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苯并芘暴露大鼠海馬組織的全基因組DNA甲基化差異分析

發(fā)布時間:2022-01-24 01:32
  目的研究苯并芘暴露大鼠海馬組織的DNA甲基化差異,探討苯并芘對海馬功能損傷的機制。方法將大鼠分為對照組和苯并芘染毒組,每組10只;染毒結(jié)束后,采用Morris水迷宮檢測大鼠的空間記憶學(xué)習(xí)能力,隨后對大鼠海馬進行HE染色與簡化表觀亞硫酸氫鹽測序法(reduced representation bisulfite sequencing, RRBS)測序,對測序結(jié)果進行GO和KEGG分析,用qRT-PCR檢測Tnr基因與Pla2g2a基因mRNA的表達。結(jié)果 Morris水迷宮與HE染色發(fā)現(xiàn)苯并芘暴露導(dǎo)致了大鼠空間學(xué)習(xí)記憶能力的障礙與海馬組織損傷;RRBS測序后檢測到差異性甲基化區(qū)域32個,GO分析富集到871條GO條目,KEGG分析得到52條通路,其中145條GO條目和11條通路顯著富集(P<0.05),苯并芘染毒組與對照組相比,Tnr基因相對表達量減少,而Pla2g2a基因相對表達量增加(P<0.05)。結(jié)論與未染毒的大鼠相比,苯并芘染毒后大鼠海馬組織存在一定數(shù)量的甲基化差異位點,這些甲基化差異位點可能對研究苯并芘導(dǎo)致海馬損傷的機制具有重要指導(dǎo)意義。 

【文章來源】:第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

苯并芘暴露大鼠海馬組織的全基因組DNA甲基化差異分析


不同功能元件區(qū)域的甲基化水平分布

甲基化,基因,信號通路


表3 差異甲基化基因的KEGG富集分析 通路 通路編號 候選基因數(shù)量 P值 基因名稱 Ras信號通路 rno04014 3 0.001 Ikbkg; Fgf14; Pla2g2a B細胞受體信號通路 rno04662 2 0.002 Cr2; Ikbkg 凝血與補體級聯(lián)反應(yīng)信號通路 rno04610 2 0.003 Plg; Cr2 PI3K-Akt信號通路 rno04151 3 0.004 Ikbkg; Fgf14; Tnr EB病毒感染 rno05169 2 0.021 Cr2; Ikbkg α-亞麻酸代謝 rno00592 1 0.025 Pla2g2a MAPK信號通路 rno04010 2 0.026 Ikbkg; Fgf14 脂肪的消化吸收 rno04975 1 0.039 Pla2g2a 原發(fā)性免疫缺陷 rno05340 1 0.039 Ikbkg 亞油酸代謝 rno00591 1 0.040 Pla2g2a 醚脂質(zhì)代謝 rno00565 1 0.042 Pla2g2a2.5 Tnr與Pla2g2a基因甲基化狀態(tài)與mRNA的表達

學(xué)習(xí)能力,迷宮,實驗觀察,空間


通過Morris水迷宮實驗觀察兩組大鼠的空間記憶和學(xué)習(xí)能力,結(jié)果顯示:隨著訓(xùn)練時間的增加,兩組大鼠的逃避潛伏期時間總體趨勢是減少的;從第3天開始,對照組比B[a]P染毒組逃避潛伏期縮短(P<0.05,圖1A),對照組與B[a]P染毒組在定位巡航實驗時代表性的游泳路徑如圖1B所示;空間探索實驗結(jié)果顯示:對照組在目標(biāo)象限時間百分比明顯長于B[a]P染毒組(P<0.05,圖1C)。2.2 苯并芘對海馬的損害作用

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3605566

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