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黃韌帶骨化過程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機制

發(fā)布時間:2021-04-16 08:21
  已有研究表明非編碼RNA可參與多種生理病理過程,其在疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。黃韌帶骨化癥及骨質(zhì)疏松癥是常見的慢性骨科疾病,如不能得到及時的診斷和治療,將嚴重影響患者的生存質(zhì)量。目前,鮮有報道非編碼RNA在黃韌帶骨化癥或骨質(zhì)疏松癥中的功能及機制。本研究旨在通過基因芯片或測序篩選出骨化黃韌帶組織(Ossification of ligamentum flavum,OLF)中顯著差異表達的m RNA、lnc RNA、mi RNA及circ RNA,并對差異RNA進行關(guān)聯(lián)分析及功能探究;同時明確mi R-342-3p在成骨分化中的功能及機制,為黃韌帶骨化和骨質(zhì)疏松癥的診斷和治療提供新思路。方法:1.標本采集:收集術(shù)中取出的新鮮骨化的黃韌帶組織和正常黃韌帶組織。用液氮研磨法快速提取組織樣本RNA,并通過RNA電泳和2100質(zhì)量檢測法進行檢測。從中分別選4個合格的正常黃韌帶組織和4個合格的骨化黃韌帶組織的RNA進一步實驗。2.篩選OLF中差異表達的m RNA:通過基因芯片分析,OLF與正常黃韌帶組織(ligamentum flavum,LF)相比,篩選出差異倍數(shù)>2,p<0.05... 

【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校

【文章頁數(shù)】:129 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

黃韌帶骨化過程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機制


骨化黃韌帶組織中差異mRNAs的表達譜

黃韌帶骨化過程中ncRNA與mRNA的交互作用網(wǎng)絡(luò)及miR-342-3p促成骨分化的作用機制


OLF中差異mRNAs的GO和KEGG分析

表達譜,黃韌帶,驗證結(jié)果,芯片


在擴大樣本中,進一步 qPCR 驗證。上述 10 個差異 lncRNAs 在芯片結(jié)果中的差異如表 1.2,qPCR 驗證結(jié)果如圖1.3 B,結(jié)果表明驗證結(jié)果與芯片結(jié)果一致,說明芯片結(jié)果可信。進一步對差異 lncRNA 種類進行分析,結(jié)果如圖 1.3 C 所示,intergeniclncRNA 占總差異 lncRNAs 的 62.45%、intronic antisense 占 13.28%、naturalantisense 占 11.38%、bidirectional 占 6.16%、intron sense-overlapping 占 4.95%及exon sense-overlapping 占 1.79%。根據(jù)不同長度,對差異 lncRNA 進行分類,結(jié)果如圖 1.3 D 所示,差異 lncRNA 主要集中在 200 至 1000bp 之間。已有研究表明,染色質(zhì)分布失衡與多種疾病相關(guān)[53]。我們依據(jù)每條染色體上差異 lncRNA和 mRNA 的數(shù)目對相應(yīng)染色體的長度分別做標準化后

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Culture conditions for equine bone marrow mesenchymal stem cells and expression of key transcription factors during their differentiation into osteoblasts[J]. Elizabeth R A Glynn,Alfredo Sanchez Londono,Steven A Zinn,Thomas A Hoagl,Kristen E Govoni.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[2]Mesenchymal stem cells: Molecular characteristics and clinical applications[J]. Farbod Rastegar,Deana Shenaq,Eric R Wagner,Stephanie H Kim,Russell R Reid,Hue H Luu,Rex C Haydon.  World Journal of Stem Cells. 2010(04)



本文編號:3141080

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