膽總管結石患者膽道菌群結構及其與膽總管結石復發(fā)的關系研究
發(fā)布時間:2021-12-11 15:25
目的:探討膽總管結石患者膽道菌群的結構組成、多樣性及其與膽總管結石復發(fā)的關系。方法:選取2018年9月至2018年11月因膽總管結石在蘭州大學第一醫(yī)院ERCP診療中心接受ERCP手術治療的患者23例,其中初發(fā)性膽總管結石患者14例,復發(fā)性膽總管結石患者9例。收集所有患者的基本資料、病史資料以及術前檢驗結果,并于ERCP術中采集膽總管膽汁樣本。提取所有樣本的微生物DNA,進行PCR擴增,采用16S rDNA高通量測序技術進行測序分析,鑒定細菌OTU。通過物種分類注釋,揭示膽總管結石患者膽道菌群的結構組成及其多樣性,對比分析復發(fā)性與初發(fā)性膽總管結石患者膽道菌群的差異。結果:膽總管結石患者膽總管膽汁中細菌DNA檢出率為100%。研究共獲得579 599個高質(zhì)量tags,平均每個樣本25 200±11 429個tags,其中初發(fā)性膽總管結石獲得325 559個tags,復發(fā)性膽總管結石獲得個254 040個tags。經(jīng)鑒定獲得1075個細菌OTUs,平均每個樣本191±66個OTUs,其中初發(fā)性膽總管結石獲得830個OTUs,復發(fā)性膽總管結石獲得824個OTUs。依據(jù)物種分類注釋結果,所有OT...
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
所有樣本序列長度分布
位論文 膽總管結石患者其與膽總管結石續(xù)表 2.2 所有樣本測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計w Tags Raw Bases Valid Tags Valid Bases(M315 18.25M 29726 12.32 957 16.83M 24956 9.99 512 17.16M 27718 11.49 067 10.88M 17458 7.23 345 14.05M 22791 9.45 528 9.95M 13874 5.65 803 10.12M 16457 6.84
圖 2.2 兩組樣本 α 多樣性指數(shù)比較(Chao l 和 Shannon 指數(shù))圖 2.3 各樣本及組間比較的稀釋曲線(Observed species 指數(shù))。橫坐標表示隨機抽取的序列數(shù),縱坐標表示與之對應的 OTU 數(shù),用以反映測序深度。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Endoscopic treatment of difficult extrahepatic bile duct stones, EPBD or EST: An anatomic view[J]. Jun Ding,Fu Li,Hong-Yi Zhu,Xi-Wen Zhang. World Journal of Gastrointestinal Endoscopy. 2015(03)
[2]肝內(nèi)膽管結石和膽汁中細菌多樣性分析[J]. 劉敏,彭宇鴻,余宇,高強,王瑞豐,田伏洲,孫群. 四川大學學報(自然科學版). 2014(03)
[3]常見三種類型膽結石膽汁中細菌群落的檢測[J]. 劉晶華,王敏,鄒玉. 臨床肝膽病雜志. 2012(07)
[4]Concept of the pathogenesis and treatment of cholelithiasis[J]. Vasiliy Ivanovich Reshetnyak. World Journal of Hepatology. 2012(02)
[5]豚鼠膽色素結石模型的腸道免疫屏障研究[J]. 于浩,俊金哲,吳碩東. 中國醫(yī)科大學學報. 2010(03)
[6]膽紅素鈣結石形成的機制研究[J]. 蔡紅嬌,裘法祖. 中華實驗外科雜志. 2006(11)
[7]聚合酶鏈式反應和常規(guī)培養(yǎng)檢測膽總管結石中細菌及其意義的研究[J]. 陳曉文,智發(fā)朝,武金寶,萬田謨,周丹. 臨床肝膽病雜志. 2005(03)
[8]膽石病流行病學研究的現(xiàn)狀和發(fā)展[J]. 韓天權,張圣道. 胃腸病學. 2003(03)
[9]Relationship between bilirubin free radical and formationof pigment gallstone[J]. Xiang-Tao Liu Jian Hu,Department of Chemical Biology,School of Pharmaceutical Sciences,Peking University,Beijing 100083,China. World Journal of Gastroenterology. 2002(03)
[10]New development of biliary surgery in China[J]. Zhi Qiang Huang The Research Institute of General Surgery,The General Hospital of PLA,Beijing 100853,China. World Journal of Gastroenterology. 2000(02)
本文編號:3534919
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
所有樣本序列長度分布
位論文 膽總管結石患者其與膽總管結石續(xù)表 2.2 所有樣本測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計w Tags Raw Bases Valid Tags Valid Bases(M315 18.25M 29726 12.32 957 16.83M 24956 9.99 512 17.16M 27718 11.49 067 10.88M 17458 7.23 345 14.05M 22791 9.45 528 9.95M 13874 5.65 803 10.12M 16457 6.84
圖 2.2 兩組樣本 α 多樣性指數(shù)比較(Chao l 和 Shannon 指數(shù))圖 2.3 各樣本及組間比較的稀釋曲線(Observed species 指數(shù))。橫坐標表示隨機抽取的序列數(shù),縱坐標表示與之對應的 OTU 數(shù),用以反映測序深度。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Endoscopic treatment of difficult extrahepatic bile duct stones, EPBD or EST: An anatomic view[J]. Jun Ding,Fu Li,Hong-Yi Zhu,Xi-Wen Zhang. World Journal of Gastrointestinal Endoscopy. 2015(03)
[2]肝內(nèi)膽管結石和膽汁中細菌多樣性分析[J]. 劉敏,彭宇鴻,余宇,高強,王瑞豐,田伏洲,孫群. 四川大學學報(自然科學版). 2014(03)
[3]常見三種類型膽結石膽汁中細菌群落的檢測[J]. 劉晶華,王敏,鄒玉. 臨床肝膽病雜志. 2012(07)
[4]Concept of the pathogenesis and treatment of cholelithiasis[J]. Vasiliy Ivanovich Reshetnyak. World Journal of Hepatology. 2012(02)
[5]豚鼠膽色素結石模型的腸道免疫屏障研究[J]. 于浩,俊金哲,吳碩東. 中國醫(yī)科大學學報. 2010(03)
[6]膽紅素鈣結石形成的機制研究[J]. 蔡紅嬌,裘法祖. 中華實驗外科雜志. 2006(11)
[7]聚合酶鏈式反應和常規(guī)培養(yǎng)檢測膽總管結石中細菌及其意義的研究[J]. 陳曉文,智發(fā)朝,武金寶,萬田謨,周丹. 臨床肝膽病雜志. 2005(03)
[8]膽石病流行病學研究的現(xiàn)狀和發(fā)展[J]. 韓天權,張圣道. 胃腸病學. 2003(03)
[9]Relationship between bilirubin free radical and formationof pigment gallstone[J]. Xiang-Tao Liu Jian Hu,Department of Chemical Biology,School of Pharmaceutical Sciences,Peking University,Beijing 100083,China. World Journal of Gastroenterology. 2002(03)
[10]New development of biliary surgery in China[J]. Zhi Qiang Huang The Research Institute of General Surgery,The General Hospital of PLA,Beijing 100853,China. World Journal of Gastroenterology. 2000(02)
本文編號:3534919
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