NOR1是調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞自噬/凋亡分子開關(guān)的氧化應(yīng)激反應(yīng)性蛋白
發(fā)布時(shí)間:2021-05-28 08:48
本課題前期研究工作基礎(chǔ)NOR1是本實(shí)驗(yàn)室自主克隆的鼻咽癌易感基因,在鼻咽癌組織中顯著下調(diào),但其下調(diào)機(jī)制和轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律尚未闡明。NOR1蛋白定位于線粒體和胞漿中,與OSCP蛋白存在直接交互作用;NOR1表達(dá)抑制鼻咽癌細(xì)胞的生長(zhǎng)與增殖,并促進(jìn)缺氧引起的細(xì)胞凋亡。但該基因在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用及機(jī)制研究的還未成熟。定位克隆NOR1基因的核心啟動(dòng)子采用預(yù)測(cè)軟件PromoterScan、PromoterInspector和EMBOSS CpG Plot綜合分析發(fā)現(xiàn),NOR1基因啟動(dòng)子區(qū)可能位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(為+1)上游-517bp至下游+236bp以內(nèi)。為了確定NOR1基因核心啟動(dòng)子序列,將NOR1基因的預(yù)測(cè)啟動(dòng)子調(diào)控區(qū)分為幾段,構(gòu)建出一系列NOR1基因不同調(diào)控區(qū)熒光素酶報(bào)告載體和綠色熒光蛋白報(bào)告載體。通過luciferase assay和熒光顯微鏡觀察聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)NOR1核心啟動(dòng)子定位于NOR1基因5’端-258/+26區(qū)間內(nèi)。NOR1基因啟動(dòng)子區(qū)存在一個(gè)典型的CpG島,在鼻咽癌組織和細(xì)胞中因啟動(dòng)子高甲基化修飾而表達(dá)下調(diào)MatInspector軟件分析發(fā)現(xiàn)NOR1基因啟動(dòng)子區(qū)序列無TATA盒...
【文章來源】:中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
主要縮略詞簡(jiǎn)表
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞系和組織樣本
2.1.2 菌株和質(zhì)粒載體
2.1.3 試劑
2.1.4 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析
2.2.2 基因組DNA的提取
2.2.3 膠回收(按試劑盒說明書步驟進(jìn)行)
2.2.4 轉(zhuǎn)化反應(yīng)
2.2.5 載體的構(gòu)建
2.2.6 質(zhì)粒、siRNA轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞
2.2.7 慢病毒轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞
2.2.8 核心啟動(dòng)子檢測(cè)
2.2.9 甲基轉(zhuǎn)移酶SssⅠ處理DNA
2.2.10 凝膠遷移率實(shí)驗(yàn)(EMSA)
2.2.11 染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)ChIP檢測(cè)
2.2.12 基因組DNA的亞硫酸氫鈉修飾
2.2.13 亞硫酸氫鈉測(cè)序法(Bisulfite Genomic Sequencing,BGS)
2.2.14 甲基化特異性PCR(Methylated specific PCR,MSP)
2.2.15 組織及細(xì)胞RNA制備及cDNA的轉(zhuǎn)錄
2.2.16 差異RT-PCR
2.2.17 細(xì)胞蛋白制備
2.2.18 Western blot檢測(cè)
2.2.19 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
2.2.20 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)基因蛋白表達(dá)水平
2.2.21 腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)實(shí)驗(yàn)
2.2.22 軟瓊脂集落生成實(shí)驗(yàn)
2.2.23 MTT法檢測(cè)細(xì)胞活力
2.2.24 MTT法檢測(cè)藥物對(duì)細(xì)胞毒性的IC50
2.2.25 LDH法測(cè)量細(xì)胞毒性
2.2.26 TUNEL技術(shù)檢測(cè)細(xì)胞凋亡
2.2.27 Hoechst 33258染色檢測(cè)細(xì)胞凋亡
2.2.28 乳酸生成實(shí)驗(yàn)
2.2.29 耗氧量檢測(cè)
2.2.30 ROS檢測(cè)
2.2.31 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 NOR1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律及氧化應(yīng)激敏感性表達(dá)
3.1.1 NOR1基因啟動(dòng)子的定位及克隆
3.1.2 NOR1基因在鼻咽癌中甲基化沉默
3.1.3 NOR1基因啟動(dòng)子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制及氧化應(yīng)激敏感性表達(dá)
3.2 NOR1對(duì)鼻咽癌生物學(xué)行為的影響
3.2.1 NOR1基因抑制惡性腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖
3.2.2 NOR1基因抑制惡性腫瘤細(xì)胞自噬分子表達(dá)和自噬行為
3.2.3 NOR1表達(dá)抑制腫瘤細(xì)胞的能量代謝
3.3 NOR1基因?qū)ρ趸瘧?yīng)激狀態(tài)下細(xì)胞自噬/凋亡分子開關(guān)的調(diào)節(jié)
