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利用多重單堿基引物延伸法檢測耳聾基因熱點突變

發(fā)布時間:2017-10-29 15:11

  本文關(guān)鍵詞:利用多重單堿基引物延伸法檢測耳聾基因熱點突變


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【摘要】:背景:聽覺系統(tǒng)中外耳、中耳、內(nèi)耳結(jié)構(gòu)異常及聽覺傳導(dǎo)信號通路中的聽神經(jīng)和各級中樞發(fā)生病變,導(dǎo)致聽功能障礙,表現(xiàn)出不同程度的聽力下降,統(tǒng)稱為耳聾。我國聽力殘疾人數(shù)眾多,每年有3萬左右聾兒出生,發(fā)病率為1/500~1/1000。60%的耳聾患者是遺傳因素所導(dǎo)致的,遺傳性聾中非綜合征型耳聾占70%,30%為綜合征型耳聾。迄今已經(jīng)定位的非綜合征型耳聾基因座約有136個,已克隆基因88個。雖然耳聾具有較高的遺傳異質(zhì)性,但大部分非綜合征型耳聾由少數(shù)幾個基因熱點突變引起,包括GJB2、GJB3、SLC26A4、線粒體基因(mtDNA12SrRNA)等,這使遺傳性耳聾的基因診斷和篩查成為可能。傳統(tǒng)的耳聾基因檢測方法包括限制性片段長度多態(tài)性分析、限制性內(nèi)切酶酶切指紋-單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析、變性高效液相色譜法、實時熒光定量Taqman MGB探針法、PCR結(jié)合Sanger測序、高分辨率熔解曲線法等。但是這些方法很難同時對不同基因上的多個突變位點進行檢測;蛐酒夹g(shù)雖然能同時對多基因、多位點進行檢測,但是成本昂貴,對技術(shù)要求高。因此,建立一種能一次性檢測多個熱點突變、可靠、經(jīng)濟、快速的技術(shù)尤為重要。 目的:采用多重單堿基引物延伸法對耳聾先證者進行GJB2、 GJB3、SLC26A4、12SrRNA基因12個熱點突變位點的一次性檢測,以期建立一種快速、可靠、經(jīng)濟的耳聾基因診斷方法。 方法:采用多重單堿基引物延伸法對96名非綜合征型耳聾先證者、66名家系成員及50名正常人,共212名,進行GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12個熱點突變位點的一次性檢測,并采用Sanger測序進行驗證。 結(jié)果:1、采用多重單堿基引物延伸法對96名非綜合征型耳聾先證者、66名家系成員及50名正常人,共212名,進行GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12個熱點突變位點的一次性檢測,結(jié)果與Sanger測序結(jié)果一致,準(zhǔn)確性為100%。2、采用多重單堿基引物延伸法對96名非綜合征型耳聾先證者進行GJB2、GJB3、SLC26A4、12SrRNA基因12個熱點突變位點的一次性檢測,大大提高了檢出率,檢出率為41.67%,而前期單個基因/單個位點的一次性檢出率只有31.25%。3、50名正常人中有1名攜帶GJB2c.235delC,正常人中攜帶率為2%,與國內(nèi)研究顯示的正常人群攜帶率在1%~6%之間相符。 結(jié)論:建立了一種可以一次性檢測非綜合征型耳聾GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12個熱點突變位點的快速、可靠、經(jīng)濟的基因診斷方法。
【關(guān)鍵詞】:非綜合征型耳聾 多重單堿基引物延伸法 熱點突變
【學(xué)位授予單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R764.43
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • ABSTRACT6-9
  • 目錄9-10
  • 主要實驗儀器、試劑與耗材10-13
  • 英文~.略詞簡表13-14
  • 前言14-18
  • 1 研究對象18-19
  • 2 研究方法19-27
  • 2.1 外周血基因組DNA(gDNA)提取19
  • 2.2 96個先證者前期基因檢測19
  • 2.3 多重單堿基引物延伸19-25
  • 2.4 Sanger測序驗證25-26
  • 2.5 正常對照人群篩查26-27
  • 3 實驗結(jié)果27-44
  • 3.1 96個先證者前期基因檢測結(jié)果27-31
  • 3.2 多重單堿基引物延伸結(jié)果31-44
  • 4 討論44-51
  • 4.1 多重單堿基引物延伸法在基因分型中的應(yīng)用44-45
  • 4.2 非綜合征型遺傳性耳聾突變位點的選擇45-46
  • 4.3 多重單堿基引物延伸結(jié)果討論46-49
  • 4.4 耳聾檢測技術(shù)的展望49-51
  • 5 結(jié)論51-52
  • 參考文獻52-57
  • 綜述57-79
  • 參考文獻73-79
  • 在讀期間主要研究成果79-80
  • 致謝80

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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10 邱海濤;遼寧省新生兒聽力與聾病基因同步篩查的研究[D];中國醫(yī)科大學(xué);2009年

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本文編號:1113493

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