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喉癌線粒體DNA D-loop區(qū)突變的檢測(cè)和分析

發(fā)布時(shí)間:2017-09-26 22:37

  本文關(guān)鍵詞:喉癌線粒體DNA D-loop區(qū)突變的檢測(cè)和分析


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【摘要】:目的: 線粒體(mitochondria)是迄今發(fā)現(xiàn)的唯一不依賴核基因組進(jìn)行復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯的細(xì)胞器。近年來(lái),線粒體DNA(mtDNA)的改變與人類腫瘤發(fā)生的關(guān)系備受關(guān)注,越來(lái)越多的研究證明mtDNA的突變與腫瘤的發(fā)生關(guān)系密切,尤以D-loop區(qū)的突變率最高。mtDNA D-loop區(qū)位于16024~576bp之間,占全部mtDNA的6%左右,主要負(fù)責(zé)調(diào)控mtDNA的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制。本研究中我們通過(guò)檢測(cè)與分析喉癌組織中mtDNAD-loop區(qū)突變情況,進(jìn)而闡述mtDNA D-loop區(qū)的突變與喉癌發(fā)生的關(guān)系。 方法: 以吉林大學(xué)第二醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科手術(shù)治療的40名喉癌患者為研究對(duì)象,年齡在45歲-75歲之間,其中男性28例,女性12例,術(shù)中切取病人的腫瘤組織及相應(yīng)的癌旁組織,總計(jì)80例標(biāo)本,置于負(fù)80度冰柜凍存?zhèn)溆,通過(guò)提取組織標(biāo)本的DNA,利用PCR擴(kuò)增、產(chǎn)物純化和直接測(cè)序等技術(shù),,運(yùn)用美國(guó)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的基因序列分析軟件,將腫瘤組織mtDNA D-loop區(qū)序列和癌旁組織的序列與目前公認(rèn)的劍橋標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行比對(duì)(BLAST),找出mtDNA D-loop區(qū)的高發(fā)突變位點(diǎn)及高頻率的多態(tài)性改變,總結(jié)并分析mtDNA D-loop區(qū)突變與喉癌發(fā)生的關(guān)系。 結(jié)果: 在40例喉癌患者中,有18例發(fā)生突變,突變率是45%,突變多集中在HVⅠ區(qū),突變的類型主要表現(xiàn)為單個(gè)堿基的替換或單個(gè)堿基的插入和缺失,發(fā)現(xiàn)20個(gè)微衛(wèi)星不穩(wěn)定現(xiàn)象,主要集中在D310區(qū),共發(fā)現(xiàn)多態(tài)性改變102個(gè),單個(gè)標(biāo)本最多發(fā)現(xiàn)多態(tài)性改變位點(diǎn)8個(gè)。 結(jié)論: 喉癌組織mtDNA突變率明顯高于正常組織,喉癌mtDNA D-loop區(qū)具有高度的多態(tài)性和突變性,對(duì)mtDNA D-loop區(qū)突變的檢測(cè)有望應(yīng)用于腫瘤的早期診斷。
【關(guān)鍵詞】:喉癌 線粒體DNA D-loop 多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R739.65
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-11
  • 第1章 引言11-13
  • 第2章 文獻(xiàn)綜述13-19
  • 2.1 綜述一線粒體 DNA 及 D-LOOP 區(qū)的概述13-15
  • 2.2 綜述二線粒體 DNA D-LOOP 區(qū)突變與腫瘤的關(guān)系的研究進(jìn)展15-17
  • 2.3 綜述三線粒體 DNA D-LOOP 區(qū)突變對(duì)腫瘤細(xì)胞表型的影響17-19
  • 第3章 資料與方法19-27
  • 3.1 材料19-20
  • 3.1.1 喉癌組織及癌旁組織標(biāo)本19
  • 3.1.2 試劑及來(lái)源19
  • 3.1.3 實(shí)驗(yàn)所需的主要儀器及設(shè)備19-20
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)方法20-22
  • 3.2.1 喉癌組織線粒體 DNA 的提取20-21
  • 3.2.2 引物的設(shè)計(jì)與合成21
  • 3.2.3 PCR 反應(yīng)21
  • 3.2.4 PCR 產(chǎn)物的電泳21
  • 3.2.5 基因測(cè)序21-22
  • 3.3 結(jié)果22-27
  • 3.3.1 mtDNA PCR 產(chǎn)物擴(kuò)增結(jié)果22
  • 3.3.2 測(cè)序結(jié)果及分析22-27
  • 第4章 討論27-30
  • 第5章 結(jié)論30-31
  • 參考文獻(xiàn)31-36
  • 作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的科研成果36-37
  • 致謝37

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 陳道楨,薛文群,楊幼易,耿金花,陸以農(nóng),陸肖瑋,王峻峰,印永祥,孟西娜;宮頸癌線粒體DNA D-Loop區(qū)基因突變的研究[J];腫瘤;2005年04期



本文編號(hào):926143

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