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SOX11在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤中的表達(dá)及意義

發(fā)布時(shí)間:2021-01-29 08:37
  目的探討轉(zhuǎn)錄因子SOX11在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(RB)中的表達(dá)及與其表達(dá)相關(guān)的基因和細(xì)胞通路。方法在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心的GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載包含76例RB患者癌組織全mRNA表達(dá)譜的公共數(shù)據(jù)集gse59983。根據(jù)15個(gè)標(biāo)記基因表達(dá)情況將其分為細(xì)胞周期標(biāo)記基因組(組1)、椎光感受器標(biāo)記基因組(組2)及視桿光感受器標(biāo)記基因(組3)。組1、組2、組3分別包含26、4、46例患者。利用R2生物信息平臺(tái)(http://r2.amc.nl)分析gse59983公共數(shù)據(jù)集,觀察3組患者癌組織中SOX11的表達(dá),同時(shí)確定SOX11相關(guān)基因。根據(jù)基因相關(guān)性,繪制聚類熱圖,通過(guò)京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析工具、基因注釋(GO)分析法對(duì)SOX11的相關(guān)基因及通路進(jìn)行初步分析。結(jié)果組1患者癌組織中SOX11表達(dá)明顯高于組2、組3,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001);組3患者癌組織中SOX11表達(dá)明顯高于組2,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。共檢測(cè)出與SOX11表達(dá)顯著相關(guān)的基因4524個(gè);其中,正相關(guān)基因2139個(gè),負(fù)相關(guān)基因2385個(gè)。篩選SOX11及與其關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的16... 

【文章來(lái)源】:中華眼底病雜志. 2020,36(06)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)


本文編號(hào):3006598

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