利用Y-STR單倍型推斷樣品間親緣關系
發(fā)布時間:2021-10-18 18:59
目的通過對Y-STR單倍型的分析,推測不同樣品間的親緣關系遠近。方法對鄭州地區(qū)某單一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus試劑盒進行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析單倍型多態(tài)性;以Network軟件構建各樣品間關系網(wǎng)絡;以SPSS軟件構建各樣品間遠近關系樹狀結構。結果單倍型分析發(fā)現(xiàn),182例樣品中共存在164種單倍型;Network軟件分析顯示,大部分樣品間的網(wǎng)絡距離呈均勻分布,但少部分樣品距離較近;SPSS軟件聚類分析發(fā)現(xiàn),164個單倍型呈現(xiàn)出多個層級,大部分在短期內(nèi)就發(fā)生了第一次聚集,再往根部又發(fā)生7次較大的匯集,最終全部匯集到兩個分支上。結論即使在同姓男子中,Yfiler Plus試劑盒所包含的Y-STR基因座仍然有較高的基因差異度;以Y-STR檢測結果進行Network分析及進化樹分析,有助于揭示群體內(nèi)個體間近代親緣關系和遺傳層級關系。該思路有望在法醫(yī)學法醫(yī)個體識別、親權鑒定及族群遷徙等研究中發(fā)揮作用。
【文章來源】:中國法醫(yī)學雜志. 2020,35(03)CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1材料和方法
1.1實驗樣品
1.2方法
1.2.1 Y-STR基因座檢測
1.2.2 Arlequin分析單倍型
1.2.3 Network分析構建親緣關系圖
1.2.4 SPSS進行聚類分析構建進化樹
1.2.5取樣結果與軟件分析結果的對照
2結果與討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]應用Y-STR遺傳標記進行家系排查偵破案件1例[J]. 徐志成,裘羽,楊曉波,陳新星. 中國法醫(yī)學雜志. 2018(06)
[2]湖南瀏陽客家人25個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J]. 趙霖,付永,李花,何海軍,邵俊,汪林木,黃篤厚. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(04)
[3]鄭州市Y-STR DNA數(shù)據(jù)庫建設及應用的調(diào)查研究[J]. 陳振乾,黃書琴. 中國人民公安大學學報(自然科學版). 2017(01)
[4]河南漢族人群27個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J]. 劉亞舉,張俊濤,史紹杏,劉海,郭利紅,張毅,李效陽. 刑事技術. 2014(04)
[5]人類Y染色體36個新STR位點的篩選與鑒定[J]. 彭冬鉑,姜正文,孫斯平,李才華,盧大儒. 遺傳. 2012(11)
[6]云南漢族家系Y-STR基因座突變率研究[J]. 李貌,程寶文,楊忠保,楊彥梅,劉浩東,何瑋,翟滇,曾發(fā)明. 中國法醫(yī)學雜志. 2009(02)
[7]聚類分析和主成分分析方法在人類學研究中價值的判定[J]. 吳秀杰,張全超,李海軍. 人類學學報. 2007(04)
本文編號:3443319
【文章來源】:中國法醫(yī)學雜志. 2020,35(03)CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1材料和方法
1.1實驗樣品
1.2方法
1.2.1 Y-STR基因座檢測
1.2.2 Arlequin分析單倍型
1.2.3 Network分析構建親緣關系圖
1.2.4 SPSS進行聚類分析構建進化樹
1.2.5取樣結果與軟件分析結果的對照
2結果與討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]應用Y-STR遺傳標記進行家系排查偵破案件1例[J]. 徐志成,裘羽,楊曉波,陳新星. 中國法醫(yī)學雜志. 2018(06)
[2]湖南瀏陽客家人25個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J]. 趙霖,付永,李花,何海軍,邵俊,汪林木,黃篤厚. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(04)
[3]鄭州市Y-STR DNA數(shù)據(jù)庫建設及應用的調(diào)查研究[J]. 陳振乾,黃書琴. 中國人民公安大學學報(自然科學版). 2017(01)
[4]河南漢族人群27個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J]. 劉亞舉,張俊濤,史紹杏,劉海,郭利紅,張毅,李效陽. 刑事技術. 2014(04)
[5]人類Y染色體36個新STR位點的篩選與鑒定[J]. 彭冬鉑,姜正文,孫斯平,李才華,盧大儒. 遺傳. 2012(11)
[6]云南漢族家系Y-STR基因座突變率研究[J]. 李貌,程寶文,楊忠保,楊彥梅,劉浩東,何瑋,翟滇,曾發(fā)明. 中國法醫(yī)學雜志. 2009(02)
[7]聚類分析和主成分分析方法在人類學研究中價值的判定[J]. 吳秀杰,張全超,李海軍. 人類學學報. 2007(04)
本文編號:3443319
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