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TNIP1基因多態(tài)同漢族人群vogt-小柳原田綜合癥及Behcet病的遺傳易感性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-09 13:13
  研究背景: Vogt-小柳原田綜合征(Vogt Koyanagi Haradasyndrome,VKH綜合征)和Behcet病以雙眼全葡萄膜炎為特征的眼部疾病,是中國人群中最重要的兩種葡萄膜炎。人類白細(xì)胞抗原(Humanleukocyte antigen,HLA)基因已經(jīng)被證明同Behcet病和VKH綜合征的發(fā)病具有緊密的聯(lián)系。近期的研究表明,一些非HLA是自身免疫性疾病相關(guān)易感基因,同時(shí)也是VKH綜合征和Behcet病的易感基因。我研究組也通過對自身免疫性疾病的相關(guān)易感基因在VKH綜合征及Behcet病患者進(jìn)行檢測,而發(fā)現(xiàn)多個(gè)同VKH綜合征、Behcet病相關(guān)的易感基因。腫瘤壞死子α蛋白3相關(guān)蛋白(TNFα-induced protein3interacting with protein1,TNIP1)基因是一些自身免疫性疾病,如系統(tǒng)性紅斑狼瘡等的易感基因,本研究旨在對TNIP1的基因多態(tài)性同中國漢族VKH綜合征和Behcet病的相關(guān)性進(jìn)行研究。 目的:本研究的目的為對TNIP1的基因多態(tài)性同中國漢族vogt-小柳原田綜合征和Behcet病的遺傳易感性進(jìn)行研究。 方法:本研究根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道共選TNIP1的7個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行研究,分別為rs17728338, rs7708392, rs10036748, rs3762999, rs999556,rs4958881和rs3792783。初步納入656名Behcet病、961名VKH綜合征患者及1534名健康人納入本研究。研究分為兩個(gè)階段進(jìn)行,第一階段,隨機(jī)從患者和健康人中選擇377個(gè)Behcet病及374個(gè)VKH綜合征患者及480個(gè)健康對照來初步查找可能的同vogt-小柳原田綜合征和Behcet病相關(guān)的TNIP1的基因多態(tài)性位點(diǎn)。研究第二階段,在剩余的279個(gè)Behcet病患者和587個(gè)VKH綜合征患者及1054個(gè)健康對照對第一階段發(fā)現(xiàn)的可能的基因多態(tài)性位點(diǎn)改變進(jìn)行驗(yàn)證性檢測研究。對研究樣本進(jìn)行基因型的分析采用限制性內(nèi)切酶的聚合酶鏈反應(yīng)和直接測序的方法,對基因型結(jié)果分析采用卡方檢驗(yàn)及Fisher確切概率分析,并使用Bonferroni法進(jìn)行矯正。所得p值使用Bonferroni法進(jìn)行矯正,P值0.05認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,同時(shí)計(jì)算優(yōu)勢率(Odds ratios,ORs)和95%可信區(qū)間(confidence intervals,CI)。 結(jié)果:第一階段,對TNIP1的7個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn)的基因型在Behcet病和vogt-小柳原田綜合征患者分別進(jìn)行分析,所有7個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性在患者及健康組基因型頻率附哈迪-溫伯格平衡(P0.05)。7個(gè)基因的多態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率在Behcet病患者及正常對照之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。而rs17728338位點(diǎn)的基因型AG型在vogt-小柳原田綜合征患者同健康對照之間的基因型AG型相比基因型頻率減少,而且存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,(Pc=0.038OR=1.934,95%CI=1.438~2.601)。第二階段,我們僅對研究對象中剩余的587個(gè)VKH綜合征患者和1054個(gè)健康對照之間rs17728338的多態(tài)性進(jìn)行驗(yàn)證性研究,,而未發(fā)現(xiàn)同Behcet病相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn),故終止檢測。rs17728338位點(diǎn)AG基因型頻率在VKH綜合征患者中顯著降低(Pc=0.038)。將第一階段和第二階段結(jié)果聯(lián)合統(tǒng)計(jì),發(fā)現(xiàn)rs17728338的AG基因型頻率在VKH綜合征和健康對照之間仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Pc=1.83×10-4, OR=1.934,95%CI=1.438~2.601).。 結(jié)論:TNIP1的基因多態(tài)性改變同中國漢族人群VHK綜合征的易感性相關(guān),GG基因型和G等位基因可能為VKH綜合征的危險(xiǎn)因素,而AG基因型和A等位基因?yàn)閂KH綜合征的保護(hù)因素。
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R773
文章目錄
英漢縮略語名詞對照
摘要
ABSTRACT
前言
    1 Vogt-小柳原田綜合征和 Beh et 病的疾病概述
    2 VKH 綜合征 Beh et 病發(fā)病機(jī)制的研究
    3 TNIP1 基因單核苷酸多態(tài)性同自身免疫性疾病的關(guān)系
第一部分 TNIP1 同 VKH 綜合征的相關(guān)關(guān)系研究
    前言
    1 材料和方法
    2 結(jié)果
    3 討論
第二部分 TNIP1 同 Beh et 病的相關(guān)關(guān)系研究
    前言
    1 材料和方法
    2 結(jié)果
    3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
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