U6和let-7a作為定量檢測miRNAs的內參在大鼠軟骨中穩(wěn)定性的比較
本文選題:軟骨 切入點:內參 出處:《西安交通大學學報(醫(yī)學版)》2017年04期
【摘要】:目的比較U6和let-7a兩種內參在RT-qPCR方法檢測大鼠股骨頭軟骨樣本microRNAs(miRNAs)的穩(wěn)定性。方法取軟骨生成過程的新生(D0)、斷乳(D21)、性成熟(D42)3個時間節(jié)點的雌性近交系DA大鼠股骨頭軟骨,提取總RNA,用RT-qPCR方法分別在U6和let-7a兩種內參體系下,檢測miR-1、-25、-26a、-140、-146a、-150、-181a、-195、-223、-337等的表達,并與課題組前期獲得的二代測序絕對定量結果進行比較,綜合評價兩種內參的穩(wěn)定性。結果在D42樣本中U6(P=0.045)、let-7a(P=0.021 5)的相對值出現了顯著性差異;在兩種內參體系中miR-26a、-140、-223、-337的表達趨勢相同,miR-1、-146a差異無統(tǒng)計學意義,miR-25、-150、-181a、-195都出現了顯著性差異(P0.05)。綜合二代測序絕對定量結果比較,let-7a穩(wěn)定性優(yōu)于U6。結論 let-7a穩(wěn)定性優(yōu)于U6,更適合做軟骨miRNA定量的內參。
[Abstract]:Objective to compare the stability of U6 and let-7a in the RT-qPCR method for the detection of femoral head cartilage in rats. Methods the femoral head cartilage of female inbred strain DA rats with three time nodes of chondrogenesis (D0, D21, D42) was obtained. The total RNAs were extracted, and the expression of miR-1r-25r-25r-26afen -140- 146abu-150-181afen -195-223N-337 was detected by RT-qPCR method in U6 and let-7a systems, respectively, and compared with the absolute quantitative results obtained by the second generation sequencing in the early stage of the study group, and compared with the results obtained in the early period of the study group. The stability of the two internal parameters was comprehensively evaluated. Results there was significant difference in the relative values of U6P0. 045 and 7aP0. 021 5 in D42 samples. In the two internal reference systems, the expression trend of miR-26ahu-140- 223N-337 was the same. There was no significant difference in the expression of miR-25- 150-1a-181a ~ (-195). The stability of let-7a was better than that of U6.Conclusion the stability of let-7a is better than that of U6, and the stability of let-7a is better than that of U6.Conclusion the stability of let-7a is better than that of U6.Conclusion the stability of let-7a is better than that of U6.Conclusion the stability of let-7a is better than that of U6. The internal parameters of cartilage miRNA were measured.
【作者單位】: 西安交通大學醫(yī)學部附屬紅會醫(yī)院急診科;西安交通大學醫(yī)學部基礎醫(yī)學院生物化學與分子生物學系;環(huán)境與疾病相關基因教育部重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金資助項目(No.81371986,81301598) 中國博士后科學基金(No.2014T70928,2013M530427) 中央高;狙芯炕(No.xjj2015073)~~
【分類號】:R68
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,本文編號:1670535
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