本文選題：人　切入點(diǎn)：胚胎干細(xì)胞　出處：《湖南科技大學(xué)》2015年碩士論文

【摘要】：年齡性黃斑變性(AMD)是全世界范圍內(nèi)老年人視力受損和喪失的首要原因。AMD是一種視網(wǎng)膜黃斑變性的眼疾,至今都沒有特效治療手段。近年來發(fā)展了用干細(xì)胞衍生視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞(RPE)作為AMD替代性治療的新方案。胚胎干細(xì)胞(ESC)分化成RPE的過程中涉及很多基因的表達(dá)變化,包括micro RNA(mi RNA)的表達(dá)變化。為了揭示mi RNA在這個細(xì)胞分化轉(zhuǎn)變過程的變化和作用,本研究首次系統(tǒng)地研究了人類ESC分化成RPE的四個階段的mi RNA的表達(dá)水平變化、階段特異性表達(dá)的mi RNA、不同分化階段優(yōu)勢表達(dá)臂轉(zhuǎn)換的mi RNA與isomi R中編輯位點(diǎn)位于“seed”區(qū)的mi RNA的潛在功能變化,即在細(xì)胞分化中的mi RNA的表達(dá)水平、表達(dá)模式和序列多樣性,以及相關(guān)功能等四個方面的變化。研究結(jié)果具體體現(xiàn)在以下方面:1.在干細(xì)胞分化為RPE細(xì)胞的四個階段中,檢測到了941個已知的mi RNA前體,發(fā)現(xiàn)了113個新的mi RNA發(fā)卡及其表達(dá)的196個mi RNA。2.與干細(xì)胞分化的第一階段相比較,在第四階段顯著上調(diào)的mi RNA有205個,下調(diào)的有295個,第二階段有172個顯著上調(diào)和175個顯著下調(diào)的mi RNA,在第三階段有227個顯著上調(diào)和331個顯著下調(diào)的mi RNA。另外,三個ESC已分化的階段中表達(dá)模式一致的有93個顯著上調(diào)和124個顯著下調(diào)的mi RNA。分析第四階段已分化的RPE細(xì)胞與ESC細(xì)胞間的差異表達(dá)mi RNA大致的相關(guān)功能后,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)在RPE細(xì)胞中下調(diào)mi RNA的靶標(biāo)的最富集的GO術(shù)語和上調(diào)mi RNA靶標(biāo)的相類似,因?yàn)樗鼈兿碛懈髯源蟛糠值陌袠?biāo)集。3.發(fā)現(xiàn)了107個優(yōu)勢表達(dá)的、與mi RBase中記錄的標(biāo)準(zhǔn)的mi RNA序列不一致的5′-isomi R序列,而在所有階段所有細(xì)胞都優(yōu)勢表達(dá)的isomi R共有19個;這19個優(yōu)勢表達(dá)的5′-isomi R與其對應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)型mi RNA的功能分析結(jié)果表明盡管它們之間分享超過一半的過度呈現(xiàn)的生物學(xué)過程(P-value0.01),但這兩組mi RNA還是各自參與了明顯不同生物過程。4.在24個不同的mi RNA中鑒定了27個統(tǒng)計顯著性的A-to-I編輯位點(diǎn),這些位點(diǎn)均不是已知的SNP位點(diǎn);絕大多數(shù)這些位點(diǎn)位于成熟mi RNA的“seed”區(qū),并且除了hsa-mi R-381-3p中的編輯事件發(fā)生在ESC細(xì)胞分化的早期,其它的均發(fā)生在ESC細(xì)胞分化的晚期。有九個推斷的A-to-I編輯位點(diǎn)得到了已有實(shí)驗(yàn)結(jié)果的驗(yàn)證。同時發(fā)現(xiàn)編輯mi RNA和相應(yīng)的未編輯mi RNA的功能存在很大的變化。5.人類ESC分化成RPE的各階段間有14個mi RNA前體產(chǎn)生的mi RNA存在明顯的臂選擇傾向性表達(dá)的這種現(xiàn)象。這14個臂轉(zhuǎn)換的pre-mi RNA共表達(dá)了27個mi RNA。mi RNA靶標(biāo)的功能分析表明在ESC分化為RPE細(xì)胞過程中的這些優(yōu)勢表達(dá)臂轉(zhuǎn)換mi RNA與ESC的維持或ESC的分化相關(guān)。
[Abstract]:Age-related macular degeneration (AMDD) is the leading cause of visual impairment and loss in the elderly worldwide. AMD is an eye disease with macular degeneration.In recent years, stem-derived retinal pigment epithelial cells (RPE) have been developed as a new alternative therapy for AMD.The differentiation of embryonic stem cells into RPE involves changes in the expression of many genes, including the expression of micro RNA(mi.In order to reveal the changes and roles of mi RNA in the process of cell differentiation and transformation, this study has for the first time systematically studied the changes in the expression level of mi RNA in the four stages of differentiation of human ESC into RPE.In different differentiation stages, the potential functional changes of mi RNA and isomi R where the editing site is located in "seed" region, that is, the expression level of mi RNA in cell differentiation, are expressed at different differentiation stages.The diversity of expression patterns and sequences, as well as the changes of related functions.The results are reflected in the following aspects: 1. 1.In the four stages of stem cell differentiation into RPE cells, 941 known RNA precursors were detected, 113 new mi RNA hairpins and 196 miRNA.2expressed.Compared with the first stage of stem cell differentiation, 205 mi RNA were significantly up-regulated and 295 down-regulated in the fourth stage.In the second stage, there were 172 significantly up-regulated and 175 down-regulated mi RNAs, while in the third stage there were 227 significantly up-regulated and 331 significantly down-regulated mi RNAs.In addition, 93 up-regulated and 124 down-regulated miRNAs were found in the three differentiated stages of ESC.After analyzing the differential expression of mi RNA between differentiated RPE cells and ESC cells in the fourth stage, it was found that most of the most enriched go terms down-regulating the target of mi RNA in RPE cells were similar to those that up-regulated the target of mi RNA.Because they have most of their target set. 3.107 preferentially expressed 5'-isomi R sequences inconsistent with the standard mi RNA sequences recorded in mi RBase were found, while 19 isomi R preferentially expressed in all cells at all stages;The functional analysis of the 19 preferentially expressed 5'-isomi R and its corresponding standard type mi RNA showed that although they shared more than half of the overrepresented biological processes (P-value0.01), the two groups of mi RNA were involved in different biological processes respectively. 4.Twenty-seven statistically significant A-to-I editing sites were identified in 24 different mi RNA, none of which are known SNP sites. The majority of these sites are located in the "seed" region of the mature mi RNA.In addition, the editing events in hsa-mi R-381-3p occurred in the early stage of ESC cell differentiation, and others occurred in the late stage of ESC cell differentiation.Nine inferred A-to-I editing sites have been verified by existing experimental results.At the same time, it is found that the functions of edit mi RNA and corresponding unedited mi RNA have great changes.During the process of human ESC differentiation into RPE, there are 14 mi RNA precursors producing mi RNA, which has the phenomenon of brachial selective tendency expression.The functional analysis of 27 mi RNA.mi RNA targets expressed by the 14 arm converted pre-mi RNA showed that these advantages in the process of ESC differentiation into RPE cells were related to the maintenance of ESC or the differentiation of ESC.
【學(xué)位授予單位】：湖南科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R774.5

