BLAST序列比對算法是NCBI綜合性生物信息平臺整合的眾多重要功能之一。研究建立BLAST算法的脫機環(huán)境移植,可使生物信息學研究人員在構建自己專有序列數(shù)據(jù)庫的同時,對DNA序列進行脫機環(huán)境比對,以期更高的序列數(shù)據(jù)安全性,避免聯(lián)網(wǎng)狀態(tài)下造成的數(shù)據(jù)丟失和泄露等嚴重問題。通過研究BLAST序列比對過程中涉及的標準數(shù)據(jù)格式與調用細節(jié),實現(xiàn)了脫機環(huán)境下的BLAST序列比對,為建立安全序列比對提供了一種可行參考。 

【文章來源】：內蒙古師范大學學報(自然科學漢文版). 2020,49(04)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

BLAST序列比對算法

2.2 脫機比對程序框架設計研究通過設計程序接口界面響應用戶操作,讀取待查序列,調用本地BLAST模塊,將其與格式化的數(shù)據(jù)庫序列進行比對,比對完成后返回結果,生成比對報告文檔,從而達到脫機環(huán)境下的BLAST序列比對目標。程序基本框架如圖2所示。

FASTA序列數(shù)據(jù)格式

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3590546