發(fā)布時間：2022-01-26 02:42

　　背景和目的EB病毒（Epstein-Barr virus,EBV）編碼小RNA（EBV-encoded small RNAs,EBERs,包括EBER1和EBER2）是所有EBV潛伏類型中表達最為豐富的RNA,其致癌作用已在淋巴和上皮性腫瘤中得到證實。我們以往對山東地區(qū)EBV相關腫瘤和健康人群中EBERs基因多態(tài)性的研究中發(fā)現(xiàn)了新的EBERs變異型（EB-8m和EB-10m）,該變異型雖然不是主要亞型但在NPC中的檢出率高于EBV相關胃癌和健康人群。本研究旨在了解我國NPC高發(fā)區(qū)廣東地區(qū)NPC和健康人群中EBERs基因變異特征,并與山東地區(qū)實驗數(shù)據(jù)和已發(fā)表EBV基因組序列毒株中的EBERs序列進行比較,探討EBERs基因變異與NPC的相關性,為最終明確EBV基因多態(tài)性與EBV相關腫瘤的關系提供實驗依據(jù)。方法收集NPC高發(fā)區(qū)廣東地區(qū)NPC組織標本和健康人群咽漱液（Throat washing,TW）標本,提取DNA,采用PCR和DNA測序檢測EBERs基因序列,同時對山東地區(qū)新增EBV陽性NPC和健康人群標本進行EBERs基因序列檢測,應用Lasergene軟件對EBERs序列進行對比分... 

【文章來源】：青島大學山東省

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

廣東地區(qū)NPC組織（A）和健康人群TW標本（B）中EBERs基因序列變異Figure1EBERssequencevariationsinNPCtissues(A)andTWsamplesofhealthydonors(B)fromGuangdongNumbersacrossthetopcorrespondtotheEBERsprototypenucleotidesequence.OnlynucleotidesdifferentfromB95-8areindicated.Differentvariantsarenotedtotheleftcolumn,whilethespecimensshowingidenticalsequencestoeachotherarelistedbyarepresentativeisolateinthesecondcolumn.Thefollow

9圖 2 山東地區(qū) NPC 組織（A）和健康人群 TW 標本（B）中 EBERs 基因序列變異Figure 2 EBERs sequence variations in NPC tissues (A) and TW samples of healthy donors (B) fromShandongNumbers across the top correspond to the EBERs prototype nucleotide sequence. Onlynucleotides different from B95-8 are indicated. Different variants are noted to the left column, whilethe specimens showing identical sequences to each other are listed by a representative isolate in thesecond column. The followed numbers in the parentheses denote the amount of the identicalsequences.

圖 3 EBERs 各變異型特征性突變位點及不同變異型混合感染測序圖Figure 3 The signature mutations of EBERs variants and the sequence analysis for multipleinfection of different EBERs variantsA, The signature mutations of EBERs variants. Only nucleotides different from B95-8 areindicated. B, The sequence analysis for multiple infection of different EBERs variants. In dualinfection with EB-6m and EB-8m, double signals were found at nucleotides 6866, 6884, 6886, 6911,6944, 6999, 7001, 7012, 7016 and 7048, which simultaneously showed the signature mutations ofEB-6m and EB-8m. In dual infection with EB-6m and B95-8, double signals were found at nucleotides6808, 6884, 6886, 6911, 6944 and 7123, which simultaneously showed the signature mutations ofEB-6m and B95-8.1.2 系統(tǒng)進化樹分析對廣東地區(qū) 130 條序列和山東地區(qū) 187 條 EBERs 序列比對后，共出現(xiàn) 61 條不同序列，以 61 條序列和標準株 B95-8 序列繪制系統(tǒng)進化樹，與圖 1 和圖 2 對應，每一種人群中相同序列以一個樣本作為代表，與該序列相同的標本數(shù)列于標本編號后括號內(nèi)。系統(tǒng)樹分為 2 大枝，每一枝又分別包含兩個亞組，四個亞組分別對應 EB-6m、B95-8、EB-10m和EB-8m四種變異型。EB-6m和B95-8型距離較近，EB-8m和EB-10m距離較近（圖 4）。EB-10m 在 161 bp 非轉錄區(qū)前的 4 個堿基突變與 EB-6m 相同，而非轉錄區(qū)后的 6 個堿基突變與 EB-8m 相同，似乎是 EB-6m 和 EB-8m 的重組株。

【參考文獻】：
期刊論文
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[3]EB病毒LMP1基因XhoⅠ位點缺失與高發(fā)區(qū)鼻咽癌相關性的Meta分析[J]. 王宏,劉芡芡,李斐斐,楊垚,譚沁,王云.  齊魯醫(yī)學雜志. 2015(04)
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[8]兩種不同來源LMP1致瘤性的比較研究[J]. 藍軻,任彩萍,謝鷺,何志巍,甘潤良,姚開泰.  癌癥. 2001(10)
[9]EB病毒編碼小RNA多態(tài)性與鼻咽癌的關系[J]. 張曉實,張林杰,張如華,麥海強,陳劍經(jīng),曾益新.  實用腫瘤雜志. 2001(05)
[10]鼻咽癌組織中EBV-BARF0基因序列的測定[J]. 宋立兵,曾益新,馬英紅,劉慶倫,李滿枝,李端,汪慧民.  癌癥. 2001(05)

博士論文
[1]EB病毒相關腫瘤中病毒基因多態(tài)性研究[D]. 王云.青島大學 2010

碩士論文
[1]廣州地區(qū)鼻咽癌和健康人群中EB病毒BARF1和vIL-10基因多態(tài)性研究[D]. 王偉娜.青島大學 2015



本文編號：3609651