食源性致病菌PCR檢測(cè)策略的建立和優(yōu)化
本文關(guān)鍵詞:食源性致病菌PCR檢測(cè)策略的建立和優(yōu)化
更多相關(guān)文章: 多項(xiàng)目同批次PCR 多重PCR 常規(guī)PCR 食物中毒
【摘要】:研究背景通過(guò)該研究項(xiàng)目,利用PCR方法對(duì)14種引起食源性疾病(食物中毒)的致病微生物進(jìn)行檢測(cè)并獲得其最佳PCR反應(yīng)條件,根據(jù)每種食源性致病微生物PCR檢測(cè)基因的引物的退火溫度的高低以及擴(kuò)增產(chǎn)物片段的大小將其分組進(jìn)行PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化實(shí)驗(yàn),使多個(gè)測(cè)試項(xiàng)目在同一批次進(jìn)行PCR檢測(cè),從而大大縮減了檢測(cè)時(shí)間,給現(xiàn)場(chǎng)疫情處理贏得時(shí)間。最終,建立一個(gè)快速、簡(jiǎn)便、準(zhǔn)確、敏感、特異、有效的微生物檢測(cè)平臺(tái),為突發(fā)事件現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查處理及患者的治療提供及時(shí)準(zhǔn)確的信息和依據(jù)。研究方法從文獻(xiàn)中查找部分食源性致病菌的PCR擴(kuò)增引物序列,同時(shí),在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中查找部分食物性致病菌的特異性基因序列,再依據(jù)特異性的靶序列使用Primer5.0軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì)。依據(jù)退火溫度和擴(kuò)增片段的大小對(duì)14種食物中毒致病菌進(jìn)行分組,然后,對(duì)多重PCR和多項(xiàng)目同批次PCR的反應(yīng)條件進(jìn)行優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。研究結(jié)果本文利用多重PCR和多項(xiàng)目同批次PCR技術(shù)對(duì)14種食物中毒致病菌進(jìn)行了檢測(cè)方法的研究,取得了以下成果:1.依據(jù)退火溫度與產(chǎn)物片段大小將14種致病菌分成三組,使它們能夠通過(guò)多項(xiàng)目同批次PCR一次性檢測(cè)出來(lái)。分組方案如下,第一方案:(1)沙門(mén)氏菌、副溶血性弧菌、阪崎腸桿菌、奇異變形桿菌、空腸彎曲菌,(2)志賀氏菌、腸出血性大腸埃希菌0157、金黃色葡萄球菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌、創(chuàng)傷弧菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌,(3)蠟樣芽胞桿菌、溶血性鏈球菌、小腸結(jié)腸耶爾森菌;第二方案:(1)沙門(mén)氏菌、志賀氏菌、副溶血性弧菌、創(chuàng)傷弧菌、空腸彎曲菌, (2)腸出血性大腸埃希菌0157、金黃色葡萄球菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌、阪崎腸桿菌、奇異變形桿菌,(3)單核細(xì)胞增生李斯特菌、蠟樣芽胞桿菌、溶血性鏈球菌、小腸結(jié)腸耶爾森菌。2.優(yōu)化了多項(xiàng)目同批次PCR反應(yīng)體系的退火溫度、引物用量、靈敏度以及引物比例。多項(xiàng)目同批次PCR反應(yīng)體系的最佳退火溫度為52℃;最佳混合引物用量為0.6-0.8μL;基因組DNA檢測(cè)靈敏度可達(dá)到8×10-4ng/μL;第一方案致病菌的最佳引物比例分別為1:1:3:3:2,1:1:1:1:3:3,1:1:2;第二方案致病菌的最佳引物比例分別為1:1:1:3:2,1:1:3:3:2,1:1:1:2。3.利用多項(xiàng)目同批次PCR反應(yīng)體系的條件成功從3位食物中毒患者的嘔吐物、腹瀉物以及吃過(guò)的可疑食品樣品中檢出副溶血性弧菌。4.將常規(guī)PCR與多重PCR的靈敏度和在食物中毒樣品檢測(cè)中的應(yīng)用效果進(jìn)行了比較。常規(guī)PCR的基因組DNA檢測(cè)靈敏度可達(dá)到2×10-7ng/μL,而多重PCR的基因組DNA檢測(cè)靈敏度只有2×10-6ng/μL;常規(guī)PCR比多重PCR更容易從食物中毒樣品中檢測(cè)出致病菌。研究結(jié)論本文利用多項(xiàng)目同批次PCR技術(shù)可以將14種食物中毒致病菌同時(shí)完成檢測(cè),建立了一個(gè)快速、簡(jiǎn)便、準(zhǔn)確、敏感、特異、有效的微生物檢測(cè)平臺(tái),從而為突發(fā)事件現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查處理及患者的治療提供及時(shí)準(zhǔn)確的信息和依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:多項(xiàng)目同批次PCR 多重PCR 常規(guī)PCR 食物中毒
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R155.5
【目錄】:
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 縮略詞及相關(guān)符號(hào)說(shuō)明10-11
- 前言11-14
- 材料與方法14-23
- 結(jié)果23-31
- 討論31-41
- 結(jié)論41-42
- 存在問(wèn)題及不足42-43
- 參考文獻(xiàn)43-51
- 致謝51-52
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文52-53
- 附件53
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條
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,本文編號(hào):685368
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