大鼠骨骼肌早期死亡時間推斷的內參基因篩選
發(fā)布時間:2022-07-12 14:30
目的死亡時間推斷是法醫(yī)病理學實踐的重點。運用mRNA定量技術進行死亡時間推斷已成為目前研究的熱點。在進行mRNA指標挑選時,為了排除其他干擾因素的影響,實驗數(shù)據(jù)必須要經過內參指標的標準化。因此,內參基因的選擇對實驗結果具有重要影響。方法 SD大鼠頸椎脫臼處死后置于4℃、15℃、25℃、35℃環(huán)境溫度下,在死后0h、6h、12h、18h、24h五個時間點取骨骼肌組織。利用實時熒光定量PCR技術測定常用內參基因Ct值,并使用三種內參評估軟件(geNorm、NormFinder、BestKeeper)綜合分析內參穩(wěn)定性。結論綜合三種內參評估軟件結果,在低溫條件下,RPS29、RPL13是較合適的內參,而在高溫條件下,5SrRNA、18SrRNA是較合適的內參。在35℃時,GAPDH、HPRT、PGK1、UBC、B2M與死亡時間有明顯相關性。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 動物樣本
1.2 總RNA提取及反轉錄
1.3 內參及引物挑選
1.4 實時熒光定量PCR
1.5 統(tǒng)計學分析
2 實驗結果
2.1 RNA純度及濃度
2.2 內參基因引物特異性及擴增性評估
2.3 基因穩(wěn)定性分析
2.3.1 geNorm軟件分析
2.3.2 NormFinder軟件分析
2.3.3 BestKeeper軟件分析
2.4 回歸分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大鼠死后管家基因mRNA穩(wěn)定性及其時序性降解與PMI相關性研究[J]. 劉志杰,董祖鑫,路健,王英元,梁新華. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(05)
本文編號:3659299
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 動物樣本
1.2 總RNA提取及反轉錄
1.3 內參及引物挑選
1.4 實時熒光定量PCR
1.5 統(tǒng)計學分析
2 實驗結果
2.1 RNA純度及濃度
2.2 內參基因引物特異性及擴增性評估
2.3 基因穩(wěn)定性分析
2.3.1 geNorm軟件分析
2.3.2 NormFinder軟件分析
2.3.3 BestKeeper軟件分析
2.4 回歸分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大鼠死后管家基因mRNA穩(wěn)定性及其時序性降解與PMI相關性研究[J]. 劉志杰,董祖鑫,路健,王英元,梁新華. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(05)
本文編號:3659299
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/yundongyixue/3659299.html
最近更新
教材專著