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人和豬神經(jīng)脫細(xì)胞基質(zhì)蛋白質(zhì)組學(xué)差異

發(fā)布時(shí)間:2021-05-22 02:50
  目的:分析豬與人外周神經(jīng)在脫細(xì)胞后的蛋白質(zhì)組學(xué)差異,為豬神經(jīng)脫細(xì)胞材料運(yùn)用于外周神經(jīng)損傷(PNI)的修復(fù)提供一定的數(shù)據(jù)支撐。方法:通過研磨和酶解方式提取豬神經(jīng)脫細(xì)胞基質(zhì)(pDNM)和人神經(jīng)脫細(xì)胞基質(zhì)(hDNM)內(nèi)的所有蛋白,采用以串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽(TMT)為標(biāo)記的液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(TMTHPLC-MS/MS)技術(shù)定量并對(duì)2組差異蛋白進(jìn)行GO富集化和KEGG通路分析。結(jié)果:共鑒定1 448種蛋白,組間蛋白都能明顯區(qū)分,組內(nèi)蛋白相關(guān)性良好。其中,p DNM上調(diào)蛋白數(shù)456個(gè),下調(diào)蛋白數(shù)170個(gè),且pDNM富含更多的細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)相關(guān)蛋白。GO分析顯示,上調(diào)表達(dá)蛋白所處的細(xì)胞位置集中在生長(zhǎng)錐、軸突、神經(jīng)元胞體。上調(diào)表達(dá)蛋白參與的生物學(xué)過程為細(xì)胞遷移、細(xì)胞骨架組織、軸突發(fā)育。上調(diào)蛋白的主要分子功能與生物功能調(diào)節(jié)、細(xì)胞骨架的結(jié)構(gòu)組成、肌動(dòng)活性有關(guān)。KEGG通路分析顯示,差異蛋白可參與肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架的調(diào)節(jié)、軸突的引導(dǎo)等信號(hào)通路的激活。結(jié)論:pDNM內(nèi)含豐富的結(jié)構(gòu)和功能相關(guān)蛋白,有望成為修復(fù)PNI的備選產(chǎn)品。 

【文章來源】:溫州醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,50(11)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 蛋白質(zhì)提。
        1.2.2 蛋白質(zhì)酶解:
        1.2.3 TMT標(biāo)記肽段混合物:
        1.2.4高p H反相分離肽段:
        1.2.5 nano-HPLC-MS/MS分析:
        1.2.6 數(shù)據(jù)處理:
2 結(jié)果與分析
    2.1 數(shù)據(jù)質(zhì)控
    2.2 差異表達(dá)蛋白鑒定結(jié)果
    2.3 差異蛋白生物信息功能分析
    2.4 ECM相關(guān)蛋白含量組間差異
3 討論



本文編號(hào):3200837

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