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 魯慧英;Detection of hepatitis C virus RNA sequences in cholangiocarcinomas in Chinese and American patients[J];Chinese Medical Journal;2000年12期

2 ;Detection the HCV RNA by PCR-microplate hybridization method from clinical specimens[J];中國輸血雜志;2001年S1期

3 付漢江,鄭曉飛;類mRNA RNA研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊);2002年04期

4 Verheyden B ,徐其武;口服脊髓灰質(zhì)炎疫苗核殼和RNA的穩(wěn)定性[J];國外醫(yī)學(xué).預(yù)防.診斷.治療用生物制品分冊;2002年01期

5 CMBE譯文組;探索小RNA的功能[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)生物工程學(xué)雜志;2004年03期

6 沈維干;RNA interference and its current application in mammals[J];Chinese Medical Journal;2004年07期

7 ;Potent and specific inhibition of SARS-CoV antigen expression by RNA interference[J];Chinese Medical Journal;2005年09期

8 孫娣;汪洋;張麗娟;閆玉清;;一種簡捷提取植物總RNA的方法[J];黑龍江醫(yī)藥;2005年06期

9 熊慧華;于世英;胡廣原;莊亮;;Effects of Survivin Expression Suppressed by Short Hairpin RNA on MCF-7 Cells[J];華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)英德文版);2006年03期

10 楊益超;;RNA干擾及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J];廣西醫(yī)學(xué);2007年10期

相關(guān)會議論文 前10條

1 金由辛;;面向21世紀(jì)的RNA研究[A];面向21世紀(jì)的科技進(jìn)步與社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展（下冊）[C];1999年

2 ;第四屆RNA全國研討會大會報告日程安排[A];第四屆全國RNA進(jìn)展研討會論文集[C];2005年

3 ;Function of Transfer RNA Modifications in Plant Development[A];植物分子生物學(xué)與現(xiàn)代農(nóng)業(yè)——全國植物生物學(xué)研討會論文摘要集[C];2010年

4 王峰;張秋平;陳金湘;;棉花總RNA的快速提取方法[A];中國棉花學(xué)會2011年年會論文匯編[C];2011年

5 關(guān)力;陳本iY;iJ云虹;郭培芝;魏重琴;邱蘇吾;苗健;;關(guān)于動物}D~T中RNAn,定方法的研究[A];中國生理科學(xué)會學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編（生物化學(xué)）[C];1964年

6 夏海濱;;小RNA在免疫學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用研究進(jìn)展[A];中國免疫學(xué)會第五屆全國代表大會暨學(xué)術(shù)會議論文摘要[C];2006年

