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冠心病代謝組-全基因組關(guān)聯(lián)性研究及臨床預(yù)后相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-15 14:19
   冠心病(CAD)患病率及死亡率在全世界范圍內(nèi)居高不下,是一種由環(huán)境因素和多基因共同參與的復(fù)雜代謝性疾病。盡管許多與冠心病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的SNP位點(diǎn)通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)性研究被鑒定出來(lái),但是很多位點(diǎn)仍存在解釋能力不足和機(jī)制不明朗等問(wèn)題,而且針對(duì)中國(guó)人群的研究比較稀缺。將血脂水平和代謝組作為基因型到臨床表型的中間表型,在全基因組關(guān)聯(lián)性研究中可以提供強(qiáng)大的效應(yīng),利于研究人員發(fā)現(xiàn)影響冠心病的功能性的位點(diǎn),且在為基因位點(diǎn)致病機(jī)制研究提供內(nèi)在聯(lián)系和參考。為此,本研究擬通過(guò)針對(duì)中國(guó)冠心病患者的血脂水平和代謝組開展全基因組關(guān)聯(lián)性研究,發(fā)現(xiàn)中國(guó)人群中影響血脂水平和代謝性狀的功能性位點(diǎn),并分析候選位點(diǎn)與冠心病疾病嚴(yán)重程度和臨床終點(diǎn)事件的相關(guān)性,以探究候選位點(diǎn)的預(yù)后預(yù)測(cè)價(jià)值。首先,在1443例中國(guó)CAD患者組成的隨訪隊(duì)列中(1)考察血脂水平對(duì)冠心病嚴(yán)重程度(SYNTAX評(píng)分)、死亡事件和主要心血管不良事件(MACE)風(fēng)險(xiǎn)的影響。結(jié)果表明血脂異常,包括升高的總膽固醇(TC)、低密度脂蛋白膽固醇(LDLC)和脂蛋白(a)[Lp(a)]以及降低的載脂蛋白(a)、高密度脂蛋白膽固醇(HDLC)是冠心病嚴(yán)重程度和(或)臨床終點(diǎn)事件的危險(xiǎn)因素;(2)針對(duì)血脂水平開展全基因組關(guān)聯(lián)性研究。發(fā)現(xiàn)LPA基因上的rs73596816、rs9355297、rs7770628、SLC22A2 基因上的 rs144217738 與 Lp(a)水平,CETP 基因上的rs17231506與HDLC水平,APOA5基因上的rs651821與甘油三酯(TG)水平存在顯著關(guān)聯(lián)性(P2.09E-08)。(3)LPA基因上的rs7770628與高SYNTAX評(píng)分風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[多因素分析:OR(95%CI):1.29(1.01-1.64);P=0.0412]。此外,在1028例CAD患者中(1)開展針對(duì)代謝組的全基因組關(guān)聯(lián)性研究,準(zhǔn)確重復(fù)出10個(gè)以往報(bào)道的SNP與代謝物的關(guān)聯(lián)性(P0.05),發(fā)現(xiàn)13個(gè)代謝數(shù)量性狀基因座(mQTL,P4.97e-10),包括以往報(bào)道的ACADS、ACSM5、FADS2、SLC22A4/SLC22A5,以及新發(fā)現(xiàn)的 ELF1、ASXL3、ACSM2B、FBXL14、RPS29、FOXN3、SLC10A1 和 LINC00910。(2)通過(guò)對(duì)候選 mQTL 與臨床特征進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)FADS2rs174578與降低的TG水平,RPS29rs61980720與升高的 BMI 存在顯著關(guān)聯(lián)(P0.001,FDR0.01)。此外,FADS2rs174578、rs2727265 與 Lp(a)分別與 Lp(a)和 BMI 存在一定關(guān)聯(lián)性(P0.05,FDR0.1),此外,ACADS rs9204與BNP水平呈名義上顯著相關(guān)(P=0.0182)。(3)通過(guò)對(duì)候選mQTL與SYNTAX評(píng)分和臨床終點(diǎn)事件進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)FOXN3 rs79602030 與 SYNTAX 評(píng)分升高存在相關(guān)性(P0.05),ACSM5 rs9929808 和SLC10A1 rs2296651分別與死亡和MACE風(fēng)險(xiǎn)降低相關(guān)(P0.05)。最后,既往研究及本研究提示色氨酸通路代謝物及其mQTL與冠心病預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)之間存在潛在關(guān)聯(lián)。為此,本研究通過(guò)建立UPLC-MS/MS方法以對(duì)血漿色氨酸及其代謝物濃度(包括血漿色氨酸、犬尿氨酸、犬尿酸和吲哚-3-丙酸)進(jìn)行準(zhǔn)確測(cè)定,并成功應(yīng)用于檢測(cè)375例冠心病患者的血漿色氨酸通路代謝物。此外,通過(guò)mQTL與色氨酸代謝物水平的關(guān)聯(lián)分析,成功重復(fù)出上述發(fā)現(xiàn)的mQTL與色氨酸代謝物(ACSM5、ACSM2B與吲哚-3-丙酸,SLC7A5與犬尿氨酸)之間的關(guān)聯(lián)性。綜上所述,本研究是首個(gè)在中國(guó)人群中全面開展針對(duì)血脂水平和代謝組的全基因組關(guān)聯(lián)性研究,發(fā)現(xiàn)與血脂水平和代謝性狀的變異位點(diǎn),并進(jìn)一步考察候選位點(diǎn)與冠心病嚴(yán)重程度和臨床終點(diǎn)事件風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。本研究為人種特異性的“遺傳圖譜”以及冠心病預(yù)后不良的遺傳風(fēng)險(xiǎn)和精準(zhǔn)醫(yī)療提供參考。
【學(xué)位單位】:華南理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R541.4
【部分圖文】:

