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二代測序技術(shù)用于3個短串聯(lián)重復(fù)序列分型的初步研究

發(fā)布時間:2024-11-30 11:05
  背景目前,基于熒光標(biāo)記的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-毛細管電泳(polymerase chain reaction-capillary electrophoresis,PCR-CE)技術(shù)用于短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)遺傳標(biāo)記的分型仍是法醫(yī)科學(xué)領(lǐng)域的主流技術(shù)。但是,基于PCR-CE技術(shù)的STR分型僅能分析STR遺傳標(biāo)記的長度多態(tài)性,長度相同但序列不同的STR等位基因被分型為相同的等位基因;另外,PCR-CE分型技術(shù)還會因電泳漂移等因素產(chǎn)生多種干擾峰如off-ladder峰,進一步影響STR等位基因的分型結(jié)果。二代測序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)用于STR遺傳標(biāo)記分型,不僅能分析其長度多態(tài)性,更重要的是能夠?qū)﹂L度相同但序列不同的STR等位基因進行分型,從而獲得更多的遺傳多態(tài)信息;除此之外,由于NGS直接對序列進行分析通?梢员苊庖螂娪酒频纫蛩禺a(chǎn)生的干擾峰。目的本實驗以河南漢族群體為研究對象,選擇1個常染色體STR基因座—D8S1179和2個快速突變多拷貝Y-STR基因座—DYF404S1a/b(2拷貝)及DYF399S1a/...

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖 1(a-c). NGS引物對 3 個 STR 基因座擴增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測圖

圖 1(a-c). NGS引物對 3 個 STR 基因座擴增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測圖

29圖1(a-c).NGS引物對3個STR基因座擴增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測圖注:a、b、c分別為DYF404S1、DYF399S1、D8S1179基因座NGS引物擴增產(chǎn)物,DYF404S1基因座為2拷貝Y-STR,瓊脂糖凝膠電泳顯示雙條帶,DYF3....


圖1(a,b).DYF404S1、DYF399S1基因座復(fù)合擴增毛細管電泳圖譜

圖1(a,b).DYF404S1、DYF399S1基因座復(fù)合擴增毛細管電泳圖譜

b為多拷貝基因座DYF404S1、DYF399S1基因座電泳分型結(jié)果,兩個基因座分別檢出2個、3個PCR產(chǎn)物峰,片段大小范圍分別在179~207bp、223~268bp。注:a,b分別為DYF404S1和DYF399S1基因座NGS引物擴增后....


圖2(a,b).DYF404S1、DYF399S1序列分析圖譜

圖2(a,b).DYF404S1、DYF399S1序列分析圖譜

新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文附圖注:a,b為多拷貝基因座DYF404S1、DYF399S1基因座電泳分型結(jié)果,兩個基因座分別檢出2個、3個PCR產(chǎn)物峰,片段大小范圍分別在179~207bp、223~268bp。圖1(a,b).DYF404S1、DYF399....


圖3.82號樣本AGCUY24plus試劑盒毛細管電泳分型圖譜

圖3.82號樣本AGCUY24plus試劑盒毛細管電泳分型圖譜

圖3.82號樣本AGCUY24plus試劑盒毛細管電泳分型圖譜圖4.94號樣本AGCUY24plus試劑盒毛細管電泳分型圖譜



本文編號:4012972

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