基于調控網絡分析篩選急性冠狀動脈綜合征的miRNA標志物
本文關鍵詞:基于調控網絡分析篩選急性冠狀動脈綜合征的miRNA標志物
更多相關文章: 急性冠脈綜合征 急性心肌梗死 不穩(wěn)定型心絞痛 mi RNA 生物標志物 富集分析
【摘要】:急性冠狀動脈綜合征(ACS)是一個高發(fā)病率、高死亡率的疾病,該病主要分為兩個亞型:急性心肌梗死(AMI)和不穩(wěn)定型心絞痛(UA)。臨床上,很多患者會由于診斷的不及時或者診斷的依據不全面而錯過了寶貴治療時間。Micro RNA(mi RNA)是在真核生物中廣泛存在的非編碼RNA,通過堿基互補配對原則與目標信使核糖核酸(m RNA)結合,調控基因表達,是理想的生物標志物。本課題基于mi RNA-m RNA調控網絡篩選ACS兩個亞型相關的潛在mi RNA標志物。從GEO數(shù)據庫中分別收集與兩個亞型相關的mi RNA表達數(shù)據,將具有差異表達現(xiàn)象的mi RNA映射到已構建的mi RNA-m RNA調控網絡中。重點關注每個具有差異表達現(xiàn)象的mi RNA在網絡中獨立調控基因的能力并使用新的出度指標NOD量化表示。最終在AMI和UA中分別找到了27個和26個潛在的mi RNA生物標志物,其中8個mi RNA是兩亞型共有的,每種亞型中分別有5個在文獻中被報道。通過對結果mi RNA的靶基因進行富集分析,在AMI和UA中分別找到35條和18條相關的信號通路。通過文獻驗證,在AMI中發(fā)現(xiàn)其中的28條通路是已被報道與疾病相關的。在UA富集的結果中,也找到了12條已被報道和疾病相關的通路。本課題基于創(chuàng)新的理論篩選了ACS兩個亞型的潛在mi RNA生物標志物并比較了它們的異同。在此基礎上,更深層次地分析了兩種亞型mi RNA靶基因所富集的生物信號通路。對于該病的臨床診斷和治療具有重要的指導意義。
【關鍵詞】:急性冠脈綜合征 急性心肌梗死 不穩(wěn)定型心絞痛 mi RNA 生物標志物 富集分析
【學位授予單位】:蘇州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R541.4;R440
【目錄】:
- 中文摘要4-5
- Abstract5-8
- 第1章 引言8-12
- 1.1 課題研究背景8-10
- 1.1.1 急性冠狀動脈綜合癥研究現(xiàn)狀、背景及其意義8-10
- 1.1.2 研究miRNA作為生物標志物和其網絡特征的意義10
- 1.2 本文的研究結構和目的10-12
- 第2章 網絡的構建及其篩選指標12-13
- 2.1 miRNA-mRNA調控網絡的構建12
- 2.2 NOD(novel out degree)值的定義和作用12-13
- 第3章 數(shù)據收集和數(shù)據篩選13-16
- 3.1 數(shù)據收集13
- 3.2 差異miRNA篩選方法13-14
- 3.3 亞型中miRNA生物標志物的篩選結果14-16
- 第4章 miRNA層次的分析與驗證16-22
- 4.1 文獻報道的亞型miRNA生物標志物16-21
- 4.2 亞型數(shù)據驗證21-22
- 4.2.1 AMI的驗證21
- 4.2.2 UA的驗證21-22
- 第5章 生物信號通路層次的分析與驗證22-41
- 5.1 亞型的信號通路富集22-29
- 5.1.1 AMI富集通路的概括和分類22-23
- 5.1.2 AMI文獻報道的通路23-26
- 5.1.3 UA富集通路的概括和分類26-27
- 5.1.4 UA文獻報道通路27-29
- 5.2 亞型中明確報道的獨有通路29-35
- 5.2.1 AMI獨有通路29-34
- 5.2.2 UA獨有通路34-35
- 5.3 亞型中明確報道的共有通路35-41
- 5.3.1 Development_VEGF signaling and activation35-37
- 5.3.2 Development_PEDF signaling and activation37-38
- 5.3.3 NF-kB因子相關的通路38-39
- 5.3.4 多發(fā)性神經纖維瘤、裥屯39-41
- 第6章 結論與展望41-42
- 參考文獻42-55
- 附錄一55-68
- 攻讀碩士學位期間公開發(fā)表的論文68-69
- 致謝69-70
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