研究背景:心血管疾病（candiovascular disease,CVD）的發(fā)病率與死亡率已躍居世界第一,是當(dāng)今危害人類健康和生命的主要疾病之一,其中很大部分歸因于冠狀動脈粥樣硬化性心臟病。腸道菌群失調(diào)（intestinal dysbacteriosis,ID）是指由于某種原因打破了人體腸道正常菌群的種類、數(shù)量、定位以及生物學(xué)特點的變化,使腸道菌群之間失去平衡從而產(chǎn)生病理性組合,并危害著人體健康。有研究提示腸道菌群失調(diào)與冠心病、心力衰竭、肥胖、高血壓病及糖尿病等疾病存在相關(guān)性。本實驗旨在穩(wěn)定型冠心病與腸道菌群之間的關(guān)系,為腸道菌群與穩(wěn)定型冠心病的研究進一步提供了理論依據(jù)。目的:本研究旨在通過16Sr RNA測序技術(shù)分析穩(wěn)定型冠心病患者的腸道菌群變化特點,研究腸道菌群改變與穩(wěn)定型冠心病之間的關(guān)系,以期為冠心病的防治提供新的靶點和理論依據(jù)。方法:13例受試者收集于2018年12月至2019年5月陜西省人民醫(yī)院心血管內(nèi)一科的住院患者及門診健康體檢者,分為穩(wěn)定型冠心患者9例和健康對照組4例。采集研究對象的糞便5g用于提取糞便總DNA,利用16S r RNA測序技術(shù)獲得基因序列,然后在Illu... 

【文章來源】：西安醫(yī)學(xué)院陜西省

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

序列樣本拆分統(tǒng)計

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文28cluster的序列及其代表序列（即為OTU）。對每個樣本而言，OTU豐度構(gòu)成該樣本的組成結(jié)構(gòu)。使用R軟件ggplot2包中的ggplot函數(shù)可對示例樣本在各分類水平注釋的相對程度進行堆疊圖繪制，可視化結(jié)果如圖3，代表所有樣本在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖。橫坐標(biāo)(SampleName)是樣品名，縱坐標(biāo)(SequenceNumberPercent)表示注釋到該水平的序列數(shù)目占總注釋數(shù)據(jù)的比率，柱狀圖自上而下的顏色順序?qū)?yīng)于右側(cè)的圖例顏色順序。每個分類水平最高值為1，代表100%的序列都得到了至少在這個級別的注釋。本研究結(jié)果主要針對每個樣本腸道微生物的物種分別在門、綱和屬3個水平分類級別進行分析。圖3所有樣本在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖說明：A樣本為穩(wěn)定型冠心病組，C樣本為健康對照組3.4物種組成分析一般進行群落結(jié)構(gòu)分析，可以從兩個角度來入手。一是群落結(jié)構(gòu)分布柱狀圖，可以展示不同樣本或者分組整體群落的構(gòu)成，以及構(gòu)成之間的差異；二是群落結(jié)構(gòu)分布Heatmap圖：可直觀展示物種在門綱目科水平的豐度高低。首先，根據(jù)圖4-A在門水平上群落結(jié)構(gòu)分布柱狀圖，我們在穩(wěn)定型冠心病組中發(fā)現(xiàn)主要以四大門為主（總占比大于99%），按照占比情況從高到低分別是厚壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文31GenusLevelBarplot(C)圖4在各分類水平上的序列注釋程度柱形圖（門、綱、屬）說明：treatment代表穩(wěn)定型冠心病組；Control代表健康對照組3.5樣本共有物種分析OTU的豐度揭示了樣本腸道菌群的豐富程度。根據(jù)分組里每個樣本的OTU的豐度可計算出每個樣本或組間共同擁有和特有的OTU，可用Veen圖表示。從圖5可看出共有OTU數(shù)是780個，穩(wěn)定型冠心病組特有OTU數(shù)是415個，健康對照組特有OTU數(shù)是174個，兩組共有OTU數(shù)是191個。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]《中國心血管病報告2018》概要[J]. 胡盛壽,高潤霖,劉力生,朱曼璐,王文,王擁軍,吳兆蘇,李惠君,顧東風(fēng),楊躍進,鄭哲,陳偉偉.  中國循環(huán)雜志. 2019(03)
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碩士論文
[1]腸道菌群與糖尿病發(fā)生關(guān)系的研究[D]. 王娜.大連醫(yī)科大學(xué) 2011



本文編號：3226042