發(fā)布時(shí)間：2020-12-25 15:42

　　目的比較2株分離自手足口�。╤and,foot and mouth disease,HFMD）和皰疹性咽峽炎（herpangina,HA）患者糞便樣品中的柯薩奇病毒A組10型（Coxsackievirus A10,CA10）全基因組差異及基因特征,探討基因突變可能導(dǎo)致的臨床癥狀差異。方法收集昆明市兒童醫(yī)院經(jīng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果為CA10陽性的HFMD及HA患者糞便樣品,在敏感細(xì)胞人橫紋肌瘤細(xì)胞（rhabdomyoma,RD）上培養(yǎng)并分離出CA10。設(shè)計(jì)特異性引物擴(kuò)增獲得CA10全基因序列,通過BioEdit軟件比較分離自HFMD及HA患者的CA10基因序列核苷酸與編碼氨基酸之間的差異。從NCBI基因庫（https://www.ncbi.nlm.nih.gov）中下載CA10 VP1基因序列作為參考序列,系統(tǒng)進(jìn)化樹分析分離獲得的昆明CA10流行株的進(jìn)化情況及來源。結(jié)果分離自HFMD和HA患者的CA10-HFMD和CA10-HA的VP1區(qū)域核苷酸同源性為99. 1%,氨基酸同源性為99. 8%,且存在2個(gè)非同義突變位點(diǎn);全基因序列核苷酸同源性為98. 9%,編碼區(qū)氨基酸同源性為99.... 

【文章來源】：中國生物制品學(xué)雜志. 2020年08期

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

CA10感染RD細(xì)胞后的CPE觀察（×10)

CA10基因PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定，在738 bp處可見特異性擴(kuò)增條帶，見圖2，經(jīng)測(cè)序和BLAST比對(duì)分析確認(rèn)為CA10。利用設(shè)計(jì)好的全基因引物，經(jīng)PCR擴(kuò)增，成功獲得CA10全基因片段，見圖3，經(jīng)雙向測(cè)序和拼接獲得來自HFMD和HA患者的CA10全基因序列CA10-HFMD和CA10-HA。2.3 CA10-HFMD與CA10-HA基因序列及特征分析

圖3 CA10全基因序列的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig 3.Electrophoretic profile of PCR product of whole CA10 genome圖4 CA10原型株（AY421767）及2株昆明CA10分離株的編碼區(qū)（CDS）氨基酸序列比較


本文編號(hào)：2937943