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模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌全基因表達影響研究

發(fā)布時間:2017-08-30 08:11

  本文關(guān)鍵詞:模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌全基因表達影響研究


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【摘要】:目的:本課題通過觀察牙周致病菌牙齦卟啉單胞菌ATCC33277在模擬微重力環(huán)境下細菌生長和全基因表達,研究相關(guān)差異基因在牙齦卟啉單胞菌模擬微重力環(huán)境中參與應(yīng)答、代謝過程的變化,旨在揭示模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌增殖、全基因表達的影響,為指導(dǎo)和維護航天員的口腔健康提供實驗依據(jù)。材料和方法:本研究使用美國NASA研發(fā)的旋轉(zhuǎn)細胞培養(yǎng)系統(tǒng)RCCS-4地面模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境以牙齦卟啉單胞菌.ATCC33277為研究對象,設(shè)為實驗組(模擬微重力)和對照組,分別培養(yǎng)、記錄生長曲線,利用高通量轉(zhuǎn)錄組測序的方法根據(jù)有生物學(xué)重復(fù)實驗標準設(shè)定padj0.05為閾值篩選差異表達的基因,分析差異基因聚類和GO、KEGG富集功能集團。結(jié)果:1.模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌生長曲線,靜止期和平臺期實驗組和對照組變化無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05),對數(shù)生長期兩組差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05),實驗組較對照組細菌增殖加快。2.轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn),實驗組71個基因差異表達,12個上調(diào)的基因包括參與編碼血細胞凝集素HagA的基因,編碼結(jié)合轉(zhuǎn)座子TraG的基因等。59個下調(diào)的基因有包括編碼細菌鞭毛fimA、fimC、fimD、fimE、mfal的基因等。3.通過對差異基因的富集和GO、KEEG聚類分析發(fā)現(xiàn)在模擬微重力環(huán)境下,牙齦卟啉單胞菌通過調(diào)整DNA復(fù)制、氧化物/超氧化物代謝活性、宿主間和細胞間的信號傳播和運動、ATP酶跨膜轉(zhuǎn)運活動。結(jié)論:1.構(gòu)建了模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌的培養(yǎng)模型2.模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌全基因組表達的影響為雙向調(diào)節(jié)基因差異表達多與牙齦卟啉單胞菌粘附和侵入牙齦上皮以及生物膜形成相關(guān);3.根據(jù)本實驗基因檢測結(jié)果初步推斷,模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌的定植、生物膜形成和氧化應(yīng)激等能力減弱,人侵牙齦上皮的能力、毒力因子轉(zhuǎn)移和環(huán)境響應(yīng)等能力增強。
【關(guān)鍵詞】:牙齦卟啉單胞菌 模擬微重力 轉(zhuǎn)錄組測序
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R852.22
【目錄】:
  • 中文摘要5-7
  • 英文摘要7-9
  • 前言9-11
  • 第一部分:構(gòu)建模擬微重力環(huán)境牙齦卟啉單胞菌培養(yǎng)模型11-19
  • 1.1 實驗材料11-12
  • 1.2 方法12-13
  • 1.3 結(jié)果13-15
  • 1.4 討論15-19
  • 第二部分:模擬微重力環(huán)境牙齦卟啉單胞菌全基因表達的初步研究19-66
  • 2.1 實驗材料19-20
  • 2.2 方法20-26
  • 2.3 結(jié)果26-60
  • 2.4 討論60-66
  • 全文總結(jié)66-67
  • 參考文獻67-77
  • 文獻綜述77-86
  • 參考文獻83-86
  • 附錄86-88
  • 個人簡歷86
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況86-88
  • 致謝88

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 祝昊丹;顧宏偉;陸承平;;體內(nèi)表達新基因trag在豬鏈球菌的分布及其免疫反應(yīng)性分析[J];微生物學(xué)報;2008年12期

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本文編號:758174

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