細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)研究及生物信息學(xué)分析
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更多相關(guān)文章: 細(xì)粒棘球絳蟲 原頭蚴 蛋白組學(xué) 雙向電泳 MALDI-TOF-MS
【摘要】:目的在前期研究的基礎(chǔ)上,通過(guò)雙向電泳條件的優(yōu)化,對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)分析,進(jìn)一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)構(gòu)成和功能情況,尋找具有特異性的靶標(biāo)蛋白,為包蟲病的早期診斷、新藥開發(fā)、疫苗篩選,提供理論依據(jù)。 方法1.取寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院肝膽外科包蟲病人術(shù)后的包囊,經(jīng)無(wú)菌分離細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴。2.對(duì)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品并進(jìn)行雙向電泳分離,并對(duì)雙向電泳條件進(jìn)行優(yōu)化。3.選擇分離的蛋白點(diǎn)進(jìn)行MALDI-TOF/MS檢測(cè)得到肽指紋圖譜PMF。4.將PMF數(shù)據(jù)提交到互聯(lián)網(wǎng)中蛋白信息研究數(shù)據(jù)庫(kù)中,與已有的蛋白信息進(jìn)行匹配分析,初步鑒定出樣本中蛋白質(zhì),通過(guò)COGs(Clustersof Orthologous Groups of proteins)蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫(kù)、 GO (GeneOntology)蛋白質(zhì)功能分類數(shù)據(jù)庫(kù)、 KEGG pathway蛋白質(zhì)代謝通路數(shù)據(jù)庫(kù),分析這些蛋白的功能與性質(zhì)。5.利用免疫印跡的方法,用包蟲病人的血清識(shí)別原頭蚴抗原,,并進(jìn)行質(zhì)譜鑒定及生物信息學(xué)分析。 結(jié)果1.通過(guò)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品的雙向電泳分析,獲得了330個(gè)蛋白點(diǎn)。2.從雙向電泳凝膠上切下來(lái)的蛋白點(diǎn)通過(guò)MALDI-TOF MS質(zhì)譜檢測(cè),原頭蚴樣品中有157個(gè)蛋白點(diǎn)獲得了肽指紋圖譜(PMF)數(shù)據(jù)。3.初步鑒定了細(xì)粒棘球蚴原頭蚴中的部分蛋白點(diǎn),共有49個(gè)蛋白點(diǎn)。4.對(duì)鑒定得到的蛋白點(diǎn),我們進(jìn)行了生物信息學(xué)的初步分析,發(fā)現(xiàn)這些蛋白主要與細(xì)胞組成、新陳代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及物質(zhì)運(yùn)輸有關(guān)。5.對(duì)原頭蚴蛋白利用包蟲病人的血清對(duì)對(duì)原頭蚴蛋白進(jìn)行western blot的識(shí)別,成功識(shí)別了80個(gè)蛋白點(diǎn),并對(duì)這些蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,最后有28個(gè)蛋白點(diǎn)得到鑒定。 結(jié)論通過(guò)雙向電泳條件的優(yōu)化,成功建立了細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜;利用蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù),進(jìn)一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的構(gòu)成和功能情況,成功建立了細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)
【關(guān)鍵詞】:細(xì)粒棘球絳蟲 原頭蚴 蛋白組學(xué) 雙向電泳 MALDI-TOF-MS
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R383.33;R3411
【目錄】:
- 摘要4-6
- ABSTRACT6-10
- 前言10-14
- 第一部分 原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)分析14-44
- 材料與方法14-23
- 結(jié)果23-36
- 討論36-44
- 第二部分 包蟲病人抗血清對(duì)原頭蚴抗原的篩選44-58
- 材料與方法44-47
- 結(jié)果47-55
- 討論55-58
- 結(jié)論58-59
- 參考文獻(xiàn)59-64
- 文獻(xiàn)綜述64-70
- 綜述參考文獻(xiàn)68-70
- 致謝70-71
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文71-72
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷72
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