目的分析Ⅰ型脊髓灰質(zhì)炎病毒(簡(jiǎn)稱(chēng)脊灰病毒)基因密碼子使用偏好性。方法從NCBI基因數(shù)據(jù)庫(kù)(GenBank)檢索并篩選出40條Ⅰ型脊灰病毒株的基因信息,計(jì)算其相對(duì)同義密碼子使用度(RSCU)值、有效密碼子數(shù)(ENc)值。將Ⅰ型脊灰病毒基因中堿基C和G位于第三位的密碼子占所有密碼子的百分比[(C+G)₃%]與ENc值進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析,繪制散點(diǎn)圖,并與(C+G)₃%標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比較。采用主成分分析法對(duì)Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子的RSCU值進(jìn)行分析,并利用分析獲得的主因子繪制散點(diǎn)圖,觀察不同時(shí)間和地域的Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子使用偏好性。結(jié)果Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子AGA、AGG、CCA、UCA和GUG的RSCU值均≥1.5,密碼子GCG、CGA、CGG、CGC、UCG和ACG的RSCU值均≤0.5。Ⅰ型脊灰病毒的ENc平均值為53.633。40株Ⅰ型脊灰病毒毒株均位于(C+G)₃%標(biāo)準(zhǔn)曲線以下。2009年之前分離出來(lái)的毒株均位于圖的下方,2009年之后分離于不同國(guó)家或地區(qū)的毒株分別聚集于圖的一處。結(jié)論Ⅰ型脊灰病毒在AGA、AGG、CCA...

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【文章目錄】：
1
    材料與方法 1.1
    Ⅰ型脊灰病毒毒株基因信息的獲取 1.2
    Ⅰ型脊灰病毒基因相對(duì)同義密碼子使用度
    (RSCU)
    值的計(jì)算 1.3
    Ⅰ型脊灰病毒基因有效密碼子數(shù)
    (ENc)
    計(jì)算 1.4
    Ⅰ型脊灰病毒ENc與
    (C+G)
    3%關(guān)聯(lián)性分析 1.5
    不同時(shí)間和地域的Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子使用偏好性分析 2
    結(jié)果 2.1
    Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子RSCU值 2.2
    Ⅰ型脊灰病毒ENc值 2.3
    Ⅰ型脊灰病毒ENc與
    (C+G)
    3%關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果 2.4
    不同時(shí)間和地域的Ⅰ型脊灰病毒基因密碼子使用偏好性分析結(jié)果 3
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