遺傳進化分析在廣東省一起HCV“暴發(fā)流行”事件中的應(yīng)用
本文選題:丙型肝炎病毒 切入點:暴發(fā) 出處:《實用醫(yī)學雜志》2017年07期
【摘要】:目的:通過對廣東省一起丙型肝炎病毒(HCV)"暴發(fā)流行"事件進行遺傳進化分析來了解此次事件的起源時間和傳播源頭。方法:首先對"暴發(fā)流行"事件調(diào)查中的192例血清樣本作為研究組進行基因分型,得到2a亞型和6a亞型,選取相應(yīng)基因亞型的對照組樣本,采用生物信息學相關(guān)軟件進行遺傳進化分析,通過構(gòu)建的時間尺度樹推斷此次HCV可能的起源時間及傳播源頭。結(jié)果:此次"暴發(fā)流行"事件的192例患者中,66例為2a亞型,119例為6a亞型,未發(fā)現(xiàn)其它的基因亞型。對2a亞型數(shù)據(jù)集以及6a數(shù)據(jù)集分別進行遺傳進化分析提示兩者都主要起源于2~5年前,均符合醫(yī)源性感染的特點。結(jié)論:此次廣東省HCV"暴發(fā)流行"事件中HCV主要基因型為2a和6a,主要起源于2~5年前,符合醫(yī)源性傳播特點,隨著時間的延長積累了眾多病例導致"暴發(fā)"。
[Abstract]:Objective: to investigate the origin time and transmission source of an outbreak of hepatitis C virus (HCV) in Guangdong Province by genetic and evolutionary analysis. Methods: firstly, 192 cases of "outbreak" were investigated. Serum samples were used as study group for genotyping. 2a subtype and 6a subtype were obtained. The control group samples of the corresponding gene subtypes were selected, and the genetic evolution analysis was carried out by bioinformatics software. According to the time scale tree constructed, the possible origin and source of HCV transmission were inferred. Results: among the 192 patients with this outbreak, 66 cases were subtype 2a and 119 cases were subtype 6a. No other gene subtypes were found. Genetic evolution analysis of 2a subtype data set and 6a data set showed that both of them mainly originated from 2 ~ 5 years ago. Conclusion: in this outbreak of HCV in Guangdong Province, the main genotypes of HCV were 2a and 6a, which were mainly originated from 2 ~ 5 years ago and accorded with the characteristics of iatrogenic transmission. Over time, the accumulation of many cases led to an "outbreak".
【作者單位】: 中山大學附屬第三醫(yī)院感染科;中山大學附屬第三醫(yī)院肝移植科、外科重癥醫(yī)學科;
【基金】:正大天晴Bridge專項經(jīng)費資助(編號:20151211)
【分類號】:R181.3;R512.63
【相似文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 張林;金寧一;馬鳴瀟;李昌;金明蘭;鄭敏;金擴世;夏志平;;牛IL-18基因的克隆及遺傳進化分析[J];中國免疫學雜志;2006年01期
2 王淑君;楊松濤;陳創(chuàng)夫;喬軍;馬良;鄒嘯環(huán);耿長國;孟軻音;馮昊;夏咸柱;;犬細小病毒四川流行株分離鑒定及其遺傳進化分析[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2009年10期
3 李樹純;李心海;仲書官;孫化露;潘金金;陳素娟;彭大新;劉秀梵;;H9N2亞型禽流感病毒基因組的遺傳進化分析[J];病毒學報;2012年01期
4 周密;李凡;;柯薩奇B4病毒jlu06株基因序列及遺傳進化分析[J];中國生物制品學雜志;2009年07期
5 高風華;郭中敏;陸家海;;148株柯薩奇病毒A組16型的多序列比對及遺傳進化分析[J];中華疾病控制雜志;2012年05期
6 溫紅玲;郝樹彬;高峰;趙麗;袁曉晶;司魯瑩;王東旭;王志玉;;腸道病毒71型山東臨沂分離株3D區(qū)遺傳進化分析[J];中國公共衛(wèi)生;2012年10期
7 陳煒;周朝暉;沈曉娜;張擁軍;謝劍鋒;吳冰珊;王金章;翁育偉;鄭奎城;嚴延生;;福建省腸道病毒71型分離株(2010FJLY008)全基因組核苷酸序列分析[J];中國人獸共患病學報;2011年01期
8 周密;李凡;王艷艷;;柯薩奇B4病毒5'UTR基因序列及遺傳進化分析[J];中國實驗診斷學;2012年07期
9 鄭逢梅;霍金耀;趙軍;常洪濤;王曉夢;陳陸;王川慶;;2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進化分析[J];病毒學報;2013年02期
