本文關(guān)鍵詞：基于分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜心臟疾病發(fā)生機(jī)制研究

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【摘要】：心臟疾病現(xiàn)今已經(jīng)是人類健康的最大敵人之一,而急性心肌梗塞疾病又是一種常見(jiàn)的心血管疾病,它的發(fā)病主要是由于動(dòng)脈血管阻塞造成心肌細(xì)胞缺血壞死,對(duì)心臟會(huì)帶來(lái)永久性損傷,嚴(yán)重者甚至?xí){生命。該疾病在臨床上主要表現(xiàn)為胸腔劇烈疼痛,白細(xì)胞和血清酶均會(huì)升高,心電圖型也會(huì)發(fā)生變化。在急性心肌梗塞發(fā)病的過(guò)程中,也會(huì)引起房顫、心衰等其他心臟并發(fā)癥,嚴(yán)重威脅著人們的健康。由于急性心肌梗塞的突發(fā)性、高致死率以及發(fā)病前期癥狀不明顯,給疾病的預(yù)防、診斷和治療帶來(lái)很大困難。隨著微陣列技術(shù)的發(fā)展,人們獲得的微陣列芯片數(shù)據(jù)日益增多,分析和利用生物芯片數(shù)據(jù),可以在分子水平上理解疾病的發(fā)生發(fā)展。對(duì)于心肌梗塞疾病來(lái)說(shuō),利用基因表達(dá)譜進(jìn)行早期診斷可以有效的預(yù)防該疾病的誘發(fā),而從基因?qū)用嫔侠斫饧毙孕募」Ｈ陌l(fā)病機(jī)制,能夠?yàn)橹委熢摷膊√峁┮环N新的思路。本文采用基因微陣列生物信息學(xué)分析方法,二次挖掘急性心肌梗塞外周血全基因組數(shù)據(jù),識(shí)別急性心機(jī)梗塞疾病相關(guān)的新生物特征,分析關(guān)鍵致病因子,為以后開(kāi)展研究急性心肌梗塞分子機(jī)制提供參考和依據(jù),其主要內(nèi)容如下：(1)識(shí)別和分析急性心肌梗塞發(fā)病相關(guān)的差異表達(dá)基因,主要采用獨(dú)立t檢驗(yàn)方式,提取了79個(gè)與急性心肌梗塞相關(guān)的差異表達(dá)基因；然后利用ROC曲線判斷所選的差異表達(dá)基因分類效果,對(duì)其可信度評(píng)估。(2)本文對(duì)上述選出的差異表達(dá)基因進(jìn)行富集分析,提取并分析了與急性心肌梗塞相關(guān)的生物信息,發(fā)現(xiàn)了8個(gè)生物功能、12個(gè)生物過(guò)程、7個(gè)細(xì)胞組成成分及19個(gè)相關(guān)通道,其中包括已經(jīng)被證實(shí)與疾病相關(guān)生物信息與通道。然后通過(guò)閱讀文獻(xiàn),查找與急性心肌梗塞相關(guān)的miRNAs,利用靶基因預(yù)測(cè)技術(shù),構(gòu)建miRNAs參與的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)分析發(fā)現(xiàn)了三個(gè)重要的miRNAs,利用GO分析和Pathway分析,觀察重要miRNA分子的生物意義,發(fā)現(xiàn)其主要作用在酶調(diào)節(jié)、蛋白結(jié)合,并且在細(xì)胞代謝、生理等過(guò)程有參與,以及參與了表皮生長(zhǎng)因子受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路；又利用相關(guān)性模型和貝葉斯理論構(gòu)建了兩個(gè)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò);最后對(duì)三個(gè)網(wǎng)絡(luò)做節(jié)點(diǎn)分析,尋找到了6個(gè)重要節(jié)點(diǎn),并且逐一分析位于重要節(jié)點(diǎn)的基因在疾病發(fā)生和發(fā)展中的功能與作用。
【關(guān)鍵詞】：急性心肌梗塞 分子生物特征 差異表達(dá)基因 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) miRNAs
【學(xué)位授予單位】：電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R541
【目錄】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 第一章 緒論10-17
• 1.1 課題研究的意義和目的10-12
• 1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀12-15
• 1.2.1 急性心肌梗塞的國(guó)內(nèi)外現(xiàn)狀12-13
• 1.2.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的發(fā)展現(xiàn)狀13-15
• 1.3 本文的主要內(nèi)容及結(jié)構(gòu)安排15-16
• 1.4 本文的創(chuàng)新點(diǎn)16-17
• 第二章 算法理論基礎(chǔ)及相關(guān)知識(shí)17-24
• 2.1 理論論述17-21
• 2.1.1 獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)與假陽(yáng)性發(fā)現(xiàn)率17
• 2.1.2 ROC曲線分析17-18
• 2.1.3 貝葉斯網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建18-20
• 2.1.4 相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建20-21
• 2.2 分析工具介紹21-22
• 2.2.1 富集分析21-22
• 2.2.2 miRNAs關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(kù)22
• 2.3 本章小結(jié)22-24
• 第三章 急性心肌梗塞相關(guān)差異表達(dá)基因提取與分析24-37
• 3.1 引言24
• 3.2 數(shù)據(jù)介紹24-27
• 3.2.1 基因數(shù)據(jù)介紹24-26
• 3.2.2 miRNAs數(shù)據(jù)選取依據(jù)26-27
• 3.3 差異表達(dá)基因提取步驟與結(jié)果27-34
• 3.4 ROC曲線分析結(jié)果34-36
• 3.5 本章小結(jié)36-37
• 第四章 急性心肌梗塞的重要生物信息分析與基因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建37-49
• 4.1 引言37-38
• 4.2 基于基因網(wǎng)絡(luò)的急性心肌梗塞相關(guān)生物信息分析38-42
• 4.2.1 GO分析38-40
• 4.2.2 信號(hào)通路推斷40-42
• 4.3 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建步驟與結(jié)果42-47
• 4.3.1 貝葉斯網(wǎng)絡(luò)構(gòu)造節(jié)點(diǎn)連接依據(jù)及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果42-43
• 4.3.2 相關(guān)性構(gòu)建節(jié)點(diǎn)連接及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果43-44
• 4.3.3 關(guān)聯(lián)性miRNAs選取方式及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分析44-45
• 4.3.4 整體混合網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與關(guān)鍵性節(jié)點(diǎn)分析45-47
• 4.4 本章小結(jié)47-49
• 第五章 總結(jié)和展望49-51
• 5.1 全文總結(jié)49-50
• 5.2 后續(xù)工作與展望50-51
• 致謝51-52
• 參考文獻(xiàn)52-55
• 攻讀碩士期間取得的研究成果55

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1108701