目的與意義:椎間盤退行性變（IVDD）是中老年人的常見病和多發(fā)病,以頸肩痛與腰腿痛為主要臨床癥狀。目前其治療方法主要采取理療、藥物等保守治療和椎間盤切除植骨融合內(nèi)固定術(shù)等手術(shù)治療。雖然目前臨床療效尚可,但是仍有部分患者預(yù)后不佳,其主要原因在于對IVDD的發(fā)病機理了解不夠深入。而長鏈非編碼RNAs是一類長度大于200 nt的非編碼RNA,其在生理及病理生理過程中具有重要的生物學(xué)功能。但其在IVDD中的作用及其分子機理研究處于起步階段且研究較少。本實驗采用高通量測序?qū)VDD髓核組織中差異表達的LncRNAs進行研究,探索LncRNA調(diào)控IVDD的分子學(xué)機制,并為IVDD的治療提供作用靶點。研究方法:高通量測序分析LncRNAs在椎間鍵盤退行性變中的差異表達分析,并進行生物信息學(xué)分析;構(gòu)建Linc01776敲除質(zhì)粒表達載體,研究Linc01776在IVDD中生物功能學(xué)研究;預(yù)測Linc01776參與的競爭性內(nèi)源RNA（CeRNA）調(diào)控機制。研究成果:通過對RNA-seq數(shù)據(jù)分析,共獲得23706個差異表達的LncRNAs,其中上調(diào)倍數(shù)大于2倍的233個、下調(diào)倍數(shù)大于2倍的340個。其中Li... 

【文章來源】：上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

對照組和IVDD組椎間盤組織中mRNAs與LncRNAs表達熱圖

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文-12-現(xiàn)這些顯著富集的通路多與細胞增殖凋亡等相關(guān)，其中以Rassignalingpathway最為顯著，ErbBsignalingpathway也較為顯著。圖1-2差異表達LncRNAs靶基因KEGG信號通路富集GeneRatio圖Figure1-2theKEGGsignalingpathwayenrichmentanalysisofthetargetgeneofthedifferentlyexpressedLncRNAs表1-1差異表達LncRNAs靶基因KEGG信號通路富集表Table1-1theKEGGsignalingpathwayenrichmentanalysisofthetargetgeneofthedifferentlyexpressedLncRNAsDefinitionCountEnrichmentGeneRatioGlutamatergicsynapse-Homosapiens(human)1142.9932660.142857Rassignalingpathway-Homosapiens(human)2272.7344930.178571ErbBsignalingpathway-Homosapiens(human)872.3122090.107143Alcoholism-Homosapiens(human)1792.2786790.142857Morphineaddiction-Homosapiens(human)912.2576110.107143Nicotineaddiction-Homosapiens(human)401.9591050.071429Synapticvesiclecycle-Homosapiens(human)631.5850480.071429Glioma-Homosapiens(human)651.5598160.071429Chronicmyeloidleukemia-Homosapiens(human)731.466760.071429Calciumsignalingpathway-Homosapiens(human)1801.4645350.107143

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文-14-圖1-3差異表達LncRNA靶基因GO富集分析BP圖Figure1-3theGOenrichmentanalysisofdifferentlyexpressedLncRNAs1.3.4差異表達mRNA進行KEGG信號通路富集分析通過使用KEGG信號通路分析，我們可以更好地理解與研究差異mRNA的生物學(xué)功能和特性。利用KEGG數(shù)據(jù)庫，我們將篩選出的差異表達mRNA分為下調(diào)組和上調(diào)組，分別進行KEGG信號通路富集分析，以鑒定其在IVDD發(fā)生發(fā)展過程中可能發(fā)揮的作用與調(diào)控機制。根據(jù)EnrichmentScore與GeneRatio（SelectionCounts/SelectionSize）兩項標準篩選KEEG信號通路。其中，將富集排序前十的KEGG信號通路篩選為Top10通路，如圖1-4、圖1-5、表1-3、表1-4所示。我們發(fā)現(xiàn)這些顯著富集的通路多與細胞增殖凋亡、細胞外基質(zhì)合成與分解等相關(guān)，其中包括ECM-receptorinteraction、MAPKsignalingpathway等。


本文編號：3477509