二噁英暴露跨代遺傳對mRNA/lncRNA影響的研究
發(fā)布時間:2023-11-05 12:24
目的:2,3,7,8-四氯代二苯并-對-二噁英(TCDD)可引起表型的跨代遺傳效應。本研究通過基因芯片對性腺性別決定期宮內(nèi)暴露TCDD的F1-F3代雄性大鼠肝臟mRNA和lncRNA表達譜進行研究,并進行生物信息學分析,探索mRNA和lncRNA在F1-F3代代際內(nèi)和代際間的改變以及發(fā)揮的潛在作用機制。方法:建立大鼠跨代遺傳模型,在F0代雌性SD大鼠孕8-14天(GD 8-14)連續(xù)每天給予灌胃染毒,劑量分別為0和200 ng/kg bw TCDD。取F1-F3代成年雄性大鼠肝臟,每組3例,共計18個樣本,使用Arraystar Rat LncRNA芯片進行mRNA和lncRNA的檢測,確定mRNA和lncRNA的差異表達譜;運用qRT-PCR方法檢測F1代Slc34a2、Zfp37和Agxt2,F2代Bcl6、Aft3和Adh4,F3代Ccnd1、Cyp7a1、Fcgbp、Hsd17b2、Aldh1a7、Lrtm2和Trib3 mRNA表達水平以及F1代XR347266、XR593760、XR343608和XR
【文章頁數(shù)】:158 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語/符號說明
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 mRNA表達譜變化以及生物信息學分析
1.1 對象和方法
1.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的的建立
1.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異mRNA
1.1.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達m RNA的驗證
1.1.4 統(tǒng)計學分析
1.2 結(jié)果
1.2.1 RNA質(zhì)量控制檢測結(jié)果
1.2.2 芯片檢測結(jié)果
1.2.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達m RNA的驗證
1.3 討論
1.3.1 出生前TCDD暴露對F1 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.3.2 出生前TCDD暴露對F2 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.3.3 出生前TCDD暴露對F3 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.4 小結(jié)
二、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 lnc RNA表達譜變化以及生物信息學分析
2.1 對象和方法
2.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的建立
2.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異lnc RNA
2.1.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達lnc RNA的驗證
2.1.4 統(tǒng)計學分析
2.2 結(jié)果
2.2.1 芯片檢測結(jié)果
2.2.2 lncRNA子類分析
2.2.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達lnc RNA的驗證
2.3 討論
2.4 小結(jié)
三、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 mRNA和lncR NA 代際間趨勢分析
3.1 對象和方法
3.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的建立
3.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異lnc RNA
3.1.3 統(tǒng)計學分析
3.2 結(jié)果
3.2.1 F1-F3 代際間TCDD染毒組m RNA和 lnc RNA的差異表達
3.2.2 F1-F3 代際間TCDD染毒組m RNAs差異基因表達的功能和通路分析
3.2.3 lncRNA子類分析
3.2.4 F1-F3代TCDD染毒組m RNA和 lncRNA模型譜趨勢分析
3.3 討論
3.4 小結(jié)
全文結(jié)論
論文創(chuàng)新點
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述
綜述參考文獻
致謝
個人簡歷
本文編號:3861026
【文章頁數(shù)】:158 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
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縮略語/符號說明
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 mRNA表達譜變化以及生物信息學分析
1.1 對象和方法
1.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的的建立
1.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異mRNA
1.1.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達m RNA的驗證
1.1.4 統(tǒng)計學分析
1.2 結(jié)果
1.2.1 RNA質(zhì)量控制檢測結(jié)果
1.2.2 芯片檢測結(jié)果
1.2.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達m RNA的驗證
1.3 討論
1.3.1 出生前TCDD暴露對F1 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.3.2 出生前TCDD暴露對F2 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.3.3 出生前TCDD暴露對F3 代雄性大鼠肝臟m RNA表達的影響
1.4 小結(jié)
二、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 lnc RNA表達譜變化以及生物信息學分析
2.1 對象和方法
2.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的建立
2.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異lnc RNA
2.1.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達lnc RNA的驗證
2.1.4 統(tǒng)計學分析
2.2 結(jié)果
2.2.1 芯片檢測結(jié)果
2.2.2 lncRNA子類分析
2.2.3 實時熒光定量PCR對芯片部分差異表達lnc RNA的驗證
2.3 討論
2.4 小結(jié)
三、出生前 TCDD 暴露跨代遺傳大鼠模型肝臟中 mRNA和lncR NA 代際間趨勢分析
3.1 對象和方法
3.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型的建立
3.1.2 基因芯片篩選出生前TCDD暴露所致跨代遺傳大鼠模型肝臟中的差異lnc RNA
3.1.3 統(tǒng)計學分析
3.2 結(jié)果
3.2.1 F1-F3 代際間TCDD染毒組m RNA和 lnc RNA的差異表達
3.2.2 F1-F3 代際間TCDD染毒組m RNAs差異基因表達的功能和通路分析
3.2.3 lncRNA子類分析
3.2.4 F1-F3代TCDD染毒組m RNA和 lncRNA模型譜趨勢分析
3.3 討論
3.4 小結(jié)
全文結(jié)論
論文創(chuàng)新點
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述
綜述參考文獻
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本文編號:3861026
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