PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究
發(fā)布時(shí)間：2022-01-23 20:03
乳腺癌是女性群體中發(fā)病率極高的惡性腫瘤,是多因素導(dǎo)致的復(fù)雜疾病,在乳腺癌發(fā)病機(jī)制的諸多理論中,遺傳因素扮演了非常重要的角色。機(jī)體內(nèi)的DNA修復(fù)系統(tǒng)對(duì)預(yù)防腫瘤的發(fā)生起著重要作用,DNA損傷修復(fù)基因的單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）是導(dǎo)致個(gè)體修復(fù)能力差異的重要原因,而DNA損傷修復(fù)能力存在的個(gè)體差異進(jìn)一步?jīng)Q定了腫瘤易感性。因此,針對(duì)DNA損傷修復(fù)基因展開其基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究,探尋新的特異性分子標(biāo)記對(duì)乳腺癌的早期診斷、治療具有重要意義。本研究對(duì)5個(gè)DNA損傷修復(fù)基因PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3進(jìn)行SNPs基因分型,初步分析PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP與乳腺癌臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性,研究乳腺癌患者中PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP位點(diǎn)不同基因型和單倍型與乳腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性,并探究基因不同SNP位點(diǎn)互作與乳腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性,為乳腺癌的早篩檢測和預(yù)后評(píng)估提供參考依據(jù)。利用Meta分析方法選擇出與乳腺癌易感性相關(guān)的5個(gè)...
【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：103 頁
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
連鎖不平衡熱圖
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究66交互作用，其中rs1805408與rs3219110間交互作用較強(qiáng)，rs1805408和rs3219110位點(diǎn)之間的交互對(duì)乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能具有重要影響。AC圖3-2PARP1基因三個(gè)tagSNP之間的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.圖解模型；B.MDR餅圖；C.MDR樹形圖3.5.1.2OGG1基因tagSNP之間的互作分析對(duì)OGG1兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)rs2072668、rs1052133進(jìn)行交互作用分析，從MDR結(jié)果可以看出（表3-9)，兩個(gè)模型組合與乳腺癌易感性之間均不存在顯著關(guān)聯(lián)（P>0.05)，因此，可推斷OGG1基因這兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)之間不存在交互作用。B
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究67AC圖3-3XRCC1基因五個(gè)tagSNP之間的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.圖解模型；B.MDR餅圖；C.MDR樹形圖3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之間的互作分析本研究中選取了XRCC1基因5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487進(jìn)行了MDR分析。從表3-9中可以看出，在SNP位點(diǎn)交互模型中，交叉驗(yàn)證一致性處于于5~10的區(qū)間，檢驗(yàn)準(zhǔn)確度值處于0.6364~0.6513區(qū)間。在5個(gè)組合中，XRCC1基因的rs3213263、rs3213356兩位點(diǎn)模型為多態(tài)性位點(diǎn)之間相互作用的最佳模型，其具有最高的檢驗(yàn)準(zhǔn)確度（64.77%)以及最大的交叉驗(yàn)證一致性（Cross-validationconsistency=10)，經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)rs3213263、rs1130409模型組合與乳腺癌易感性之間存在顯著關(guān)聯(lián)（P=0.0010)，可推斷出XRCC1的兩個(gè)SNP位點(diǎn)之間可能存在著較強(qiáng)交互作用，并且該交互作用可能會(huì)升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型，雖然也都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.001)，但是Cross-validationconsistency較低或預(yù)測誤差較高，B
本文編號(hào)：3605063
【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
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蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究66交互作用，其中rs1805408與rs3219110間交互作用較強(qiáng)，rs1805408和rs3219110位點(diǎn)之間的交互對(duì)乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能具有重要影響。AC圖3-2PARP1基因三個(gè)tagSNP之間的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.圖解模型；B.MDR餅圖；C.MDR樹形圖3.5.1.2OGG1基因tagSNP之間的互作分析對(duì)OGG1兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)rs2072668、rs1052133進(jìn)行交互作用分析，從MDR結(jié)果可以看出（表3-9)，兩個(gè)模型組合與乳腺癌易感性之間均不存在顯著關(guān)聯(lián)（P>0.05)，因此，可推斷OGG1基因這兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)之間不存在交互作用。B
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究67AC圖3-3XRCC1基因五個(gè)tagSNP之間的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.圖解模型；B.MDR餅圖；C.MDR樹形圖3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之間的互作分析本研究中選取了XRCC1基因5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487進(jìn)行了MDR分析。從表3-9中可以看出，在SNP位點(diǎn)交互模型中，交叉驗(yàn)證一致性處于于5~10的區(qū)間，檢驗(yàn)準(zhǔn)確度值處于0.6364~0.6513區(qū)間。在5個(gè)組合中，XRCC1基因的rs3213263、rs3213356兩位點(diǎn)模型為多態(tài)性位點(diǎn)之間相互作用的最佳模型，其具有最高的檢驗(yàn)準(zhǔn)確度（64.77%)以及最大的交叉驗(yàn)證一致性（Cross-validationconsistency=10)，經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)rs3213263、rs1130409模型組合與乳腺癌易感性之間存在顯著關(guān)聯(lián)（P=0.0010)，可推斷出XRCC1的兩個(gè)SNP位點(diǎn)之間可能存在著較強(qiáng)交互作用，并且該交互作用可能會(huì)升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型，雖然也都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.001)，但是Cross-validationconsistency較低或預(yù)測誤差較高，B
本文編號(hào)：3605063
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