miRNA是一種廣泛存在于真核生物中長度約為20到25個(gè)核苷酸的進(jìn)化保守的單鏈內(nèi)源性非編碼RNA,它們雖不能編碼蛋白質(zhì),但卻參與靶基因的調(diào)控,在細(xì)胞增殖、生長、凋亡等生物過程中都起著關(guān)鍵作用,能夠幫助我們從分子角度了解疾病的發(fā)生發(fā)展。探測miRNA及其功能將助于了解miRNA的調(diào)控機(jī)制,有助于深刻認(rèn)識疾病的發(fā)生發(fā)展的機(jī)制,對人類疾病預(yù)防和治療具有十分重要的意義。近年來,大量miRNA生物數(shù)據(jù)不斷形成,大部分miRNA的功能仍然未知,探索miRNA功能是目前生命科學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn),研究者們通過精細(xì)的生物實(shí)驗(yàn)的方法能夠準(zhǔn)確鑒別出miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián),但這類方法對實(shí)驗(yàn)條件要求高且周期漫長。計(jì)算方法是生物實(shí)驗(yàn)的最佳補(bǔ)充,這類方法通過整合已知的生物數(shù)據(jù)來推斷miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián),利用預(yù)測結(jié)果可以指導(dǎo)生物實(shí)驗(yàn),能夠減少后續(xù)生物實(shí)驗(yàn)的盲目性、縮小生物實(shí)驗(yàn)的范圍,幫助理解miRNA功能及致病機(jī)理。目前大多數(shù)計(jì)算方法存在預(yù)測準(zhǔn)確度不高、需要負(fù)樣本、不能預(yù)測孤立疾病和新miRNA、泛化能力不強(qiáng)等缺點(diǎn),本文針對這些問題,提出了三種方法,主要研究工作如下:1)基于共同鄰居的異構(gòu)二分網(wǎng)絡(luò)鏈路預(yù)測方法推斷... 

【文章來源】：湖南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：145 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

哺乳動(dòng)物的miRNA產(chǎn)生途徑和機(jī)制[67]

Mesh 是美國國立醫(yī)學(xué)院圖書館制定的權(quán)威醫(yī)學(xué)主題詞表，其地址是https://www.nlm.nih.gov/mesh/。該數(shù)據(jù)庫對疾病的分類信息進(jìn)行了詳細(xì)的描述Mesh 以樹狀形式結(jié)構(gòu)對醫(yī)學(xué)詞匯進(jìn)行了歸類劃分，越接近根結(jié)點(diǎn)，其概念越寬泛越接近葉結(jié)點(diǎn)，其定義越具體。如我們在該數(shù)據(jù)庫中查詢肝部腫瘤（ LiNeoplasms），得到肝部腫瘤的結(jié)構(gòu)編號情況是 Tree Number(s): C04.588.274.6C06.301.623, C06.552.697 其樹形結(jié)構(gòu)見圖 2.2。從樹形結(jié)構(gòu)我們可以知道，肝部瘤分屬腫瘤（Neoplasms）和消化系統(tǒng)疾�。―igestive System Diseases）這兩個(gè)之中，肝部腫瘤在消化系統(tǒng)疾病這個(gè)疾病類別中又分屬肝臟疾�。↙iver Disease和消化系統(tǒng)腫瘤（Digestive System Neoplasms）這兩個(gè)子類之中。同樣方式查詢腺腫瘤（Pancreatic Neoplasms）的結(jié)構(gòu)編號情況為 Tree Number(s): C04.588.274.76C04.588.322.475， C06.301.761， C06.689.667， C19.344.421，樹形結(jié)構(gòu)圖限于幅，不再列出，從兩個(gè)疾病的樹形結(jié)構(gòu)可知，兩個(gè)疾病存在共同的部分祖先結(jié)點(diǎn)如 C04.588（Neoplasms by Site），C04.588.274（Digestive System Neoplasms） C06（Digestive System Diseases），C06.301（Digestive System Neoplasms）等等

基于生物網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜疾病關(guān)聯(lián) miRNA 預(yù)測方法研究 AtTADV (A)D(t)（2.4）通過以公式 2.4 計(jì)算出兩個(gè)疾病的語義值之后，然后用公式 2.5 來計(jì)算兩個(gè)疾病的語義相似度。()()((t)())(,)DVADVBDDtSABABtTTAB （2.5）

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]血清miR-103可作為乳腺癌潛在的診斷標(biāo)記物[J]. 王小拍,吳興平,顏黎栩,邵建永.  南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)



本文編號：2915874