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細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)研究及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-08-30 02:06

  本文關(guān)鍵詞:細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)研究及生物信息學(xué)分析


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【摘要】:目的在前期研究的基礎(chǔ)上,通過(guò)雙向電泳條件的優(yōu)化,對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)分析,進(jìn)一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)構(gòu)成和功能情況,尋找具有特異性的靶標(biāo)蛋白,為包蟲病的早期診斷、新藥開發(fā)、疫苗篩選,提供理論依據(jù)。 方法1.取寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院肝膽外科包蟲病人術(shù)后的包囊,經(jīng)無(wú)菌分離細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴。2.對(duì)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品并進(jìn)行雙向電泳分離,并對(duì)雙向電泳條件進(jìn)行優(yōu)化。3.選擇分離的蛋白點(diǎn)進(jìn)行MALDI-TOF/MS檢測(cè)得到肽指紋圖譜PMF。4.將PMF數(shù)據(jù)提交到互聯(lián)網(wǎng)中蛋白信息研究數(shù)據(jù)庫(kù)中,與已有的蛋白信息進(jìn)行匹配分析,初步鑒定出樣本中蛋白質(zhì),通過(guò)COGs(Clustersof Orthologous Groups of proteins)蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫(kù)、 GO (GeneOntology)蛋白質(zhì)功能分類數(shù)據(jù)庫(kù)、 KEGG pathway蛋白質(zhì)代謝通路數(shù)據(jù)庫(kù),分析這些蛋白的功能與性質(zhì)。5.利用免疫印跡的方法,用包蟲病人的血清識(shí)別原頭蚴抗原,,并進(jìn)行質(zhì)譜鑒定及生物信息學(xué)分析。 結(jié)果1.通過(guò)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品的雙向電泳分析,獲得了330個(gè)蛋白點(diǎn)。2.從雙向電泳凝膠上切下來(lái)的蛋白點(diǎn)通過(guò)MALDI-TOF MS質(zhì)譜檢測(cè),原頭蚴樣品中有157個(gè)蛋白點(diǎn)獲得了肽指紋圖譜(PMF)數(shù)據(jù)。3.初步鑒定了細(xì)粒棘球蚴原頭蚴中的部分蛋白點(diǎn),共有49個(gè)蛋白點(diǎn)。4.對(duì)鑒定得到的蛋白點(diǎn),我們進(jìn)行了生物信息學(xué)的初步分析,發(fā)現(xiàn)這些蛋白主要與細(xì)胞組成、新陳代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及物質(zhì)運(yùn)輸有關(guān)。5.對(duì)原頭蚴蛋白利用包蟲病人的血清對(duì)對(duì)原頭蚴蛋白進(jìn)行western blot的識(shí)別,成功識(shí)別了80個(gè)蛋白點(diǎn),并對(duì)這些蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,最后有28個(gè)蛋白點(diǎn)得到鑒定。 結(jié)論通過(guò)雙向電泳條件的優(yōu)化,成功建立了細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜;利用蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù),進(jìn)一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的構(gòu)成和功能情況,成功建立了細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)
【關(guān)鍵詞】:細(xì)粒棘球絳蟲 原頭蚴 蛋白組學(xué) 雙向電泳 MALDI-TOF-MS
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R383.33;R3411
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • ABSTRACT6-10
  • 前言10-14
  • 第一部分 原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)分析14-44
  • 材料與方法14-23
  • 結(jié)果23-36
  • 討論36-44
  • 第二部分 包蟲病人抗血清對(duì)原頭蚴抗原的篩選44-58
  • 材料與方法44-47
  • 結(jié)果47-55
  • 討論55-58
  • 結(jié)論58-59
  • 參考文獻(xiàn)59-64
  • 文獻(xiàn)綜述64-70
  • 綜述參考文獻(xiàn)68-70
  • 致謝70-71
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文71-72
  • 個(gè)人簡(jiǎn)歷72

