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常熟地區(qū)人群Y染色體STR和SNP遺傳結構分析

發(fā)布時間:2021-07-21 23:17
  目的通過對常熟地區(qū)家系特異性核心單倍群和區(qū)域特異性遺傳結構進行分析,為構建特定地區(qū)的Y染色體數(shù)據(jù)庫提供理論基礎。方法采集常熟地區(qū)1 702名漢族男性無關個體的血樣,使用YfilerTM Plus PCR擴增試劑盒對27個Y-STR進行基因分型,再用Y-Predictor軟件推測各樣本的Y-SNP單倍群,并選取部分樣本通過擴增受阻突變系統(tǒng)聚合酶鏈反應(amplification refractory mutation system-polymerasechain reaction,ARMS-PCR)進行驗證。結果 1 702例樣本的27個Y-STR遺傳標記共檢出1 556種單倍型,單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)值為0.999 827,基因多樣性(gene diversity,GD)值最高的是DYS385(0.933),最低的是DYS438(0.409)。通過Y-Predictor軟件確定全部樣本來自C、D、N、O、Q和R下游162種細支單倍群。隨機選擇樣本對軟件預測結果進行驗證,預測正確率達95.74%。結論本研究發(fā)現(xiàn)27個Y-STR遺傳標記在常熟地區(qū)人群中... 

【文章來源】:法醫(yī)學雜志. 2020,36(04)CSCD

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

常熟地區(qū)人群Y染色體STR和SNP遺傳結構分析


常熟地區(qū)O1a1a1a1a*單倍群27個Y-STR的網(wǎng)絡圖


本文編號:3295959

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