共生菌對荷瘤小鼠肺泡巨噬細胞基因表達的調(diào)控作用
發(fā)布時間:2024-02-04 17:05
目的探討共生菌群對荷瘤小鼠肺泡巨噬細胞(AM)基因表達的調(diào)控作用。方法分離純化共生菌缺失的荷瘤小鼠及共生菌正常的荷瘤小鼠AM,利用基因芯片技術(shù)篩選差異表達的基因并進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果分選后的AM細胞純度可達98%,共生菌缺失荷瘤小鼠與正常荷瘤小鼠相比較,AM細胞中差異性表達基因共有353個(變化倍數(shù)≥2),上調(diào)基因171個,下調(diào)基因182個;差異表達基因的基因分類(GO)主要為細胞凋亡、細胞增殖、細胞分化、信號傳導(dǎo)、血管生成等;KEGG通路主要為氮素代謝、趨化因子信號、TGF-β信號及腫瘤通路等;M2型巨噬細胞特異性基因CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等在共生菌缺失荷瘤小鼠AM細胞中表達上調(diào)。結(jié)論共生菌可以調(diào)控荷瘤小鼠AM細胞的基因表達,包括CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等基因,差異表達基因與多個GO分類和KEGG通路密切相關(guān)。
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本文編號:3895562
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圖1共生菌缺失對荷瘤小鼠肺泡巨噬細胞基因表達的影響注:WT+LLC為共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC為共生菌缺失的荷瘤小鼠
圖2共生菌缺失荷瘤小鼠肺泡巨噬細胞差異表達基因的功能分析
血管生成、分泌、細胞分化、細胞增殖、對刺激的反應(yīng)性、運動、信號、多器官過程及免疫系統(tǒng)過程等(圖2A、圖2B)。KEGG通路分析結(jié)果表明,共生菌缺失后荷瘤小鼠肺泡巨噬細胞差異性表達基因主要與氮素代謝、趨化因子信號通路、TGF-β信號通路、腫瘤通路、細胞因子-細胞因子受體相互作用等信....
圖3肺泡巨噬細胞中M1和M2型巨噬細胞特異性基因的表達情況注:WT+LLC為共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC為共生菌缺失的荷瘤小鼠
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