本文關(guān)鍵詞：基于全局角度網(wǎng)絡(luò)策略的復雜疾病風險通路識別

  更多相關(guān)文章： 風險通路 蛋白質(zhì)-通路網(wǎng) 蛋白質(zhì)互作 隨機游走

【摘要】：復雜疾病的發(fā)生發(fā)展與機體內(nèi)生物學通路的功能紊亂有密切聯(lián)系,從高通量數(shù)據(jù)出發(fā),利用計算機輔助方法來研究疾病與通路間的關(guān)系具有重要意義.本文提出了一個新的基于網(wǎng)絡(luò)的全局性通路識別方法.該方法利用蛋白質(zhì)互作信息和通路的基因集組成信息構(gòu)建復雜的蛋白質(zhì)-通路網(wǎng).然后,基于表達譜數(shù)據(jù),通過隨機游走算法從全局層面優(yōu)化疾病風險通路.最終,通過擾動方式識別統(tǒng)計學顯著的風險通路.將該網(wǎng)絡(luò)運用于結(jié)腸直腸癌風險通路識別,識別出15個與結(jié)腸直腸癌發(fā)生與發(fā)展過程顯著相關(guān)的通路.通過與其他通路識別方法(超幾何檢驗,SPIA)相比較,該方法能夠更有效識別出疾病相關(guān)的風險通路.
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學生物信息科學與技術(shù)學院;
【關(guān)鍵詞】： 風險通路 蛋白質(zhì)-通路網(wǎng) 蛋白質(zhì)互作 隨機游走
【基金】：國家自然科學基金(31200996) 黑龍江省教育廳項目(12531295) 哈爾濱醫(yī)科大學于維漢院士杰出青年培養(yǎng)基金資助~~
【分類號】：R363
【正文快照】： 復雜疾病的發(fā)病機理被認為是來自于多基因變異的聯(lián)合效應[1],疾病的發(fā)生和發(fā)展與生物通路功能紊亂有密切聯(lián)系[2],此外藥物治療中也涉及代謝通路的局部改變[3].隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,產(chǎn)生了海量的生物學數(shù)據(jù).因此,從高通量數(shù)據(jù)出發(fā),利用生物信息學方法挖掘與疾病發(fā)生機制相關(guān)的

【共引文獻】

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【相似文獻】

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本文編號：560197