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藥物代謝酶含量測定的液相色譜—平行反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜方法的建立及應(yīng)用

發(fā)布時間:2018-03-21 13:29

  本文選題:藥物代謝酶 切入點(diǎn):穩(wěn)定同位素稀釋平行反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜法 出處:《鄭州大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:研究背景I相藥物代謝酶細(xì)胞色素P450氧化酶(cytochrome P450 oxidase,CYP450)和II相藥物代謝酶尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶(UDP-glucuronide transferases,UGTs)主要存在于肝臟中,參與多種內(nèi)外源性化合物(包括藥物)的代謝,Cytochrome P450 oxidoreductase(POR)和cytochrome b5(b5)作為藥物代謝酶的供電子物質(zhì)在藥物代謝中也具有重要的作用。CYP450和UGTs的多態(tài)性和含量差異是引起藥物藥效個體差異的重要因素,肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是我國常見的腫瘤之一,臨床上,肝癌及其并發(fā)癥治療時藥物的劑量需要及時調(diào)整,然而,作為劑量調(diào)整的基礎(chǔ),CYP及UGT的含量在HCC病人中是如何改變的,至今尚不完全清楚,因此,CYP450和UGTs含量的研究對肝癌病人臨床個體化治療方案的制定有重要意義。目前測定肝藥酶含量的常用方法有免疫印跡法(Western blot)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)和液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)。其中,基于抗原抗體結(jié)合原理的Western blot法和ELISA法雖具有高靈敏度的特點(diǎn),但特異性抗體制備困難,并且無法同時對同一樣本中的多種蛋白定量。而LC-MS/MS不需要制備特異性抗體,并具有高通量、高特異性以及線性范圍寬等特點(diǎn)。本文建立了液相色譜-平行反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜方法(liquid chromatography parallel reaction monitoring mass spectrometry,LC-PRM/MS),與選擇反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜方法相比,LC-PRM/MS能夠獲得二級的所有碎片信息,并且結(jié)果能夠搜庫,保證定量的特異性。我們將建立的方法應(yīng)用于肝癌病人肝硬化組織中的藥物代謝酶含量的測定,期望為肝癌病人的臨床用藥提供參考。本論文共分為兩個部分。第一部分使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記技術(shù)制備了定量肽段串聯(lián)體蛋白(Quantification concatemer,Qcon CAT);第二部分建立了平行反應(yīng)監(jiān)測方法,并將該方法應(yīng)用于藥物代謝酶的定量中。研究方法1.內(nèi)標(biāo)肽段的制備20種藥物代謝酶和POR以及b5各挑選2-3條特異性肽段,將選出的特異性肽段串聯(lián)成為了Qcon CAT蛋白,構(gòu)建可以表達(dá)該蛋白的基因序列,將其導(dǎo)入大腸桿菌后使用含重標(biāo)精氨酸和賴氨酸的SILAC培養(yǎng)基進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),表達(dá)成功的重組蛋白使用GST填料進(jìn)行純化,SDS-PAGE鑒定純度,并使用Trypsin進(jìn)行酶解。2.內(nèi)標(biāo)肽段酶切效率和標(biāo)記效率的考察酶切后的肽段使用數(shù)據(jù)依賴采集模式考察酶切效率和標(biāo)記效率,使用Proteome Discoverer 2.1搜庫檢索,對酶切肽段定性。3.內(nèi)標(biāo)肽段的定量化學(xué)合成一條CYP1A2的標(biāo)準(zhǔn)肽段ASGNLIPQEK,使用氨基酸水解法進(jìn)行定量,將含量已知的標(biāo)準(zhǔn)肽段梯度稀釋,加入等量的內(nèi)標(biāo)肽段,使用液相質(zhì)譜進(jìn)行檢測,計算內(nèi)標(biāo)肽段的含量。