【摘要】： 目的:對中國漢族2個巴比二氏綜合癥(Bardet Biedl Syndrome,BBS)遺傳性疾病家系進(jìn)行遺傳連鎖分析及基因測序,篩選鑒定新致病基因位點和/或新致病基因及鑒定已知基因的新突變,以確認(rèn)致病基因并闡明致病機(jī)理。 方法:1.采集中國漢族2個巴比二氏綜合癥遺傳性疾病家系的臨床資料和血樣標(biāo)本,提取血樣標(biāo)本中DNA,建立病人的臨床信息數(shù)據(jù)庫。2.針對巴比二氏綜合癥遺傳性疾病的已知基因,設(shè)計引物進(jìn)行測序,排除或定位于已知基因。應(yīng)用遺傳連鎖方法,選擇已知位點及已知基因物理位置附近的STR(short tandom repeat markers)標(biāo)記物進(jìn)行已知基因及已知位點的篩查。3.對是已知位點和基因的家系的陽性位點附近有連鎖的,在其附近進(jìn)行進(jìn)一步的遺傳間距更近的遺傳連鎖分析;對排除已知位點及基因的家系,用382個STR標(biāo)記物(ABI PRISM Linkage Mapping Sets V2.5-MD ),PCR擴(kuò)增其片段,采用ABI3100遺傳分析儀進(jìn)行全基因組的掃描。4.用國際公認(rèn)的遺傳連鎖分析方法,根據(jù)等位基因(單倍體)分型結(jié)果,應(yīng)用兩點法,分別計算STR標(biāo)記物的LOD值(Lod Score值,表明疾病基因與該位點連鎖的緊密性大小),以最大LOD值確定陽性位點。5.在陽性位點附近,根據(jù)熒光標(biāo)記的STR(single nucleotide polymophism)基因型檢測結(jié)果,進(jìn)行更精細(xì)定位,確定疾病基因的最小遺傳間距MGI(Minimum Genetic Interval)。在MGI內(nèi),通過候選基因法篩選其致病基因及突變。 結(jié)果:1.建立了中國漢族巴比二氏綜合癥遺傳性疾病家系的臨床及臨床信息數(shù)據(jù)庫。2.完成了對1個巴比二氏綜合癥(Bardet-Biedl Syndrome, BBS)疾病家系是已知基因BBS7的連鎖定位和測序,發(fā)現(xiàn)其是已知基因的新突變,為BBS致病機(jī)制的進(jìn)一步闡明提供了依據(jù)。3.完成對1個BBS遺傳性疾病家系是已知基因BBS5的連鎖定位,測序工作目前正在進(jìn)行中。4.本課題研究的結(jié)論,對于該領(lǐng)域的研究具有重要的學(xué)術(shù)價值,為以后的基因篩查、基因診斷和基因治療都起到了很大的作用。 結(jié)論:1.我們收集了2個中國漢族巴比二氏綜合癥遺傳性疾病家系的臨床資料,豐富了神經(jīng)系統(tǒng)遺傳性疾病的遺傳資源信息。2.發(fā)現(xiàn)了中國漢族1個已知基因BBS7的新突變。
[Abstract]:Objective: to study the genetic linkage analysis and gene sequencing of two families with Bardet Biedl Syndrome,BBS in Chinese Han nationality, and to identify new pathogenic gene loci and / or new pathogenicity genes and identify new mutations of known genes. In order to identify the pathogenic gene and clarify the pathogenesis. Method 1: 1. The clinical data and blood samples of 2 families with Barbiz syndrome in Chinese Han nationality were collected and DNA, was extracted from the blood samples to establish the clinical information database of patients. A primer was designed to sequence the known genes of Barbiz syndrome and to exclude or localize the known genes. Genetic linkage method was used to screen known genes and known loci by selecting STR (short tandom repeat markers) markers near known sites and physical locations of known genes. If there is a linkage near the positive locus of a family with known loci and genes, further genetic linkage analysis closer to the genetic distance is carried out; for families excluding known loci and genes, The fragments were amplified by using 382 STR markers (ABI PRISM Linkage Mapping Sets V2.5-MD), and the whole genome was scanned by ABI3100 genetic analyzer. According to the results of allelic (haploid) genotyping, the LOD (Lod Score values of STR markers were calculated by using the internationally recognized genetic linkage analysis method. This indicates that the disease gene is closely linked to the locus) and the maximum LOD value is used to determine the positive locus. In the vicinity of the positive loci, according to the results of STR (single nucleotide polymophism) genotypes detected with fluorescent markers, more precise mapping was carried out to determine the minimum genetic spacing of disease genes MGI (Minimum Genetic Interval). In MGI, the pathogenic genes and mutations were screened by candidate gene method. The result is 1: 1. The clinical and clinical information database. 2. 2. The linkage mapping and sequencing of a known gene BBS7 in a family of Bardet-Biedl Syndrome, BBS) disease was completed. It was found that it was a new mutation of known gene, which provided a basis for further elucidation of the pathogenesis of BBS. A pedigree with BBS hereditary diseases was linked to a known gene, BBS5, and the sequencing work was under way. 4. 4. The conclusion of this research has important academic value for the research in this field, and plays a great role in gene screening, gene diagnosis and gene therapy in the future. Conclusion 1. We collected the clinical data of 2 families with Barbiz syndrome in Chinese Han nationality, which enriched the genetic resource information of genetic diseases of the nervous system. A new mutation of a known gene BBS7 was found in Chinese Han nationality.
【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2008
【分類號】：R394.112

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本文編號：2254352