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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2 米曉云;石保新;張壯志;古努爾.吐爾遜;袁麗英;趙莉;王進(jìn)成;張文寶;張玲;阿依努爾;阿布里克木;阿不都;阿布利茲;;細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲——原頭蚴感染比格犬(Beagle)試驗(yàn)[A];第二屆全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

3 米曉云;袁麗英;張壯志;石保新;阿布都;阿依努爾;張玲;阿布里克木;王進(jìn)成;岳城;張文寶;;細(xì)粒棘球絳蟲——原頭蚴在兩種細(xì)胞培養(yǎng)液中體外培養(yǎng)[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會(huì)成立大會(huì)暨第一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

4 趙莉;張壯志;石保新;張旭;古努爾·吐爾遜;米曉云;吐爾洪·依米提;王進(jìn)成;馬正海;巫劍;張文寶;李國(guó)慶;;細(xì)粒棘球蚴原頭蚴-成蟲(PSC-AW)和原頭蚴-成囊(PSC-CW)抑制差減雜交文庫(kù)中差異表達(dá)基因的篩選及生物信息學(xué)分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2011年

5 石保新;張壯志;王進(jìn)成;李欣;雒燕;張文寶;;愛普銳克-食肉動(dòng)物自動(dòng)吞食片對(duì)犬細(xì)粒棘球絳蟲驅(qū)除試驗(yàn)[A];第二屆全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

6 袁麗英;米曉云;石保新;張壯志;古努爾·吐爾遜;張文寶;張玲;阿依努爾;阿布里克木;阿不都;阿布利茲;;細(xì)粒棘球絳蟲幼蟲——原頭蚴感染比格犬(Beagle)試驗(yàn)[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會(huì)成立大會(huì)暨第一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

7 石保新;巫劍;米曉云;古努爾·吐爾遜;張壯志;張文寶;岳城;;犬腸系膜淋巴結(jié)免疫組化反應(yīng)的探索[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

8 張文寶;李軍;由弘;張壯志;古努爾·吐爾遜;AlexLoukasa;DonaldP.McManusa;;表達(dá)細(xì)粒棘球絳蟲成蟲不同發(fā)育階段的基因家族[A];全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年

9 丁劍冰;魏曉麗;馬秀敏;林仁勇;王儼;張靜萍;溫浩;;Eg95基因疫苗對(duì)繼發(fā)性細(xì)粒棘球蚴感染小鼠的免疫保護(hù)作用研究[A];2005全國(guó)第二屆核酸疫苗研討會(huì)論文集[C];2005年

10 張文寶;李軍;由弘;張壯志;古努爾·吐爾遜;ALEXLOUKAS;ANDDONALDP.MCMANUS;;對(duì)中國(guó)新疆細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段Eg95重組抗原進(jìn)行表達(dá)[A];全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年

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6 本報(bào)記者 陳璞;田鼠絕對(duì)不應(yīng)上餐桌[N];大眾科技報(bào);2007年

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8 記者 張穎 伊潔;農(nóng)林大學(xué)學(xué)生喜獲“挑戰(zhàn)杯”特等獎(jiǎng)[N];福建日?qǐng)?bào);2005年

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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5 鄒曉毅;高強(qiáng)度聚焦超聲波殺傷細(xì)粒棘球絳蟲棘球蚴的研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2009年

6 馬秀敏;新疆細(xì)粒棘球絳蟲基因多態(tài)性及實(shí)驗(yàn)診斷學(xué)研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2007年

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1 李君良;細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)研究及生物信息學(xué)分析[D];寧夏醫(yī)科大學(xué);2013年

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5 朱明星;細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴mRNA測(cè)序及生物信息學(xué)分析[D];寧夏醫(yī)科大學(xué);2013年

6 巨艷;細(xì)粒棘球絳蟲原頭蚴mRNA測(cè)序及表達(dá)譜分析[D];寧夏醫(yī)科大學(xué);2013年

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本文編號(hào):756650

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