4.人肝微粒體的定量及酶切使用差速離心法制備人肝微粒體(Human liver microsomes,HLMs),用Bradford法對人肝微粒體進(jìn)行定量,定量后取出10μg蛋白使用Trypsin酶切26小時。5.液相-質(zhì)譜平行反應(yīng)監(jiān)測方法的建立將定量后的內(nèi)標(biāo)肽段與酶切后的人肝微粒體混合,使用數(shù)據(jù)依賴掃描模式,更換三根預(yù)柱,平行測定兩次,結(jié)果使用Proteome Discoverer 2.1搜庫鑒定,確定目標(biāo)肽段的保留時間和定量限,并篩選用于定量的子離子。6.標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立將Qcon CAT蛋白梯度稀釋,加入等量酶切后的人肝微粒體,使用液相色譜-平行反應(yīng)監(jiān)測質(zhì)譜方法進(jìn)行掃描,建立定量肽段的標(biāo)準(zhǔn)曲線。7.液相-質(zhì)譜平行反應(yīng)監(jiān)測方法的應(yīng)用將建立的平行反應(yīng)監(jiān)測方法應(yīng)用于肝癌病人肝硬化組織中藥物代謝酶含量的測定。研究結(jié)果1.重組蛋白純度鑒定及定量SDS-PAGE分析結(jié)果表示,表達(dá)的重組蛋白純度較高。使用Bradford法對重組蛋白進(jìn)行定量,標(biāo)準(zhǔn)品的方程為y=9.8617x+0.1537,R2=0.9876,蛋白濃度為0.56 mg/m L。2.重組蛋白的定性使用Proteome Discoverer 2.1搜庫匹配目標(biāo)蛋白質(zhì)信息,所有內(nèi)標(biāo)肽段均為目標(biāo)蛋白的特異性肽段,匹配情況良好。3.重組蛋白酶切效率及標(biāo)記效率的考察經(jīng)分析,純化蛋白僅存在一個漏切位點(diǎn),占所有肽段的10%以下,即酶切效率高,各個肽段標(biāo)記的均一性良好,標(biāo)記效率均達(dá)到90%。4.重組蛋白的絕對定量使用子離子y5和y4的平均值作為Qcon CAT的定量結(jié)果,即134.75fmol;與兩組定量曲線使用母離子的定量結(jié)果相差不到1.1倍。5.定量肽段保留時間和子離子的設(shè)置相同肽段使用不同色譜柱進(jìn)行色譜分離時,肽段的保留時間存在的偏差,而在同一色譜柱上對相同肽段的保留時間偏差小于1分鐘。使用搜庫結(jié)果中信號強(qiáng)度最高的三個子離子用于肽段的定量。6.標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立使用PRM方法建立藥物代謝酶定量肽段的標(biāo)準(zhǔn)曲線,R2值均在0.98以上,動態(tài)范圍為5-200fmol。7.肝癌病人肝硬化組織中藥物代謝酶的定量共測定12例樣本中6種藥物代謝酶的含量。CYP1A2、UGT1A1、UGT2B4、UGT2B15、POR以及b5在樣本中的含量均值分別為67.36 fmol/μg、87.25 fmol/μg、92.97 fmol/μg、53.01 fmol/μg、140.65 fmol/μg以及84.91 fmol/μg。個體差異倍數(shù)分別為6.5、5.02、5.24、4.33、6.17和4.02倍;與正常組織相比,POR在肝癌病人的肝硬化組織呈高表達(dá),UGT1A1與UGT2B15的含量與正常組織比有所降低,且差異顯著(p0.05)。結(jié)論1.本研究構(gòu)建了串聯(lián)體蛋白,實現(xiàn)了規(guī);瘍(nèi)標(biāo)肽段的制備,并保證了內(nèi)標(biāo)的純度與標(biāo)記效率;2.建立了藥物代謝酶的PRM分析方法,在此基礎(chǔ)上建立了絕對定量的標(biāo)準(zhǔn)曲線,線性關(guān)系為0.99,動態(tài)范圍為5-200fmol;3.使用建立的方法測定了12例樣本中6種藥物代謝酶的含量,CYP1A2、UGT1A1、UGT2B4、UGT2B15、POR以及b5在樣本中的含量均值分別為67.36 fmol/μg、87.25 fmol/μg、92.97 fmol/μg、53.01 fmol/μg、140.65 fmol/μg以及84.91fmol/μg。將結(jié)果與正常組織的結(jié)果進(jìn)行比較,POR在肝癌病人的肝硬化組織呈高表達(dá),UGT1A1與UGT2B15的含量與正常組織比有所降低,且差異顯著(P0.05)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R735.7

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本文編號:1644057

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