];中華醫(yī)學會神經(jīng)外科學分會第九次學術(shù)會議論文匯編[C];2010年
3 徐宏;韓楊云;孫中書;李新軍;;與膠質(zhì)瘤代謝通路相關(guān)的候選基因篩選[A];中華醫(yī)學會神經(jīng)外科學分會第九次學術(shù)會議論文匯編[C];2010年
4 潘冬生;;多基因修飾膠質(zhì)瘤細胞疫苗的抗腫瘤免疫反應[A];中國醫(yī)師協(xié)會神經(jīng)外科醫(yī)師分會第六屆全國代表大會論文匯編[C];2011年
5 俞文華;車志豪;張祖勇;許培源;陸鏞民;傅林;朱強;陳鋒;杜權(quán);;骨橋蛋白在膠質(zhì)瘤細胞中的表達及其信號傳導途徑[A];2005年浙江省神經(jīng)外科學術(shù)會議論文匯編[C];2005年
6 張震;徐克;;低強度超聲誘導C6膠質(zhì)瘤細胞凋亡的體外實驗研究[A];中華醫(yī)學會第十三次全國超聲醫(yī)學學術(shù)會議論文匯編[C];2013年
7 蔣偉峰;高方友;尹浩;;白細胞介素-17及其受體在膠質(zhì)瘤中的表達及臨床意義[A];2013年貴州省神經(jīng)外科年會論文集[C];2013年
8 徐慶生;張小兵;周永慶;;膠質(zhì)瘤干細胞及其放療敏感性[A];2011年浙江省神經(jīng)外科學學術(shù)年會論文匯編[C];2011年
9 楊孔賓;趙世光;劉炳學;陳曉豐;戴欽舜;;K~+通道阻斷劑四乙胺對大鼠膠質(zhì)瘤細胞的增殖和凋亡影響[A];中國醫(yī)師協(xié)會神經(jīng)外科醫(yī)師分會第四屆全國代表大會論文匯編[C];2009年
10 黃強;;膠質(zhì)瘤生成細胞研究[A];第三屆中國腫瘤學術(shù)大會教育論文集[C];2004年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前5條
1 衣曉峰 馮宇曦;中藥三氧化二砷有望成為治療膠質(zhì)瘤新藥[N];中國醫(yī)藥報;2011年
2 記者 匡遠深;讓膠質(zhì)瘤干細胞不再“繁殖”[N];健康報;2011年
3 張獻懷 張文;瘤區(qū)埋雷 持續(xù)殺傷[N];健康報;2007年
4 白毅;人腦膠質(zhì)瘤基礎與應用研究喜結(jié)“九大碩果”[N];中國醫(yī)藥報;2006年
5 王德江;劉藏;王貴懷;曹勇;王新生;肖新如;交流最新進展 提高診治水平[N];中國醫(yī)藥報;2005年
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 董軍;CUL4B在神經(jīng)膠質(zhì)細胞瘤中的作用研究[D];山東大學;2015年
2 張睿;循環(huán)miR-221/222在膠質(zhì)瘤診斷與預后中的價值與基于CED的中樞神經(jīng)系統(tǒng)給藥新方法的研究[D];山東大學;2015年
3 許森林;ALDH1A1在膠質(zhì)瘤侵襲和結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移中的作用和機制[D];第三軍醫(yī)大學;2015年
4 王嘯;靶向嵌段共聚物膠束在膠質(zhì)瘤磁共振成像、藥物輸送及治療的應用[D];安徽醫(yī)科大學;2015年
5 廖紅展;鋅指轉(zhuǎn)錄因子SNAI2在miR-203的影響下通過上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化參與膠質(zhì)瘤耐藥機制的調(diào)節(jié)[D];南方醫(yī)科大學;2015年
6 潘俊;IRG1促進膠質(zhì)瘤增殖的作用機制及臨床意義[D];南方醫(yī)科大學;2015年
7 鄭傳宜;膠質(zhì)瘤中GLUT3基因異常表達的意義及其相關(guān)調(diào)控機制[D];南方醫(yī)科大學;2015年
8 徐紅超;氬氦冷凍消融聯(lián)合GM-CSF治療膠質(zhì)瘤小鼠的療效及其對小鼠脾臟樹突狀細胞免疫功能影響[D];南方醫(yī)科大學;2015年
9 黃素寧;TNFRSF6B在膠質(zhì)瘤中的表達及對膠質(zhì)瘤細胞增殖及凋亡的作用研究[D];南方醫(yī)科大學;2015年
10 熊偉;GBE1在人腦膠質(zhì)細胞瘤中的表達及干預實驗研究[D];第四軍醫(yī)大學;2015年
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 張大慶;單核細胞趨化蛋白-1在骨髓間充質(zhì)干細胞向膠質(zhì)瘤細胞趨化中的作用研究[D];大連醫(yī)科大學;2012年
2 黃俊龍;ADC值與膠質(zhì)瘤Ki-67、MGMT的相關(guān)性研究[D];福建醫(yī)科大學;2015年
3 李明聰;下調(diào)Pygo2對U251及U251起源的膠質(zhì)瘤干細胞生物學特性的影響[D];福建醫(yī)科大學;2015年
4 徐云峰;膠質(zhì)瘤干細胞的3D培養(yǎng)及其核酸適體篩選的探索[D];福建醫(yī)科大學;2015年
5 張靜文;T細胞過繼免疫治療小鼠腦膠質(zhì)瘤原位模型的研究[D];河北醫(yī)科大學;2015年
6 洪宇;膠質(zhì)瘤瘤周水腫、病理級別、Ki-67表達三者相關(guān)性研究[D];石河子大學;2015年
7 姬云翔;磷酸化Cx43蛋白在人膠質(zhì)瘤細胞中表達及其與腫瘤細胞增殖相關(guān)性研究[D];石河子大學;2015年
8 朱峰;OPN的異常表達與膠質(zhì)瘤的相關(guān)性研究[D];河北醫(yī)科大學;2015年
9 劉兵;SENP1表達水平對人腦膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展的作用機制及其相關(guān)性[D];河北醫(yī)科大學;2015年
10 李文華;Slit2/Robo1在人腦膠質(zhì)瘤中的表達及臨床意義[D];河北醫(yī)科大學;2015年
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