目的發(fā)現(xiàn)和鑒定在NPC轉(zhuǎn)移與非轉(zhuǎn)移患者中差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(lncRNAs),并預(yù)測(cè)它們潛在的生物學(xué)功能。方法利用高通量測(cè)序技術(shù)分別檢測(cè)2位非轉(zhuǎn)移性NPC患者及3位轉(zhuǎn)移性NPC患者血清中l(wèi)ncRNAs的表達(dá)情況,并通過(guò)基因本體(GO)及京都基因和基因組百科全書(shū)(KEGG)通路分析并預(yù)測(cè)lncRNAs潛在的生物學(xué)機(jī)制。結(jié)果與非轉(zhuǎn)移性NPC患者血清比較,轉(zhuǎn)移組中有2條高表達(dá)及12條低表達(dá)的lncRNAs(P<0.05)。其中在轉(zhuǎn)移組中低表達(dá)的lncRNA ENST00000610778差異倍數(shù)較大。這些lncRNAs對(duì)應(yīng)的周圍編碼蛋白質(zhì)的基因富集于翻譯、核糖體大亞基組裝、病毒轉(zhuǎn)錄等生物學(xué)過(guò)程及核糖體通路。結(jié)論在轉(zhuǎn)移與非轉(zhuǎn)移NPC患者血清中,存在差異表達(dá)的lncRNAs,它們可能具有特定的生物學(xué)功能,成為轉(zhuǎn)移性NPC診治的新靶標(biāo)。

【文章來(lái)源】： 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,55(11)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 標(biāo)本收集
    1.2 RNA提取和鑒定
    1.3 文庫(kù)構(gòu)建
    1.4 文庫(kù)質(zhì)檢
    1.5 上機(jī)測(cè)序
    1.6 測(cè)序數(shù)據(jù)分析和基因功能分析
    1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
    2.1 文庫(kù)質(zhì)量評(píng)估及測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
    2.2 lncRNAs相應(yīng)基因的GO分析
    2.3 lncRNAs周圍對(duì)應(yīng)mRNAs的KEGG通路分析
3 討論



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