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基于CRISPR/Cas9技術(shù)研究Gp96在小鼠急性酒精性肝損傷中的作用

發(fā)布時(shí)間:2021-09-12 17:04
  目的本課題在CRISPR/Cas9技術(shù)的支持下,通過(guò)基因編輯Gp96序列,抑制其基因表達(dá),研究Gp96在急性酒精性肝損傷過(guò)程中的作用及調(diào)控的分子機(jī)制。方法(一)設(shè)計(jì)質(zhì)粒:NCBI中檢索Gp96相關(guān)基因序列,在外顯子中查找人鼠相同的Gp96基因序列,根據(jù)二者的蛋白保守功能域位置,將靶向突變的目標(biāo)序列(CRISPR)設(shè)計(jì)在外顯子49。將外顯子4至外顯子9進(jìn)行序列比對(duì),共發(fā)現(xiàn)6個(gè)相同的CRISPR序列位置,但經(jīng)脫靶率分析后最終設(shè)計(jì)出3個(gè)CRISPR序列,并構(gòu)建三種質(zhì)粒。(二)有效sgRNA篩選及驗(yàn)證:將合成的三種質(zhì)粒1:1:1混合轉(zhuǎn)染小鼠成肌細(xì)胞C2C12,嘌呤酶素篩選轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞,提取DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增、電泳、膠回收進(jìn)行測(cè)序及有效sgRNA蛋白驗(yàn)證。(三)體外實(shí)驗(yàn):培養(yǎng)小鼠成肌細(xì)胞C2C12,分為三組,Normal組:不做任何處理;Normal+alcohol組:直接給予酒精誘導(dǎo)培養(yǎng);Gp96-sgRNA+alcohol組:將有效sgRNA進(jìn)行穩(wěn)定轉(zhuǎn)染后給予酒精誘導(dǎo)培養(yǎng)。CCK-8細(xì)胞活性增殖檢測(cè);Hoechst33258細(xì)胞凋亡染色;免疫印跡檢測(cè)相關(guān)因子表達(dá):熱... 

【文章來(lái)源】:河南科技大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 酒精性肝損傷概述
        1.1.1 酒精性肝損傷的流行病學(xué)
        1.1.2 酒精性肝損傷的病理學(xué)特點(diǎn)
    1.2 酒精性肝損傷機(jī)制
        1.2.1 酒精及其代謝產(chǎn)物對(duì)肝臟的毒作用
        1.2.2 氧化應(yīng)激與酒精性肝損傷
        1.2.3 細(xì)胞凋亡與酒精性肝損傷
    1.3 急性酒精性肝損傷模型的制備
    1.4 熱休克蛋白Gp96
        1.4.1 熱休克蛋白概述
        1.4.2 Gp96的分子結(jié)構(gòu)
        1.4.3 GP96的功能和應(yīng)用
    1.5 CRISPR/Cas9技術(shù)概述
        1.5.1 CRISPR/Cas9系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)
        1.5.2 CRISPR/Cas9系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)
        1.5.3 CRISPR/Cas9系統(tǒng)的作用機(jī)制
        1.5.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)應(yīng)用現(xiàn)狀
第2章 前言
第3章 材料與方法
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 細(xì)胞
        3.1.2 質(zhì)粒
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        3.1.4 主要儀器設(shè)備
        3.1.5 主要實(shí)驗(yàn)試劑
        3.1.6 主要溶液配制
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
        3.2.2 CRISPR/Cas9技術(shù)靶向突變小鼠Gp96基因三合一質(zhì)粒構(gòu)建
        3.2.3 細(xì)菌培養(yǎng)
        3.2.4 提取質(zhì)粒
        3.2.5 細(xì)胞培養(yǎng)
        3.2.6 確定最佳嘌呤酶素濃度
        3.2.7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
        3.2.8 嘌呤酶素篩選
        3.2.9 PCR技術(shù)檢測(cè)
        3.2.10 膠回收DNA
    3.3 體外實(shí)驗(yàn)
        3.3.1 免疫印跡蛋白檢測(cè)
        3.3.2 CCK-8細(xì)胞活性檢測(cè)
        3.3.3 Hoechst33258染色檢測(cè)細(xì)胞凋亡情況
    3.4 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)
        3.4.1 血清AST、ALT酶活性的檢測(cè)
        3.4.2 肝組織蠟塊包埋及組織切片制作
        3.4.3 HE染色檢測(cè)各組小鼠的肝臟損傷情況
        3.4.4 PAS法檢測(cè)各組小鼠肝臟中糖原的表達(dá)情況
        3.4.5 Hoechst33258染色法檢測(cè)小鼠的肝細(xì)胞凋亡情況
        3.4.6 免疫印跡蛋白檢測(cè)
    3.5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第4章 結(jié)果
    4.1 CRISPR/Cas9技術(shù)靶向突變小鼠GP96基因三合一質(zhì)粒
        4.1.1 設(shè)計(jì)CRISPR序列
        4.1.2 YSY線性化三合一CRISPR/Cas9質(zhì)粒構(gòu)建
        4.1.3 轉(zhuǎn)化子PCR驗(yàn)證
        4.1.4 轉(zhuǎn)化子的測(cè)序驗(yàn)證
    4.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染和sgRNA活性驗(yàn)證
        4.2.1 轉(zhuǎn)染效率檢測(cè)
        4.2.2 測(cè)序篩選sgRNA3為有效向?qū)NA
        4.2.3 免疫印記驗(yàn)證有效sgRNA3
    4.3 細(xì)胞活性檢測(cè)結(jié)果
    4.4 細(xì)胞Hoechst33258染色結(jié)果
    4.5 免疫印跡法檢測(cè)細(xì)胞蛋白表達(dá)結(jié)果
    4.6 小鼠血清ALT、AST酶活性的檢測(cè)結(jié)果
    4.7 肝臟組織HE染色結(jié)果
    4.8 肝臟組織PAS染色結(jié)果
    4.9 肝臟組織Hoechst33258染色結(jié)果
    4.10 免疫印跡法檢測(cè)組織蛋白的表達(dá)結(jié)果
第5章 討論
    5.1 Gp96與酒精誘導(dǎo)的細(xì)胞毒性作用
    5.2 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96與轉(zhuǎn)氨酶和組織損傷的關(guān)系
    5.3 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和糖原儲(chǔ)備的關(guān)系
    5.4 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和細(xì)胞凋亡的關(guān)系
    5.5 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96對(duì)肝細(xì)胞應(yīng)激分子HSP27、HSP70的影響
    5.6 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96對(duì)肝細(xì)胞增殖的作用
    5.7 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和VEGF的關(guān)系
    5.8 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和p-STAT3信號(hào)途徑的關(guān)系
    5.9 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和CYP2E1的關(guān)系
    5.10 小鼠急性酒精性肝損傷中Gp96和TNF-α的關(guān)系
    5.11 問(wèn)題與展望
第6章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略語(yǔ)詞匯表
附錄Ⅰ 圖及說(shuō)明
致謝
攻讀學(xué)位期間的研究成果


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3394609

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