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2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析

發(fā)布時間:2016-12-03 15:24

  本文關鍵詞:2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《大連醫(yī)科大學》 2014年

2012年大連市流行性角膜炎疫情的病原鑒定及人腺病毒56型基因特征分析

劉大鵬  

【摘要】:目的:確定2012年大連市流行性角結膜炎疫情的病原體,鑒定其型別;分析此次疫情病原體人腺病毒56型的主要結構基因特征及重組情況,為今后新型重組D亞屬人腺病毒所致疾病的預防控制提供理論依據(jù)。 方法: 1.病原確定:采集2012年大連市流行性角結膜炎疫情的典型病例眼結膜拭子標本30份,,采用熒光PCR方法分別以人腺病毒通用引物及腸道病毒通用引物進行檢測確定病原,并對其特定片段測序進行分子定型。 2.基因特征分析:對檢測結果為人腺病毒陽性標本進行病毒分離,針對其主要結構基因六鄰體(Hexon)、五鄰體(Penton)及纖突(Fiber)基因進行全長測序,與人腺病毒標準毒株進行比對、系統(tǒng)進化及重組分析。 結果: 1.共有21份標本熒光PCR檢測結果為腺病毒陽性,核酸檢測陽性率為70.0%(21/30),Hexon基因L1片段核苷酸序列與人腺病毒15、29、56及其重組型高度同源,多重序列比對后構建的系統(tǒng)進化樹上與人腺病毒56(HAdV-D56)及其重組型位于同一分支。 2.針對其Hexon、Penton及Fiber基因的全長序列系統(tǒng)進化分析結果顯示,該毒株為人腺病毒56型,其Hexon基因序列與HAdV-D56標準毒株一致性為100%。Penton基因序列存在15個堿基位點突變,其中14個為同義突變,1個核苷酸突變引起氨基酸改變。Fiber基因序列存在1個堿基位點突變,引起氨基酸序列的改變。系統(tǒng)進化及重組分析顯示該毒株Penton基因可能有HAdV-D39參與重組。 結論:此次流行性角結膜炎疫情為人腺病毒56型引起,國內未見對該型病毒的正式報道,全球范圍內未見由該型病毒引起的大規(guī)模流行性角結膜炎疫情的報道。其Penton、Fiber片段氨基酸位點改變是否導致毒株侵襲性增強而引起此次大規(guī)模疫情爆發(fā),有待進一步研究論證。

【關鍵詞】:
【學位授予單位】:大連醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R777.31
【目錄】:

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本文編號:203406

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