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基于云平臺(tái)的矩陣計(jì)算及其在血流動(dòng)力學(xué)仿真中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2017-12-24 13:18

  本文關(guān)鍵詞:基于云平臺(tái)的矩陣計(jì)算及其在血流動(dòng)力學(xué)仿真中的應(yīng)用 出處:《浙江工業(yè)大學(xué)》2015年碩士論文 論文類(lèi)型:學(xué)位論文


  更多相關(guān)文章: 血流動(dòng)力學(xué) 云計(jì)算 并行計(jì)算 Hadoop MPI ScaLAPACK


【摘要】:在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域伴隨著科技的發(fā)展,已可獲取到大量用于研究的心臟冠狀循環(huán)血管網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù),并通過(guò)數(shù)學(xué)模型仿真計(jì)算來(lái)研究心血管的血流動(dòng)力學(xué)特性,其中仿真計(jì)算的關(guān)鍵便是求解矩陣方程。但當(dāng)面對(duì)大量的數(shù)據(jù)需要進(jìn)行分析、利用以及進(jìn)行相應(yīng)的仿真計(jì)算時(shí),由于單機(jī)計(jì)算資源的限制,往往造成數(shù)據(jù)處理及仿真計(jì)算無(wú)法正常進(jìn)行。隨著并行計(jì)算技術(shù)及云計(jì)算技術(shù)的發(fā)展與成熟,可以通過(guò)引入相關(guān)技術(shù)來(lái)解決上述問(wèn)題。本文的研究目的是將現(xiàn)有的并行及云計(jì)算相關(guān)技術(shù)運(yùn)用到血流動(dòng)力學(xué)的仿真中,具體完成了一下幾個(gè)工作:1.通過(guò)研究和分析不同規(guī)模的真實(shí)血管及人工生成血管數(shù)據(jù),構(gòu)建相應(yīng)的血流動(dòng)力學(xué)模型,并根據(jù)不同的數(shù)據(jù)類(lèi)型設(shè)置相應(yīng)的血流及血壓邊界條件。2.研究了云計(jì)算框架Hadoop及其分布式計(jì)算框架MapReduce,并將其運(yùn)用到對(duì)原始血管數(shù)據(jù)的預(yù)處理當(dāng)中。通過(guò)相應(yīng)的MapReduce程序來(lái)實(shí)現(xiàn)剔除無(wú)效血管和子血管,添加后續(xù)仿真所需的數(shù)據(jù)及通過(guò)特定條件剔除及提取子血管等功能。3.研究了Intel MKL數(shù)學(xué)計(jì)算庫(kù)及MPI并行技術(shù),通過(guò)使用Intel MKL并結(jié)合MPI的具體實(shí)現(xiàn)Open MPI來(lái)實(shí)現(xiàn)矩陣方程的并行求解。其主要流程為矩陣的分發(fā),并行求解及數(shù)據(jù)收集,其中矩陣的分發(fā)使用塊循環(huán)分配的方式,并行求解使用了ScaLAPACK并行計(jì)算庫(kù),數(shù)據(jù)收集使用了NFS等技術(shù)。本文通過(guò)搭建云平臺(tái)來(lái)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的預(yù)處理及仿真計(jì)算,從而突破單機(jī)的物理資源限制,完成血管數(shù)量較大的仿真計(jì)算,所得仿真結(jié)果結(jié)果與測(cè)量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)相吻合。
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R319

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本文編號(hào):1328506

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