眼睛是視覺(jué)系統(tǒng)的器官,具有接收和處理視覺(jué)細(xì)節(jié)的能力。它們檢測(cè)到光信號(hào)后將其轉(zhuǎn)換為神經(jīng)元中的電化學(xué)脈沖,然后傳遞給大腦。先前的一些研究已經(jīng)揭示了視網(wǎng)膜內(nèi)的細(xì)胞類(lèi)型,但是,并沒(méi)有研究聚焦于眼球中的細(xì)胞類(lèi)型以及它們?cè)谝曈X(jué)系統(tǒng)中的作用。此外,還存在著許多遺傳性眼睛疾病,對(duì)于這些疾病的研究與認(rèn)知尚需加深。在本文中,我們使用單細(xì)胞RNA測(cè)序的手段來(lái)處理實(shí)驗(yàn)小鼠,通過(guò)剝?nèi)∷璧膶?shí)驗(yàn)小鼠鞏膜以?xún)?nèi)眼睛組織,將其制備成單細(xì)胞懸液,進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序。獲得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)后,我們對(duì)實(shí)驗(yàn)組中表達(dá)量較高的基因進(jìn)行了分析,并查閱相關(guān)文獻(xiàn),找出了眼睛組織里不同的細(xì)胞類(lèi)型已經(jīng)被報(bào)道過(guò)的標(biāo)記基因和富集表達(dá)的基因。此外,我們將對(duì)照組小鼠鞏膜以?xún)?nèi)眼睛組織進(jìn)行冰凍切片來(lái)做抗體驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),并重復(fù)相關(guān)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),來(lái)了解不同的標(biāo)記基因在眼睛組織各部位的表達(dá)情況,以期找到鞏膜以?xún)?nèi)眼睛組織的新標(biāo)記基因,綜合探討小鼠鞏膜以?xún)?nèi)眼睛組織的主要細(xì)胞類(lèi)型及闡明與眼睛疾病相關(guān)的視覺(jué)生物學(xué)和基因表達(dá)模式。通過(guò)單細(xì)胞RNA測(cè)序,我們從實(shí)驗(yàn)組中獲得了鞏膜以?xún)?nèi)眼睛組織的1831個(gè)單細(xì)胞以及18237個(gè)表達(dá)的基因。在數(shù)據(jù)分析中通過(guò)t分布隨機(jī)鄰域嵌入發(fā)現(xiàn)了14個(gè)不同的... 

【文章來(lái)源】：電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：42 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

通過(guò)t-SNE識(shí)別的14個(gè)細(xì)胞簇以及鑒定出的細(xì)胞類(lèi)型利用LoupeCellBrowser軟件，我們分析了每個(gè)細(xì)胞的差異表達(dá)基因，并得到了顯著差異表達(dá)基因的heatmap(熱圖，熱圖可以展現(xiàn)數(shù)據(jù)的差異性，特別是面對(duì)

電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文4細(xì)胞的數(shù)量之和最高，約占細(xì)胞總數(shù)的58%。RGCs和αRGCs數(shù)量之和約占細(xì)胞總數(shù)的18%，是第二大的細(xì)胞簇。VECs數(shù)量最少，僅占細(xì)胞總數(shù)的1.2%。圖2-214種細(xì)胞類(lèi)型中顯著差異表達(dá)基因的熱圖圖2-314種細(xì)胞類(lèi)型中的一些新標(biāo)志物和已知標(biāo)志物本文的研究還證實(shí)了眼球中14種細(xì)胞類(lèi)型的細(xì)胞標(biāo)記（如圖2-3所示），例如文獻(xiàn)中報(bào)道過(guò)的視錐細(xì)胞標(biāo)志物Opn1mw[1]、Arr3[2]和Pde6c[10]，此外，筆者發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Gnat2，Kcne2和Pgc在視錐細(xì)胞中也有特異性表達(dá)。在本研究中還可以證實(shí)RGCs的標(biāo)記基因Thy1[5]，并發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Clec3b在RGCs中富集表達(dá)。對(duì)于晶狀體細(xì)胞標(biāo)志物，除了Bfsp1[11]、Crygn[12]和其他已報(bào)道過(guò)的晶體蛋白家族基因外，還篩選出了候選標(biāo)記基因Lctl。此外，筆者利用測(cè)序獲得的數(shù)據(jù)結(jié)果證實(shí)了αRGCs的標(biāo)記基因Spp1[13]和Kcng4[13]，并發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Edn3在

電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文4細(xì)胞的數(shù)量之和最高，約占細(xì)胞總數(shù)的58%。RGCs和αRGCs數(shù)量之和約占細(xì)胞總數(shù)的18%，是第二大的細(xì)胞簇。VECs數(shù)量最少，僅占細(xì)胞總數(shù)的1.2%。圖2-214種細(xì)胞類(lèi)型中顯著差異表達(dá)基因的熱圖圖2-314種細(xì)胞類(lèi)型中的一些新標(biāo)志物和已知標(biāo)志物本文的研究還證實(shí)了眼球中14種細(xì)胞類(lèi)型的細(xì)胞標(biāo)記（如圖2-3所示），例如文獻(xiàn)中報(bào)道過(guò)的視錐細(xì)胞標(biāo)志物Opn1mw[1]、Arr3[2]和Pde6c[10]，此外，筆者發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Gnat2，Kcne2和Pgc在視錐細(xì)胞中也有特異性表達(dá)。在本研究中還可以證實(shí)RGCs的標(biāo)記基因Thy1[5]，并發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Clec3b在RGCs中富集表達(dá)。對(duì)于晶狀體細(xì)胞標(biāo)志物，除了Bfsp1[11]、Crygn[12]和其他已報(bào)道過(guò)的晶體蛋白家族基因外，還篩選出了候選標(biāo)記基因Lctl。此外，筆者利用測(cè)序獲得的數(shù)據(jù)結(jié)果證實(shí)了αRGCs的標(biāo)記基因Spp1[13]和Kcng4[13]，并發(fā)現(xiàn)候選標(biāo)記基因Edn3在


本文編號(hào)：3341102