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冠狀動脈支架內(nèi)再狹窄相關(guān)miRNA表達譜分析和功能研究

發(fā)布時間:2018-02-28 19:27

  本文關(guān)鍵詞: 冠心病 支架內(nèi)再狹窄 miRNA 靶基因 生物信息學 出處:《青島大學》2016年博士論文 論文類型:學位論文


【摘要】:背景Micro RNA(mi RNA)是一類在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達的非編碼RNA,目前發(fā)現(xiàn)它廣泛參與了心血管疾病各個過程。支架內(nèi)再狹窄(ISR)目前已經(jīng)成為冠脈介入治療術(shù)后有待解決的重大難題,現(xiàn)推測mi RNA可能在ISR中發(fā)揮重要作用。本研究將對mi RNA在ISR發(fā)病機制中的作用進行初步探討。目的篩選出ISR患者特異性表達的mi RNA,分析其相對表達量與臨床的相關(guān)性,初步探討mi RNA及其靶基因在ISR中可能的作用機制。方法通過mi RNA基因芯片技術(shù)篩選ISR患者血漿mi RNA的表達譜差異,以篩選出與ISR相關(guān)的mi RNA;通過Real-time PCR對mi RNA的相對表達量與ISR進行相關(guān)性分析及驗證,最終將篩選出特異性的mi RNA用作ISR高危人群的標記物;通過生物信息學技術(shù)對mi RNA靶基因進行預測,并對mi RNA的下游靶基因網(wǎng)絡(luò)進行數(shù)據(jù)挖掘,構(gòu)建ISR相關(guān)mi RNA-Gene-Network網(wǎng)絡(luò),探討其在ISR中可能的作用機制。結(jié)果通過高通量mi RNA芯片檢測,篩選獲得了一批在ISR患者中差異表達的mi RNA,其中43個基因表達下調(diào),10個基因表達上調(diào)。通過生物信息學方法及Real-time PCR對基因芯片結(jié)果進行了分析及驗證,通過比較及ROC曲線分析,發(fā)現(xiàn)hsa-mi R-126可以作為冠心病患者ISR早期診斷的潛在分子標志物,血漿hsa-mi R-126水平下降傾向于發(fā)生ISR。通過生物信息學方法,預測了mi R-126的靶基因,構(gòu)建了mi R-126及其靶基因的信號通路,并發(fā)現(xiàn)了16個潛在Gene靶點和24個潛在mi RNA靶點可能也參與了該信號網(wǎng)絡(luò),而這些潛在的靶點中也可能存在ISR的關(guān)鍵基因。結(jié)論本研究表明mi RNA在ISR發(fā)病中起重要作用,hsa-mi R-126下降可以作為冠心病患者支架術(shù)后容易發(fā)生ISR的早期診斷標志物。但hsa-mi R-126在ISR中的作用機制復雜,它可能通過調(diào)控多個途徑中的靶基因來參與ISR的發(fā)生和發(fā)展過程。
[Abstract]:Background Micro RNA(mi is a kind of non-coding RNAs that regulate gene expression at post-transcriptional level. It has been found that it is widely involved in various processes of cardiovascular disease. Restenosis in stent has become a major problem to be solved after coronary intervention. It is speculated that mi RNA may play an important role in ISR. This study will explore the role of mi RNA in the pathogenesis of ISR. To explore the possible mechanism of mi RNA and its target gene in ISR. Methods the difference of expression profiles of mi RNA in plasma of ISR patients was screened by mi RNA gene chip technique. The relative expression of mi RNA and ISR were analyzed and verified by Real-time PCR. Finally, the specific mi RNA was used as marker of ISR high risk population. The target gene of mi RNA was predicted by bioinformatics, and the downstream target gene network of mi RNA was mined to construct the ISR related mi RNA-Gene-Network network. The possible mechanism of its role in ISR was discussed. The results were detected by high throughput mi RNA chip. A batch of differentially expressed miRNAs were obtained in patients with ISR. Among them, 43 genes were down-regulated and 10 genes were up-regulated. The microarray results were analyzed and verified by bioinformatics and Real-time PCR, and the results were analyzed by comparison and ROC curve analysis. It was found that hsa-mi R-126 could be used as a potential molecular marker for early diagnosis of ISR in patients with coronary heart disease, and that the decrease of plasma hsa-mi R-126 level tended to cause ISR.The target gene of miR-126 was predicted by bioinformatics, and the signal pathway of miR-126 and its target gene was constructed. 16 potential Gene targets and 24 potential mi RNA targets may also be involved in the signaling network. The key genes of ISR may also exist in these potential targets. Conclusion this study suggests that the decrease of mi RNA may play an important role in the pathogenesis of ISR. The decrease of hsa-mi R-126 may be used as an early diagnostic marker of ISR in patients with coronary heart disease. But the mechanism of hsa-mi R-126 in ISR is complicated. It may be involved in the genesis and development of ISR by regulating the target genes in multiple pathways.
【學位授予單位】:青島大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R541.4

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本文編號:1548632

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