MassARRAY定量分析法與普通亞硫酸鹽測序法檢測心肌梗死大鼠模型低甲基化基因序列的效果比較
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【摘要】:目的通過比較MassARRAY定量分析法與普通亞硫酸鹽測序法(BSP)檢測心肌梗死大鼠乙醛脫氫酶(ALDH2)基因啟動子甲基化的效果,為確定適用于低甲基化基因序列檢測的最佳方法提供依據(jù)。方法取10只平均體重為(200±10)g的雄性Sprague-Dawley大鼠,將其隨機(jī)分入對照組和實驗組,每組5只。實驗組行心臟冠狀動脈左前降支結(jié)扎術(shù),制備心肌梗死模型。常規(guī)飼養(yǎng)7d后,取實驗組大鼠心臟梗死邊緣區(qū)心肌組織,同時在對照組的相同區(qū)域取材。提取邊緣區(qū)心肌組織DNA,分別采用MassARRAY定量分析法和普通BSP檢測兩組大鼠ALDH2基因核心啟動子上游同一段DNA序列甲基化情況。結(jié)果 BSP可檢測顯示目標(biāo)區(qū)域12個CpG位點,但檢測結(jié)果示對照組和實驗組均無DNA甲基化發(fā)生;MassARRAY定量分析法可檢測顯示目標(biāo)區(qū)域10個CpG位點(2號至11號位點),實驗組和對照組10個CpG位點均有低度DNA甲基化(30%),且兩組間5號、6號和7號CpG位點甲基化水平的差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P值均0.05)。結(jié)論對于低甲基化基因序列,MassARRAY定量分析法較BSP擁有更好的DNA甲基化檢測精度和檢測效率。
【作者單位】: 山東大學(xué);復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院上海市心血管研究所;復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院;
【關(guān)鍵詞】: DNA甲基化 MassARRAY定量分析法 普通亞硫酸鹽測序法 低甲基化基因序列
【分類號】:R542.22;R-332
【正文快照】: DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)的重要組成部分,組行心臟冠狀動脈左前降支結(jié)扎術(shù)制備心肌梗死DNA甲基化水平變化會影響靶基因的表達(dá)水模型。術(shù)后行心臟超聲檢查確定手術(shù)成功,常規(guī)平[1-2]。隨著DNA甲基化在生命科學(xué)研究中地飼養(yǎng)7d后,對兩組大鼠同時實施安樂死取材。實位的上升,在方法學(xué)
【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
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中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條
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2 梁家亮;誘導(dǎo)多能干細(xì)胞向內(nèi)皮細(xì)胞分化的調(diào)控機(jī)制及其對心肌梗死的治療作用研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2014年
3 劉彥卿;腎細(xì)胞癌中有機(jī)陽離子轉(zhuǎn)運體OCT2轉(zhuǎn)錄抑制機(jī)理研究—從表觀遺傳調(diào)控到化學(xué)治療[D];浙江大學(xué);2013年
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6 劉世宇;移植外源性MSCs持久恢復(fù)宿主MSCs功能的機(jī)制研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條
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2 胡淵;DRD5,,MNX1異常甲基化在2型糖尿病大血管并發(fā)癥診斷中的應(yīng)用研究[D];華中科技大學(xué);2013年
3 楊屏日;孕期血液指標(biāo)對新生兒出生體重的影響分析[D];浙江大學(xué);2013年
4 王佳;鯽魚Dmrt3基因的克隆和表達(dá)分析[D];浙江大學(xué);2014年
5 勞林江;宮內(nèi)宮外營養(yǎng)干預(yù)對成年期肺血管功能的影響及表觀調(diào)控機(jī)制探索[D];浙江大學(xué);2015年
【相似文獻(xiàn)】
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 江成彥;朱同林;;基于圖像特征的膠體金層析定量分析法[A];第五屆全國幾何設(shè)計與計算學(xué)術(shù)會議論文集[C];2011年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 馬守華;“定量分析法評價菱鎂制品抗反鹵研究”通過鑒定[N];中國建材報;2007年
本文編號:816219
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