3.3.1 NOR1增加氧化應(yīng)激狀態(tài)下細(xì)胞毒性,降低細(xì)胞活力
3.3.2 NOR1通過抑制氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞自噬,促進(jìn)細(xì)胞凋亡
3.3.3 NOR1增加化腫瘤細(xì)胞的化療敏感性
4 討論
4.1 抑癌基因NOR1是一個(gè)在鼻咽癌中甲基化沉默的氧化應(yīng)激反應(yīng)性蛋白
4.1.1 抑癌基因NOR1啟動(dòng)子在鼻咽癌中甲基化沉默
4.1.2 抑癌基因NOR1是一個(gè)氧化應(yīng)激反應(yīng)性蛋白,功能與氧化應(yīng)激相關(guān)
4.2 抑癌基因NOR1的生物學(xué)功能
4.2.1 抑癌基因NOR1同時(shí)抑制腫瘤生長(zhǎng)和自噬
4.2.2 抑癌基因NOR1通過抑制自噬來抑制腫瘤細(xì)胞能量代謝,發(fā)揮抑癌的作用
4.3 抑癌基因NOR1通過抑制細(xì)胞自噬,促進(jìn)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞凋亡
4.4 抑癌基因NOR1通過線粒體凋亡途徑促進(jìn)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞凋亡
4.5 抑癌基因NOR1與順鉑協(xié)同抑制自噬,增強(qiáng)鼻咽癌細(xì)胞對(duì)順鉑的化療敏感性
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間主要研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]順鉑誘導(dǎo)的自噬在口腔鱗癌Tca83細(xì)胞中的作用[J]. 白宇,全海英,張桐菲,趙軒一,張澤兵. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2012(06)
[2]細(xì)胞自噬的研究方法[J]. 馬泰,孫國(guó)平,李家斌. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2012(03)
[3]細(xì)胞自噬在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 向波,易梅,李小玲,李桂源. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2012(03)
[4]抑制Beclin 1促進(jìn)H2O2誘導(dǎo)的神經(jīng)膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞凋亡[J]. 孔曉霞,張宏宇,陳兆琴,范小芳,龔永生. 生理學(xué)報(bào). 2011(03)
[5]細(xì)胞自噬與腫瘤[J]. 杜海磊,邱偉華,楊衛(wèi)平. 中國(guó)病理生理雜志. 2010(02)
[6]細(xì)胞自噬在腫瘤中作用的研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)東,吳德全,李本義. 癌癥. 2009(04)
[7]自噬在細(xì)胞存活和死亡中的作用[J]. 何韜,王海杰,譚玉珍. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2008(01)
[8]鼻咽癌的危險(xiǎn)因素[J]. 尚學(xué)蘭,謝志強(qiáng),黃志碧. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008(02)
[9]中國(guó)西南地區(qū)漢族人群腫瘤壞死因子基因多態(tài)性與鼻咽癌遺傳易感性[J]. 張蓓蕾,梁偉波,冉鵬,周斌,韋葉生,張更謙,王晶,張林. 中國(guó)組織工程研究與臨床康復(fù). 2007(34)
[10]EB病毒與鼻咽癌相關(guān)免疫學(xué)的研究進(jìn)展[J]. 楊貴. 宜春學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(02)
本文編號(hào):3207948
【文章來源】:中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
主要縮略詞簡(jiǎn)表
1 前言
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞系和組織樣本
2.1.2 菌株和質(zhì)粒載體
2.1.3 試劑
2.1.4 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析
2.2.2 基因組DNA的提取
2.2.3 膠回收(按試劑盒說明書步驟進(jìn)行)
2.2.4 轉(zhuǎn)化反應(yīng)
2.2.5 載體的構(gòu)建
2.2.6 質(zhì)粒、siRNA轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞
2.2.7 慢病毒轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞
2.2.8 核心啟動(dòng)子檢測(cè)
2.2.9 甲基轉(zhuǎn)移酶SssⅠ處理DNA
2.2.10 凝膠遷移率實(shí)驗(yàn)(EMSA)
2.2.11 染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)ChIP檢測(cè)
2.2.12 基因組DNA的亞硫酸氫鈉修飾
2.2.13 亞硫酸氫鈉測(cè)序法(Bisulfite Genomic Sequencing,BGS)
2.2.14 甲基化特異性PCR(Methylated specific PCR,MSP)
2.2.15 組織及細(xì)胞RNA制備及cDNA的轉(zhuǎn)錄
2.2.16 差異RT-PCR
2.2.17 細(xì)胞蛋白制備
2.2.18 Western blot檢測(cè)
2.2.19 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