7 ;The stability of hepatitis C virus RNA in various handling and storage conditions[A];中國輸血協(xié)會第四屆輸血大會論文集[C];2006年

8 郭德銀;;RNA干擾在病毒研究和控制中的應(yīng)用[A];2006中國微生物學(xué)會第九次全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2006年

9 甘儀梅;楊業(yè)華;王學(xué)奎;曹燕;楊特武;;棉花總RNA快速提取[A];中國棉花學(xué)會2007年年會論文匯編[C];2007年

10 ;Identification and characterization of novel interactive partner proteins for PCBP1 that is a RNA-binding protein[A];中國優(yōu)生優(yōu)育協(xié)會第四屆全國學(xué)術(shù)論文報告會暨基因科學(xué)高峰論壇論文專輯[C];2008年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 記者 馮衛(wèi)東;研究人員發(fā)現(xiàn)可破壞腫瘤抑制基因的小RNA[N];科技日報;2009年

2 記者 儲笑抒 通訊員 盛偉;人體微小RNA有望提前發(fā)出癌癥預(yù)警[N];南京日報;2011年

3 瀘州醫(yī)學(xué)院副教授、科普作家 周志遠(yuǎn);“大頭兒子”與環(huán)狀RNA[N];第一財經(jīng)日報;2014年

4 麥迪信;小分子RNA可能有大作用[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2003年

5 董映璧;美發(fā)現(xiàn)基因調(diào)控可回應(yīng)“RNA世界”[N];科技日報;2006年

6 張忠霞;特制RNA輕推一下,就能“喚醒”基因[N];新華每日電訊;2007年

7 聶翠蓉;RNA：縱是配角也精彩[N];科技日報;2009年

8 馮衛(wèi)東;RNA干擾機(jī)制首次在人體中獲得證實(shí)[N];科技日報;2010年

9 馮衛(wèi)東　王小龍;英在地球早期環(huán)境模擬條件下合成類RNA[N];科技日報;2009年

10 記者 常麗君;新技術(shù)讓研究進(jìn)入單細(xì)胞內(nèi)RNA的世界[N];科技日報;2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 王趙瑋;昆蟲RNA病毒復(fù)制及昆蟲抗病毒天然免疫機(jī)制研究[D];武漢大學(xué);2014年

2 包純;一類新非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)以及產(chǎn)生和功能的初探[D];華中師范大學(xué);2015年

3 李語麗;基于MeRIP-seq的水稻RNA m6A甲基化修飾的研究[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2015年

4 熊瑜琳;miR-122靶位基因STAT3調(diào)控長鏈非編碼 RNA Lethe促進(jìn)HCV復(fù)制的機(jī)制研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

5 范春節(jié);高通量測序鑒定毛竹小RNA及其功能分析[D];中國林業(yè)科學(xué)研究院;2012年

6 王加強(qiáng);小鼠著床前胚胎特異ERV相關(guān)長非編碼RNA的定向篩選及功能研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

7 王業(yè)偉;非編碼RNA SPIU的結(jié)構(gòu)和功能研究和p19INK4D在APL發(fā)病中的作用[D];上海交通大學(xué);2013年

8 鄒艷芬;子癇前期中非編碼RNA對滋養(yǎng)細(xì)胞功能的調(diào)控及機(jī)制探索[D];南京醫(yī)科大學(xué);2015年

9 朱喬;miR-10b在人肝細(xì)胞肝癌發(fā)生中的作用及其機(jī)制的初步探索[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年

10 蔣俊鋒;長鏈非編碼RNA BACE1-AS促進(jìn)Aβ聚集及其調(diào)節(jié)BACE1和SERF1a的ceRNA機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2015年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 陸聰兒;條紋斑竹鯊再生肝臟中差異RNA的研究[D];浙江理工大學(xué);2015年

2 張曉輝;小鼠幾種長鏈非編碼RNA基因功能的初步研究[D];昆明理工大學(xué);2015年

3 全弘揚(yáng);長鏈非編碼RNA在細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)中的相關(guān)作用及機(jī)制研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2015年

4 胡亮;DDX19A識別PRRSV基因組RNA并激活NLRP3炎癥小體[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

5 張帥兵;應(yīng)用RNA干擾技術(shù)對旋毛蟲Nudix水解酶基因功能的研究[D];鄭州大學(xué);2015年

6 鄭芳芳;肺癌RNA-Seq數(shù)據(jù)中RNA編輯事件的識別算法和系統(tǒng)分析[D];蘇州大學(xué);2015年

7 陳瑞東;長鏈非編碼RNA MEG3在胰腺癌發(fā)生發(fā)展中作用的實(shí)驗(yàn)研究[D];蘇州大學(xué);2015年

8 劉駿武;線蟲和水稻中環(huán)狀RNA的預(yù)測及分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 李猷;利用RNA干擾技術(shù)提高番茄抗TMV侵染能力的研究[D];牡丹江師范學(xué)院;2015年

10 吳術(shù)盛;SVCV感染EPC細(xì)胞microRNA表達(dá)譜的初步研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

，

本文編號：1722261