本文關鍵詞：基于蛋白質互作網絡的鼻咽癌基因模塊化分析

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【摘要】：目的基于蛋白質互作網絡,篩選調節(jié)鼻咽癌的基因模塊,為鼻咽癌的分子診斷和治療提供新的靶點。方法利用GEO數(shù)據(jù)庫中鼻咽癌的數(shù)據(jù)集(GSE12452)和SAM軟件,篩選鼻咽癌中差異表達基因。利用String數(shù)據(jù)庫,建立鼻咽癌中差異表達基因的蛋白質互作網絡�；跇嫿ǖ木W絡,利用生物信息學模塊化分析方法篩選在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展過程中起重要作用的基因模塊。根據(jù)DAVID數(shù)據(jù)庫,對模塊進行GO分析,挖掘模塊的調控功能。結果本次研究中共篩選出在鼻咽癌中差異表達的基因2 634個。根據(jù)String數(shù)據(jù)庫,我們發(fā)現(xiàn)這些差異基因中共有4 729對蛋白質互作對,并據(jù)此建立鼻咽癌中的蛋白質互作網絡。利用模塊化分析篩選出蛋白質互作網絡中的7個基因模塊,GO分析顯示這些模塊的功能主要為調控細胞周期、糖代謝、細胞黏附、氧化還原反應等。結論鼻咽癌的蛋白質互作網絡中共有7個基因模塊,它們對鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展具有重要的調控作用,這些功能模塊的發(fā)現(xiàn)能夠為鼻咽癌的分子靶向診治提供新的切入點。
【作者單位】： 內蒙古醫(yī)科大學附屬醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【關鍵詞】： 鼻咽癌 蛋白質互作網絡 基因模塊化分析
【基金】：內蒙古自治區(qū)自然科學基金(2014MS0856) 內蒙古醫(yī)科大學科技百萬工程項目(KJbw2013014)
【分類號】：R739.63
【正文快照】： 鼻咽癌是發(fā)生在鼻咽上皮或鼻咽隱窩上皮的惡性腫瘤。由于解剖位置深、結構復雜、病理分化程度低、易轉移等因素,70%鼻咽癌患者在確診時已達Ⅲ、Ⅳ期。放射治療是鼻咽癌的主要治療手段,但是單一的放射治療只能使鼻咽癌患者的5年生存率達到50%左右,晚期鼻咽癌則更低[1-2]。研究

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本文編號：670834