[背景]磷酸三苯酯（TPHP）是目前應(yīng)用最廣泛的有機(jī)磷酸酯類阻燃劑之一,已在多種環(huán)境介質(zhì)中被檢測(cè)到。由于該化合物的多重毒性,近年來TPHP的健康風(fēng)險(xiǎn)引起了廣泛的關(guān)注。然而,有關(guān)TPHP暴露對(duì)肝臟代謝影響的研究較少。[目的]基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),采用生物信息學(xué)方法探討TPHP暴露對(duì)大鼠肝臟代謝紊亂的效應(yīng)。[方法]基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO）獲得基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集。采用主成分分析和層次聚類分析方法,依據(jù)不同劑量組的基因表達(dá)模式的相似程度將樣本歸類至對(duì)照組（0 mg·kg-1,含5個(gè)樣本）、低劑量組（55.0、110.0、220.0 mg·kg-1,含9個(gè)樣本）和高劑量組（441.0、881.0 mg·kg-1,含6個(gè)樣本）;利用R 3.5.3軟件中l(wèi)imma包篩選差異表達(dá)基因（DEGs）。運(yùn)用cluster Profiler包對(duì)DEGs進(jìn)行基因本體（GO）、京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（KEGG）富集分析。利用STRING網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)建立蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò),并運(yùn)用Cytoscape 3.7.1軟件的網(wǎng)絡(luò)分析插件Cyto Hubba篩選中心基因。最后,運(yùn)用cluster Profile... 

【文章來源】：環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué). 2020,37(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

GSE121134數(shù)據(jù)集樣本分組信息

Arntl基因高表達(dá)組和低表達(dá)組的GSEA結(jié)果顯示，一共有25條通路被富集，其中Arntl基因高表達(dá)組有19條通路，涉及精氨酸和脯氨酸代謝、背腹軸線形成、朊病毒疾病、擴(kuò)張型心肌病、造血細(xì)胞系、致病性大腸桿菌感染、細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用、黏著斑、細(xì)胞黏附分子、細(xì)胞間隙連接、利什曼原蟲感染、轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β（transforming growth factor-beta,TGF-β）信號(hào)通路、血管平滑肌收縮、哮喘、不飽和脂肪酸的生物合成、PPAR信號(hào)通路、細(xì)胞因子-受體相互作用、白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移、系統(tǒng)性紅斑狼瘡生物途徑；低表達(dá)組有6條通路，包括甾體生物合成、同源重組合、DNA復(fù)制、其他甘氨酸降解、萜類骨架生物合成和丁酸甲酯代謝生物途徑，詳見圖6。GSEA結(jié)果提示，Arntl基因可能通過以上生物學(xué)通路影響TPHP的代謝紊亂效應(yīng)。圖4 低劑量組（A）和高劑量組（B）的KEGG通路富集分析結(jié)果

低劑量組（A）和高劑量組（B）的KEGG通路富集分析結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]塑膠跑道中有機(jī)磷酸酯的含量及健康風(fēng)險(xiǎn)[J]. 印紅玲,劉琴,廖林群,王震,羅怡,鄧旭,丁浚剛,唐銘.  環(huán)境科學(xué). 2017(11)



本文編號(hào)：3425766