血脂水平,關(guān)聯(lián)性分析,總膽固醇,曼哈頓


圖5血脂水平全基因組關(guān)聯(lián)性分析的曼哈頓圖逡逑(A)總膽固醇;(B)甘油鳶酯;(C)商密度脂蛋白膽?

擴(kuò)增曲線,拷貝數(shù),相關(guān)性分析,位點(diǎn)


華南理3:大學(xué)碩士學(xué)位論文i)相關(guān)的SNP位點(diǎn)與KIV-2片段拷貝數(shù)的關(guān)系逡逑探究Lp(a)相關(guān)的SNP位點(diǎn)的獨(dú)立性,我們通過(guò)qPCR在本拿節(jié)研入選的643例患者,測(cè)定KIV-2與內(nèi)參基_邋RNAP的ACT值,從段拷貝數(shù)進(jìn)行相對(duì)定M擴(kuò)增曲線如圖6)。結(jié)果顯.示,KIV-2拷貝數(shù)A中的分布為1.97士邋0.84。結(jié)果如圖7所示,通過(guò)Linear西尃分析,貝數(shù)的邋ACT邋值與邋Lp(a)水平雖負(fù)相關(guān)(Estimates邋士邋SE:邋_5.5邋±邋I.55,邋,該結(jié)果與文獻(xiàn)報(bào)道相符。■然后.,利用多元Linear邋Mfc:分析,我們將LpSNP與ACT值苘時(shí)納入模型中以評(píng)價(jià)其獨(dú)立性,且年齡、性別作為校正s結(jié)果如表10顯示,4個(gè)SNP位點(diǎn)與Lp⑷之間的關(guān)聯(lián)性是獨(dú)貝數(shù)變異的,即納入ACT后SNP仍然與Lp(a)顯著相關(guān)^逡逑圖6邋qPCR測(cè)定KIV-2拷貝數(shù)變異擴(kuò)增曲線圖逡逑

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9 王s

本文編號(hào):2819073


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