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SD大鼠下丘的蛋白提取和分析

發(fā)布時(shí)間:2017-06-12 07:10

  本文關(guān)鍵詞:SD大鼠下丘的蛋白提取和分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:研究聽(tīng)覺(jué)傳導(dǎo)通路中下丘(Inferior colliculus, IC)的蛋白質(zhì)表達(dá)情況,找出下丘區(qū)域特異性蛋白,并進(jìn)一步分析其基因組成,以及各基因間的相互關(guān)系,從而探索IC在中樞聽(tīng)覺(jué)信息整合及處理中的作用及機(jī)制,為進(jìn)一步研究中樞聽(tīng)覺(jué)處理障礙(Central auditory processingdi sorders,CAPD)的發(fā)病機(jī)制提供一定的理論基礎(chǔ)。方法:對(duì)出生后60天體重230g左右的雄性SD大鼠的IC、耳蝸核(Cochlear Nucleus, CN)、上橄欖核復(fù)合體(Superior Oliver Complex, SOC)、端腦包括大腦皮層和小腦(Rest)這四個(gè)區(qū)域細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜的蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)行研究。(1)細(xì)胞質(zhì)蛋白采用熒光差異雙向電泳技術(shù)(Two dimension difference gel electrophoresis,2D-DIGE)進(jìn)行分離。(2)細(xì)胞膜蛋白采用同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobarictagsfor relative and absolute quantitation, iTRAQ)的方法進(jìn)行鑒定。采用質(zhì)譜分析對(duì)各蛋白點(diǎn)進(jìn)行定性定量分析,找出IC區(qū)域特異性蛋白,再對(duì)其進(jìn)行基因本體(Gene Ontology, GO)分析、京都基因與基因組百科全書(shū)(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析以及蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析,探索這些區(qū)域特異性蛋白的功能以及其在各通路中所起的作用,篩選出聽(tīng)覺(jué)處理障礙相關(guān)的目標(biāo)蛋白。結(jié)果:本實(shí)驗(yàn)最終通過(guò)2-D DIGE方法供檢測(cè)出4種IC區(qū)域特異性細(xì)胞質(zhì)蛋白,通過(guò)iTRAQ的方法共檢測(cè)出53種IC區(qū)域特異性膜蛋白。通過(guò)對(duì)這些蛋白進(jìn)行GO分析發(fā)現(xiàn)IC區(qū)域特異性蛋白主要起到了轉(zhuǎn)運(yùn)及蛋白定位,進(jìn)而調(diào)節(jié)神經(jīng)元生長(zhǎng)發(fā)育以及信息整合的作用。通過(guò)KEGG通路分析的方法對(duì)這些區(qū)域特異性蛋白所參與的通路進(jìn)行分析,可以看出其主要參與氧化磷酸化(Oxidativephosphorylation) ,興奮性突觸(Glutamatergic synapse)、抑制性突觸(GABAergic synapse).通過(guò)蛋白質(zhì)相互作用分析,發(fā)現(xiàn)CaMK2D,SV2A這兩種蛋白主要起到調(diào)節(jié)興奮性、抑制性神經(jīng)遞質(zhì)傳導(dǎo)及釋放功能。結(jié)論:(1)IC區(qū)域特異性蛋白主要參與興奮性突觸、抑制性突觸,維持興奮性-抑制性神經(jīng)遞質(zhì)平衡可能是IC進(jìn)行聽(tīng)覺(jué)處理、信息整合的關(guān)鍵。(2) CaMK2D,SV2A在IC中表達(dá)水平增高,二者起到維持下丘興奮性-抑制性神經(jīng)遞質(zhì)平衡的作用,這也是IC進(jìn)行信息整合的基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究是基礎(chǔ)性研究,需進(jìn)一步進(jìn)行功能驗(yàn)證其與CAPD的關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】:中樞聽(tīng)覺(jué)處理 下丘 蛋白質(zhì)組學(xué) 熒光差異雙向電泳 同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R764
【目錄】:
  • 中文摘要5-7
  • Abstract7-9
  • 引言9-11
  • 材料與方法11-19
  • 結(jié)果19-30
  • 討論30-36
  • 結(jié)論36-37
  • 參考文獻(xiàn)37-41
  • 文獻(xiàn)綜述41-57
  • 參考文獻(xiàn)50-57
  • 附錄1.攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況57-58
  • 附錄2.致謝58

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 彭賢;言語(yǔ)誘發(fā)反應(yīng)中頻率跟隨反應(yīng)部分的瞬時(shí)能量譜分析[D];南方醫(yī)科大學(xué);2012年


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本文編號(hào):443539

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