10 劉琳玉;姜雙應(yīng);汪立杰;易虎;趙生倉;唐志堅;徐翠玲;董婕;高榮保;張燁;鄒淑梅;李曉丹;楊磊;楊靜;陳濤;舒躍龍;;青海湖地區(qū)5株H9N2亞型禽流感病毒全基因組序列進化分析[J];病毒學報;2014年02期
相關(guān)會議論文 前10條
1 田朋飛;屈玲玲;張國瑞;邢剛;金玉蘭;周繼勇;;浙江及周邊地區(qū)豬流行性腹瀉病毒的遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜傳染病學分會第八屆全國會員代表大會暨第十五次學術(shù)研討會論文集[C];2013年
2 王淑君;陳創(chuàng)夫;夏咸柱;楊松濤;喬軍;鄒嘯環(huán);馬良;耿長國;孟軻音;馮昊;;犬細小病毒四川流行株分離鑒定及其遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)病理學分會第十六次學術(shù)研討會、中國病理生理學會動物病理生理專業(yè)委員會第十五次學術(shù)研討會論文集[C];2009年
3 霍金耀;陳陸;趙軍;常洪濤;王新衛(wèi);楊霞;鄭逢梅;劉紅英;姚惠霞;王川慶;;2010-2011年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒流行毒遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會動物傳染病學分會第十二次人獸共患病學術(shù)研討會暨第六屆第十四次教學專業(yè)委員會論文集[C];2012年
4 晁行周;劉志剛;鄒忠;金梅林;;一株鴨坦布蘇病毒的分離鑒定及遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜傳染病學分會第八屆全國會員代表大會暨第十五次學術(shù)研討會論文集[C];2013年
5 張林;金寧一;馬鳴瀟;李昌;金明蘭;鄭敏;金擴世;夏志平;;牛IL-18基因的克隆及遺傳進化分析[A];第六屆全國會員代表大學暨第11次學術(shù)研討會論文集(下)[C];2005年
6 張林;金寧一;馬鳴瀟;李昌;金明蘭;鄭敏;金擴世;夏志平;;牛IL-18基因的克隆及遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜傳染病學分會第六屆全國會員代表大會暨第11次學術(shù)研討會論文集[C];2005年
7 齊巧玲;李雁冰;施建忠;趙海丹;田國彬;鄧國華;樊淑芳;王秀榮;張書霞;陳化蘭;;2005年青海湖野鳥H5N1亞型HPAIV的遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會動物傳染病學分會第十二次學術(shù)研討會論文集[C];2007年
8 姬郭彪;趙軍;李歡;楊霞;周峰;魏亞鵬;王曉夢;常洪濤;鄭逢梅;陳陸;王川慶;;河南地區(qū)豬嵴病毒分子檢測和VP1基因遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會家畜傳染病學分會第八屆全國會員代表大會暨第十五次學術(shù)研討會論文集[C];2013年
9 潘偉;高玉龍;劉超男;孫芬芬;秦立廷;王永強;祁小樂;高宏雷;王笑梅;;我國部分地區(qū)蛋雞ALV-J流行毒株gp85基因遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會畜牧獸醫(yī)生物技術(shù)學分會暨中國免疫學會獸醫(yī)免疫分會第八次學術(shù)研討會論文集[C];2010年
10 謝青梅;吳志強;曹永長;陳峰;馬靜云;畢英佐;;07-08年H5N1亞型鴨流感病毒HA基因的遺傳進化分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學會禽病學分會第十四次學術(shù)研討會論文集[C];2008年
相關(guān)博士學位論文 前1條
1 吳雙;2005-2008年華東地區(qū)NDV遺傳進化分析和代表性毒株感染細胞的比較蛋白質(zhì)組研究[D];揚州大學;2010年
相關(guān)碩士學位論文 前10條
1 李仕超;鴿源新城疫病毒的遺傳進化分析及其免疫原性研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學院;2015年
2 張月香;一起豬血凝性腦脊髓炎的診斷[D];吉林大學;2016年
3 劉佳佳;基因VI型中不同亞型新城疫病毒的生物學特性測定及遺傳進化分析[D];揚州大學;2016年
4 郭博;豬薩佩羅病毒real-time RT-PCR檢測方法的建立[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2016年
5 張沖;野豬源PRRSV Shaanxi-2株分離鑒定、全基因測序及遺傳進化分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2010年
6 蘇文政;新城疫病毒分離鑒定與遺傳進化分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學;2011年
7 武小椿;PRRSV Shaanxi-1株分離鑒定、全基因測序及遺傳進化分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2010年
8 金仕強;10株新城疫病毒(弱毒)的遺傳進化分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2012年
9 郭捷;H1亞型禽流感病毒分離鑒定、遺傳進化分析及快速檢測方法的研究[D];廣西大學;2013年
10 張渭東;秦嶺野鳥源NDV的致病性研究及F、HN基因的遺傳進化分析[D];西北農(nóng)林科技大學;2012年
,本文編號:1658754
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/yufangyixuelunwen/1658754.html