2.2.20 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)基因蛋白表達(dá)水平
2.2.21 腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)實(shí)驗(yàn)
2.2.22 軟瓊脂集落生成實(shí)驗(yàn)
2.2.23 MTT法檢測(cè)細(xì)胞活力
2.2.24 MTT法檢測(cè)藥物對(duì)細(xì)胞毒性的IC50
2.2.25 LDH法測(cè)量細(xì)胞毒性
2.2.26 TUNEL技術(shù)檢測(cè)細(xì)胞凋亡
2.2.27 Hoechst 33258染色檢測(cè)細(xì)胞凋亡
2.2.28 乳酸生成實(shí)驗(yàn)
2.2.29 耗氧量檢測(cè)
2.2.30 ROS檢測(cè)
2.2.31 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 NOR1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律及氧化應(yīng)激敏感性表達(dá)
3.1.1 NOR1基因啟動(dòng)子的定位及克隆
3.1.2 NOR1基因在鼻咽癌中甲基化沉默
3.1.3 NOR1基因啟動(dòng)子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制及氧化應(yīng)激敏感性表達(dá)
3.2 NOR1對(duì)鼻咽癌生物學(xué)行為的影響
3.2.1 NOR1基因抑制惡性腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖
3.2.2 NOR1基因抑制惡性腫瘤細(xì)胞自噬分子表達(dá)和自噬行為
3.2.3 NOR1表達(dá)抑制腫瘤細(xì)胞的能量代謝
3.3 NOR1基因?qū)ρ趸瘧?yīng)激狀態(tài)下細(xì)胞自噬/凋亡分子開關(guān)的調(diào)節(jié)
3.3.1 NOR1增加氧化應(yīng)激狀態(tài)下細(xì)胞毒性,降低細(xì)胞活力
3.3.2 NOR1通過抑制氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞自噬,促進(jìn)細(xì)胞凋亡
3.3.3 NOR1增加化腫瘤細(xì)胞的化療敏感性
4 討論
4.1 抑癌基因NOR1是一個(gè)在鼻咽癌中甲基化沉默的氧化應(yīng)激反應(yīng)性蛋白
4.1.1 抑癌基因NOR1啟動(dòng)子在鼻咽癌中甲基化沉默
4.1.2 抑癌基因NOR1是一個(gè)氧化應(yīng)激反應(yīng)性蛋白,功能與氧化應(yīng)激相關(guān)
4.2 抑癌基因NOR1的生物學(xué)功能
4.2.1 抑癌基因NOR1同時(shí)抑制腫瘤生長(zhǎng)和自噬
4.2.2 抑癌基因NOR1通過抑制自噬來抑制腫瘤細(xì)胞能量代謝,發(fā)揮抑癌的作用
4.3 抑癌基因NOR1通過抑制細(xì)胞自噬,促進(jìn)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞凋亡
4.4 抑癌基因NOR1通過線粒體凋亡途徑促進(jìn)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞凋亡
4.5 抑癌基因NOR1與順鉑協(xié)同抑制自噬,增強(qiáng)鼻咽癌細(xì)胞對(duì)順鉑的化療敏感性
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間主要研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]順鉑誘導(dǎo)的自噬在口腔鱗癌Tca83細(xì)胞中的作用[J]. 白宇,全海英,張桐菲,趙軒一,張澤兵. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2012(06)
[2]細(xì)胞自噬的研究方法[J]. 馬泰,孫國(guó)平,李家斌. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2012(03)
[3]細(xì)胞自噬在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 向波,易梅,李小玲,李桂源. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2012(03)
[4]抑制Beclin 1促進(jìn)H2O2誘導(dǎo)的神經(jīng)膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞凋亡[J]. 孔曉霞,張宏宇,陳兆琴,范小芳,龔永生. 生理學(xué)報(bào). 2011(03)
[5]細(xì)胞自噬與腫瘤[J]. 杜海磊,邱偉華,楊衛(wèi)平. 中國(guó)病理生理雜志. 2010(02)
[6]細(xì)胞自噬在腫瘤中作用的研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)東,吳德全,李本義. 癌癥. 2009(04)
[7]自噬在細(xì)胞存活和死亡中的作用[J]. 何韜,王海杰,譚玉珍. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2008(01)
[8]鼻咽癌的危險(xiǎn)因素[J]. 尚學(xué)蘭,謝志強(qiáng),黃志碧. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008(02)
[9]中國(guó)西南地區(qū)漢族人群腫瘤壞死因子基因多態(tài)性與鼻咽癌遺傳易感性[J]. 張蓓蕾,梁偉波,冉鵬,周斌,韋葉生,張更謙,王晶,張林. 中國(guó)組織工程研究與臨床康復(fù). 2007(34)
[10]EB病毒與鼻咽癌相關(guān)免疫學(xué)的研究進(jìn)展[J]. 楊貴. 宜春學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(02)
本文編號(hào):3207948
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