乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染是當(dāng)前嚴(yán)重威脅人類健康的病毒性疾病之一。我國(guó)正處于乙型肝炎的高發(fā)地區(qū),是乙肝患者大國(guó)。microRNA (miRNA)是一種廣泛存在于真核生物中的的內(nèi)源性單鏈小分子RNA,它可以與靶基因序列進(jìn)行特異性地結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄或翻譯水平實(shí)現(xiàn)負(fù)調(diào)控。近年來(lái),miRNA在乙肝研究中逐漸成為熱點(diǎn),許多研究證實(shí)microRNA (miRNA)可以介導(dǎo)宿主與病毒之間的相互作用,闡明miRNA在HBV感染中的作用有助于新型治療策略的提出。然而,miRNA的多靶點(diǎn)特性限制了其功能研究。為了研究miRNA對(duì)HBV的調(diào)節(jié)機(jī)制,本文在靶基因水平上比較了HBV相關(guān)miRNA和HBV蛋白的功能譜,采用半定量手段進(jìn)行功能分析并從網(wǎng)絡(luò)層面挖掘其潛在的作用模式。結(jié)果表明,在靶基因水平上,miRNA功能較為集中,HBV蛋白的作用效應(yīng)可能更為廣泛；在網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)上,miRNA主要通過(guò)直接作用于HBV蛋白的靶基因及其鄰居節(jié)點(diǎn)達(dá)到其調(diào)節(jié)作用；在生理效應(yīng)上,miRNA在凋亡、細(xì)胞周期以及體液免疫的調(diào)節(jié)上呈現(xiàn)出拮抗HBV蛋白效應(yīng)的趨勢(shì)。本研究不僅為miRNA的靶點(diǎn)功能研究提供...

【文章頁(yè)數(shù)】：70 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 乙型肝炎病毒
        1.1.1 HBV病毒顆粒特征
        1.1.2 HBV的流行病學(xué)
        1.1.3 HBV相關(guān)疾病的病程發(fā)展和治療
        1.1.4 HBV研究現(xiàn)狀
    1.2 MicroRNA參與調(diào)控多種生物過(guò)程
        1.2.1 MicroRNA的產(chǎn)生和作用機(jī)制
        1.2.2 MicroRNA與疾病
        1.2.3 MicroRNA研究現(xiàn)狀
    1.3 研究miRNA對(duì)HBV調(diào)節(jié)機(jī)制的必要性及可行性
    1.4 課題研究的目的與意義
第2章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    2.1 數(shù)據(jù)的收集和預(yù)處理
        2.1.1 HBV蛋白靶點(diǎn)數(shù)據(jù)收集
        2.1.2 HBV相關(guān)的miRNA靶點(diǎn)數(shù)據(jù)收集
        2.1.3 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA表達(dá)水平的確定
    2.2 GO分析
        2.2.1 GO富集分析
        2.2.2 GO譜相似性分析
        2.2.3 靶點(diǎn)作用模式的判定
    2.3 網(wǎng)絡(luò)分析
        2.3.1 構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
        2.3.2 構(gòu)建最小子網(wǎng)絡(luò)
        2.3.3 構(gòu)建核心網(wǎng)絡(luò)
        2.3.4 網(wǎng)絡(luò)參數(shù)的計(jì)算
        2.3.5 網(wǎng)絡(luò)分解
    2.4 圖形展示
        2.4.1 Cytoscape軟件
        2.4.2 Microsoft office visio軟件
        2.4.3 MEGA軟件
    2.5 工作流程
第3章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的數(shù)據(jù)收集和統(tǒng)計(jì)
    3.1 HBV蛋白靶基因
    3.2 HBV-miRNA靶基因
    3.3 本章小結(jié)
第4章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的GO功能譜分析
    4.1 GO富集分析
    4.2 GO譜的相似性
    4.3 GO功能分區(qū)
    4.4 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因?qū)O生理過(guò)程的作用模式統(tǒng)計(jì)
    4.5 本章小結(jié)
第5章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的網(wǎng)絡(luò)特征
    5.1 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的網(wǎng)絡(luò)特征
    5.2 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    5.3 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的核心網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
        5.3.1 兩組靶基因?qū)Φ蛲鲞^(guò)程的調(diào)節(jié)
        5.3.2 兩組靶基因?qū)γ庖叩恼{(diào)節(jié)
        5.3.3 兩組靶基因?qū)?xì)胞周期的調(diào)節(jié)
        5.3.4 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因呈拮抗模式
    5.4 本章小結(jié)
第6章 結(jié)論與展望
    6.1 結(jié)論
    6.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
科研成果



本文編號(hào)：3911481